| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4260580 | 56 (0.950) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.2% | coding (2182/2460 nt) | PP_3734 | ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 4260613 | 56 (1.000) | coding (2149/2460 nt) | PP_3734 | ABC transporter permease | |||||
ACATACAGCGGTAAACGCCAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGTTGAA > NC_002947/4260435‑4260727 | acaTACAGCGGTAAACGCCAGCCGAAGGCCTGGACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCAt > 2:123075/1‑149 (MQ=255) cAGCGGTAAACGCCAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATgcgc < 1:265045/148‑1 (MQ=255) gCGGTAAACGCCAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGcgccg > 6:351849/1‑148 (MQ=255) aaCGCCAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCAcccc > 5:184354/1‑148 (MQ=255) cAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGCCCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGc > 6:102126/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGccc < 5:142156/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGc > 6:193802/1‑149 (MQ=255) ccTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGt < 3:246124/149‑1 (MQ=255) ccTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGt < 2:338527/149‑1 (MQ=255) gacGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCc > 1:123075‑M2/2‑147 (MQ=255) cACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGgcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatg < 4:61507‑M1/147‑34 (MQ=255) cACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGCGCc < 8:67343‑M2/148‑2 (MQ=255) cACGATCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCc < 8:225652‑M2/148‑2 (MQ=255) gTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCcaact < 1:138476‑M2/149‑6 (MQ=255) caccacTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGGAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCcaactgg > 2:334443‑M2/1‑141 (MQ=255) accacTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGc < 5:351849/148‑1 (MQ=255) ccacTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGTAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGgcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtct < 1:110152‑M1/149‑44 (MQ=255) acTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGgcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctgg < 3:183257‑M1/149‑46 (MQ=255) gACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGTcgcg > 3:116082/1‑149 (MQ=255) accaggcaccaggcCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCgcgc < 5:193802/149‑1 (MQ=255) accagccaccaggcCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCgcgc < 6:157587/149‑1 (MQ=255) aggcCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACCGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAgg > 3:84466/1‑149 (MQ=255) aggcCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGc > 6:142430/1‑134 (MQ=255) aggcCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGc < 5:142430/134‑1 (MQ=255) aggcCAGCAACACCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAgg < 4:40791/149‑1 (MQ=255) aaCAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTcagcag > 2:97686/1‑149 (MQ=255) cAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGt < 6:184354/149‑1 (MQ=255) gCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTtg < 2:138476/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTtgat > 1:136195/1‑149 (MQ=255) ccAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGACTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTtgat > 3:280243/1‑149 (MQ=255) gAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGaacaac < 3:33247/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAggg > 3:109790/1‑124 (MQ=255) gCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAggg < 4:109790/124‑1 (MQ=255) ccAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCcaca > 2:41606/1‑149 (MQ=255) tACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAACGCAGACCAGTTGCATGCGCCCCACCCCCAGTGCCCACACCGGTGCCAACTGCCCAAGCCGCGCATGGCCCAGGGACACCAGGTTGATGAACAACGCCCAACCGGcc > 1:256544/1‑149 (MQ=255) ggTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGAGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGc > 4:72598/1‑149 (MQ=255) gTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAg < 4:178987/77‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAg < 4:184810/77‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAg > 3:178987/1‑77 (MQ=255) gTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAg > 3:184810/1‑77 (MQ=255) tGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTAAAC‑AAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCACCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCAACCCCGGCCACGcc > 8:169004/1‑148 (MQ=255) aaGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAg < 7:225652/149‑1 (MQ=255) aGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGTCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAgg < 4:116082/147‑1 (MQ=255) aGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGCGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGGCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAgg < 7:67343/147‑1 (MQ=255) gCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTACATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTg > 7:192981/1‑149 (MQ=255) aTGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACGCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGtt < 7:320126/149‑1 (MQ=255) aGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCACTTGCATGCGCCGCTCCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCATCTTGCGGAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGACACACCGGCCAAACCAAGGGTAAGGCTGTTga < 7:1174/148‑1 (MQ=255) tGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGc > 6:263500/1‑149 (MQ=255) ccccAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCgg > 4:217064/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCACAGTGCCCACAGCGGTGCCAACAGCCCCAGCCGCGCCTGGCCCACGCTCAGCAGGTTCATGAACAACGCCACACCGGCAACGCCAAGGCTAAGGCTGTAGAGAGCTGCGGTg > 3:350149/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACACCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTg > 1:273303/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATCCGCCGCCCCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTg > 2:21650/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGtt < 1:199939/135‑1 (MQ=255) cAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGtt > 2:199939/1‑135 (MQ=255) cAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTgg > 3:295460/1‑149 (MQ=255) aaC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTga > 8:986/1‑130 (MQ=255) aaC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTga < 7:986/130‑1 (MQ=255) c‑cagaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagt < 3:183257‑M2/149‑105 (MQ=255) c‑cagaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAgg > 6:9278/1‑149 (MQ=255) c‑cagaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCACTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAgg < 4:280243/149‑1 (MQ=255) agaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattacgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtgg < 1:110152‑M2/149‑107 (MQ=255) agaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGc < 7:150933/94‑1 (MQ=255) agaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGc > 8:150933/1‑94 (MQ=255) agaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTg > 6:375488/1‑132 (MQ=255) agaccagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTg < 5:375488/132‑1 (MQ=255) accagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCg > 3:142097/1‑149 (MQ=255) ccagTTGgcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactcctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtggtg > 2:334443‑M1/1‑7 (MQ=255) cagTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGt < 4:84466/149‑1 (MQ=255) agTTGgcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtggtgaac < 1:138476‑M1/149‑145 (MQ=255) agTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGtt < 3:72598/149‑1 (MQ=255) gTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGTTg < 4:142097/149‑1 (MQ=255) gTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGCTTg < 3:217064/149‑1 (MQ=255) ggcgccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtggtgaacgtg < 8:67343‑M1/148‑148 (MQ=255) ggcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtggtgatcgtg < 8:225652‑M1/148‑148 (MQ=255) ggcaccgctgtgggcactgggggtgcggcgcatgcaactggtctggttgagcctggggcagacactcatgctcagcggcttcaccgtactgctggcgattccgcttgggctgttgctggcctggtgcctggtcgcagtggtgaacgtc > 1:123075‑M1/1‑1 (MQ=255) gCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGTTGaa < 5:102126/148‑1 (MQ=255) gCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGTTGaa < 5:148833/148‑1 (MQ=255) | ACATACAGCGGTAAACGCCAGCCGAAGGCCTGCACGTTCACCACTGCGACCAGGCACCAGGCCAGCAACAGCCCAAGCGGAATCGCCAGCAGTACGGTGAAGCCGCTGAGCATGAGTGTCTGCCCCAGGCTCAAC‑CAGACCAGTTGCATGCGCCGCACCCCCAGTGCCCACAGCGGTGCCAACTGGCCCAGCCGCGCCTGGCCCAGGGTCAGCAGGTTGATGAACAACGCCACACCGGCCACGCCAAGGGTAAGGCTGTTGAGAGCTGCGGTGGCGGCAAAGGTGCGGTTGAA > NC_002947/4260435‑4260727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |