New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5306311 = | 60 (1.020) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.9% | coding (941/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
? | NC_002947 | 5306387 = | 41 (0.750) | coding (865/3483 nt) | recC | multifunctional ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease/ssDNA endonuclease recombinase subunit |
GTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTAC > NC_002947/5306163‑5306459 | gtcgtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTg > 8:139548/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTg > 4:146438/1‑149 (MQ=255) tcgtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGc < 7:139548/149‑1 (MQ=255) tcgtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGc > 5:124471/1‑149 (MQ=255) tcctcCTGCAGATCGTTGAGCAGCGTGGAGGGCGACCCGTCGCTGAACAGGACGATGCGCCCCTCGCTGAACACGCACTCGAAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGGTTACCCCAGGCTg > 6:326563/4‑148 (MQ=255) cgtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGc > 8:100223/1‑148 (MQ=255) tatctcttcgctgccggcccaggccctggaagcactggcaggcctgtcgcgtttcagtcaggtattgctgtgcgtacacaacccatgccgccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGc < 2:64808‑M1/2‑1 (MQ=255) gtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGc > 1:197879/1‑147 (MQ=255) gtcCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCa < 6:124471/149‑1 (MQ=255) tcttcgctgccggcccaggccctggaagcactggcaggcctgtcgcgtttcagtcaggtattgctgtgcgtacacaacccatgccgccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGCCAGc < 5:1469‑M1/6‑1 (MQ=255) tGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCGAGCaa > 5:365317/1‑149 (MQ=255) ttcgctgccggcccaggccctggaagcactggcaggcctgtcgcgtttcagtcaggtattgctgtgcgtacacaacccatgccgccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGCCAg > 8:13562‑M1/141‑145 (MQ=255) cGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCTGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCGAGCAACGGGTgg < 6:365317/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGACGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTgg < 2:274273/148‑1 (MQ=255) gAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCAt > 7:125461/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGGGCGAACCGTCTCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGGCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCTGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGt < 6:162556/149‑1 (MQ=255) ggtggGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCa < 3:47952/149‑1 (MQ=255) gtggGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCa < 8:111002/148‑1 (MQ=255) tggGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAg > 1:11303/1‑148 (MQ=255) tggGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGGTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAg < 2:11303/148‑1 (MQ=255) gAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTg > 8:321352/1‑149 (MQ=255) ccGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGgtc < 4:317723/149‑1 (MQ=255) tCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGgtcgtc < 7:100223/149‑1 (MQ=255) tGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAg > 2:154143/1‑148 (MQ=255) aaCAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAg < 1:154143/146‑1 (MQ=255) ggTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAgg < 2:348531/149‑1 (MQ=255) gTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAGCGGGTGGGCATGCTGGTGGAGCGTCTGGGCGTCCAGTTGCgggg > 4:91248/1‑149 (MQ=255) gTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTgg < 5:65851/133‑1 (MQ=255) gTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTgg > 6:65851/1‑133 (MQ=255) gTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAggg > 8:194953/1‑149 (MQ=255) ccGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTACTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCcttg < 7:194953/149‑1 (MQ=255) gCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCttgcttgc < 2:197879/149‑1 (MQ=255) attgctgtgcgtacacaacccatgccgccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCcttgcttg < 4:349379‑M1/66‑1 (MQ=255) cTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGCAAGTGTTTACCCCAGGCTTCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTATGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCcttgctttc > 1:110383/1‑147 (MQ=255) aaCACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGt < 2:116937/147‑1 (MQ=255) acacGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGCCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGc > 5:227524/1‑149 (MQ=255) cacGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCt < 8:125461/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGc < 7:96262/149‑1 (MQ=255) cgtacacaacccatgccgccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTg > 3:349379‑M1/75‑148 (MQ=255) ccTGGTAGCTGCCTGTGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGc < 6:285683/143‑1 (MQ=255) ccTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGc > 5:285683/1‑143 (MQ=255) ccTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGt > 7:191788/1‑149 (MQ=255) ggTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTg > 1:161330/1‑149 (MQ=255) ggTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTACAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCctt < 8:189832/129‑1 (MQ=255) acaacccatgcctccaccactgggccgatatcgttgccgacaaggacctgttgcgccaccagtacaaacGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGttt > 1:126934‑M1/70‑149 (MQ=255) gTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGGGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGttt < 3:146438/147‑1 (MQ=255) cTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCttgcttgc < 4:246385/130‑1 (MQ=255) cTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCttgcttgc > 3:246385/1‑130 (MQ=255) tgtgatcatcGGTGTCGAGCATGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCTACGGGTGCGCATGGTGGTGCAGCGTCTGTTGGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTTgcgc < 5:326563/145‑1 (MQ=255) ggTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGgcg > 7:98671/1‑148 (MQ=255) tcatcaTAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCaa < 7:321352/149‑1 (MQ=255) tcatcaTAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCaa < 8:98671/149‑1 (MQ=255) atcatAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCaa > 1:65816/1‑147 (MQ=255) catAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCGGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCGTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTAGTGGTGGCGCagccgg > 6:243826/1‑144 (MQ=255) tAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CGTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCCGGCGTGGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACGGGTGGCGCAGCAGGTc > 8:188031/1‑149 (MQ=255) aGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTcc > 5:201863/1‑149 (MQ=255) aGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTcc > 5:196845/1‑149 (MQ=255) tGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTg > 7:107690/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCt > 4:14940/1‑113 (MQ=255) gAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCt < 3:14940/113‑1 (MQ=255) cAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCaa < 3:126986/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGc > 1:182868/1‑149 (MQ=255) gcgGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAgt > 1:133931/1‑149 (MQ=255) cgGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAgtg > 1:128681/1‑149 (MQ=255) gTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCCTGCCTGGCTTGCGTCGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCTACGATATCGGCCCAGTGGTggc < 5:71097/147‑1 (MQ=255) ttACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTGGCTGGCGTGTGTACTGGTGGCGCACGAGGTGCTTGTCGGCGCCGATATCGGGCCAGTGGTGGCGGCa > 4:236471/1‑149 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGTTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGTGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATggg < 2:133931/149‑1 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCg < 3:258060/116‑1 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCg > 4:258060/1‑116 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGtggtgg < 8:149896/140‑1 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGtggtgg > 7:149896/1‑140 (MQ=255) cccAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATggg < 2:128681/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGtt < 8:107690/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCGGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTCGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTCTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGtt < 5:243826/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTa > 1:64808/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCAACGGGAGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATACCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGAGATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTa > 1:185630/1‑149 (MQ=255) GCCAGCAACCGGGGGGCATGCCGGGGCCGCGGCTGGGCGCCCAGTTGCAGCGGCATGCCTGGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGGCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTAc > 5:373658‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTCGTCCTGCAGTTCGTTGAGCAGCGTGGTGGGCGAACCGTCGCTGAACAGGTCGATGCGGCCGTCGCTGAACACGCCCTGGTAGCTGCCTGGGTCATCATAGCTGTCGAGCAGGTTGATGTAGTCGCGGC‑CTTGTTTACCCCAGGCTGCCAGCAACGGGTGGGCATGCTGGTGCAGCGTCTGGTCGTCCAGTTGCAGGGGCATGCCTTGCTTGCGTTGCTGGCGTTTGTACTGGTGGCGCAACAGGTCCTTGTCGGCAACGATATCGGCCCAGTGGTGGCGGCATGGGTTGTGTAC > NC_002947/5306163‑5306459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |