| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2468032 = | 51 (0.870) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.7% | coding (205/264 nt) | PP_2161 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2468079 = | 50 (0.880) | coding (158/264 nt) | PP_2161 | hypothetical protein | |||||
CCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCTTCTTCCGAAAGCGGTA > NC_002947/2467884‑2468175 | cccGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCggg < 6:125740/149‑1 (MQ=255)cccGTATCCCCCCCCCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGGTGGTCCGGCAGTAATACTGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCggg < 4:200420/149‑1 (MQ=255) gTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCCCTACCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCggg < 1:115628/149‑1 (MQ=255) gTATCGCAGCACCGGGCCGAGCAGCCCGGATAACAACCGGCGGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGggtg < 4:219768/149‑1 (MQ=255) gaattgcaagagcgcctgaacagcttgcgcgagcaactggaccgcaacgtgccgctttcggaagaagagctggccgccctgcacgaagaggcgcgccagatcgaggcgcaactgaaacttgaggaagccacgccagacaacaacctggt > 3:251806‑M1/147‑149 (MQ=255) cGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTTCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCACCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGaa < 4:324804/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGaa < 1:18286/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGaa < 7:35146/149‑1 (MQ=255) cGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGCGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCt > 2:105718/1‑149 (MQ=255) cGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGATCGATTGc > 3:18656/1‑147 (MQ=255) ggATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACCGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAg < 3:34178/149‑1 (MQ=255) aaCAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGtt > 3:126857/1‑148 (MQ=255) cAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGaa > 2:172895/1‑128 (MQ=255) cAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGaa < 1:172895/128‑1 (MQ=255) aaaCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg < 4:96434/113‑1 (MQ=255) aaaCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg > 3:96434/1‑113 (MQ=255) aaaCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTc > 6:85681/1‑124 (MQ=255) aaaCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTc < 5:85681/124‑1 (MQ=255) aCGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGcc > 6:376834/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCg < 6:147563/149‑1 (MQ=255) tGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTcca > 6:323203/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCAGTAATACCGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTccacc < 6:79675/149‑1 (MQ=255) gTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTccacc < 6:84989/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCAc < 5:344282/137‑1 (MQ=255) ccGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCAc > 6:344282/1‑137 (MQ=255) cGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAgg < 3:87164/149‑1 (MQ=255) gCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGgtt > 6:216378/1‑149 (MQ=255) acgtaccgctttcggaagaagagctggccgccctgcacgaagaggcgcgccagatcgaggcgcaactgaaacttgaggaagccacgccagacaacaacctGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAg > 6:247716‑M1/101‑149 (MQ=255) cAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGgttg < 4:126857/149‑1 (MQ=255) aGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGcc > 3:230001/1‑135 (MQ=255) aGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGcc < 4:230001/135‑1 (MQ=255) tAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg < 7:285178/95‑1 (MQ=255) tAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCgggg > 8:285178/1‑95 (MQ=255) cAGGGGGCCGCTTTGCGGCGC‑‑‑CGGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTg < 7:276388/148‑1 (MQ=255) cAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTg < 1:610/148‑1 (MQ=255) ggaagaagagctggccgccctgcacgaagaggcgcgccagatcgaggcgcaactgaaacttgaggaagccacgccagacaacaacctGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAgg < 5:315998‑M1/50‑1 (MQ=255) ggaagaagagctggccgccctgcacgaagaggcgcgccagatcgaggcgcaactgaaacttgaggaagccacgccagacaacaacctGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAgg > 6:315998‑M1/88‑137 (MQ=255) gCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCtt > 3:187053/1‑148 (MQ=255) cTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTcc < 6:22949/149‑1 (MQ=255) tttGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCt > 5:166310/1‑149 (MQ=255) cc‑‑‑ccGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGttt > 4:23851/1‑148 (MQ=255) ttCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGcc > 1:318260/1‑149 (MQ=255) cccATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCGGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGt < 6:296898/116‑1 (MQ=255) cccATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGt > 5:296898/1‑116 (MQ=255) cATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgc > 5:181268/1‑149 (MQ=255) cATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgc > 4:159472/1‑149 (MQ=255) tGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgcgc < 3:23851/149‑1 (MQ=255) cTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgcgcgc < 5:376834/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCTCGcc > 8:71420/1‑149 (MQ=255) gCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCTCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACGAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCg > 4:138209/1‑149 (MQ=255) ttGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAg < 5:323203/149‑1 (MQ=255) ggCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAggg > 8:22551/1‑149 (MQ=255) tgcGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTg > 2:190117/1‑121 (MQ=255) tgcGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTg < 1:190117/121‑1 (MQ=255) tgcGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgc > 6:95804/1‑123 (MQ=255) tgcGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGgc < 5:95804/123‑1 (MQ=255) cgcAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGct < 1:105718/148‑1 (MQ=255) gcAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGctct > 1:309444/1‑149 (MQ=255) aGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAgg > 4:243907/1‑135 (MQ=255) aGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAgg < 3:243907/135‑1 (MQ=255) gTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCttcttc < 6:363160/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCTTCTTcc < 6:353087/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCTTCTTcc > 5:43604/1‑149 (MQ=255) gTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCTTCTTCCGAAAGCGGTa > 5:212140/1‑149 (MQ=255) | CCCGTATCGCAGCACCGGGCCGATCAGCCCGGATAACAAACGGCTGGTCCGGCAGTAATACAGGGGGCCGCTTTGCGGCCC‑‑‑CCGCTATTTCAGATCCCCATGCTGTGCAGCGAGTTGGCAATGCTGCGCAGGGTGGCAGTGAGGTCGGGGTGGTCGGCCTCGAAGCGCTCGATTGCCAGGTTCACGCCGTCCACCAGGTTGTTGTCTGGCGTGGCTTCCTCAAGTTTCAGTTGCGCCTCGATCTGGCGCGCCTCTTCGTGCAGGGCGGCCAGCTCTTCTTCCGAAAGCGGTA > NC_002947/2467884‑2468175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |