New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5518943 | 69 (1.170) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.0% | coding (787/789 nt) | PP_4852 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 5519011 | 58 (1.020) | coding (719/789 nt) | PP_4852 | AraC family transcriptional regulator |
CTGCTGCGCGGTATTGGCAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATGGCA > NC_002947/5518797‑5519091 | ctgctgCGCGGTATTGGCAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAg < 5:349339/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCTTGGCAGGTAAACCTTGGGCACTGACCACCACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGcccc < 8:145142/148‑1 (MQ=255) ggTATTGGTAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTcc > 4:53452/1‑149 (MQ=255) ggTATTGGTAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTcc > 2:189986/1‑149 (MQ=255) gCAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTg > 4:73117/1‑149 (MQ=255) gCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCcg > 6:273452/1‑149 (MQ=255) cGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCcgg > 1:236828/1‑149 (MQ=255) gAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCcggc > 8:37790/1‑149 (MQ=255) aaCCTTTGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCGAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCcggcgg < 6:332152/149‑1 (MQ=255) ccTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTa < 7:227533/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAtcgccatgttccagcgccaggcccggtg > 1:1885‑M1/1‑121 (MQ=255) gCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTc < 6:339871/149‑1 (MQ=255) aCTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCTCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg < 7:37790/149‑1 (MQ=255) aCTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg < 6:156864/149‑1 (MQ=255) aCTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg < 5:273452/149‑1 (MQ=255) aCTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg > 1:339533/1‑149 (MQ=255) tGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAtcgccatgttccagcgccaggcccggtgtacgccc > 3:282293‑M1/1‑112 (MQ=255) tGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg < 6:90112/147‑1 (MQ=255) tGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCgg > 5:90112/1‑147 (MQ=255) tGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGc > 5:73062/1‑149 (MQ=255) tGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGc > 7:8338/1‑149 (MQ=255) aacaCCGCCAGCGCCAGTCACGGGATTTTCAGCACTTTCATGCAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGAGGCACGGTGAGCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCTTCCGCGCCTGACGGCGGTACTGCTCGGGAGTaca > 5:203135/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCgg < 2:236828/149‑1 (MQ=255) cgccagcgccagTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCggg < 3:73117/149‑1 (MQ=255) cagcgccagTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCt > 8:208450/1‑149 (MQ=255) cagTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGgcgc > 2:173112/1‑148 (MQ=255) gggATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACCCCGGGCCTGGCGCTGGAACAt > 6:316167/1‑149 (MQ=255) gATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGGGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATgg < 6:73062/149‑1 (MQ=255) aTTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGc < 6:80434/149‑1 (MQ=255) tttGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGc > 2:180112/1‑148 (MQ=255) gcagcaCTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGAt < 5:56136‑M2/148‑2 (MQ=255) cagcaCTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGAtg < 4:290149‑M2/148‑3 (MQ=255) caCTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAtcgccatgttccagcgccaggcccggtgtacgcccgagcagtaccgccggcaggcgcggacggggcgctgaaca < 2:1885‑M1/149‑75 (MQ=255) tttCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAGGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGcc > 4:34497/1‑148 (MQ=255) tttCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGcc > 6:23249/1‑148 (MQ=255) tCATGGAGTGGTCTCGTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAtcgccatgttccagcgccaggcccggtgtacgcccgagcagtaccgccggcaggcgcggacggggcgctgaacattct < 4:282293‑M1/148‑79 (MQ=255) tCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCg > 8:111069/1‑147 (MQ=255) tCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCg > 7:315209/1‑147 (MQ=255) gAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAgcgc < 1:189986/148‑1 (MQ=255) gAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAgcgc < 3:53452/148‑1 (MQ=255) gAGTGCTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAgcgc < 4:126540/148‑1 (MQ=255) tGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCgctgct > 8:296153/1‑149 (MQ=255) gTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGc > 8:148996/1‑108 (MQ=255) gTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGctgctg > 5:174019/1‑148 (MQ=255) tctcCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGctgctg > 4:100269/1‑147 (MQ=255) tcCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGc > 6:356495/1‑149 (MQ=255) cTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAACGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGCACATGGCGATGCACGCCGAAGCGCTGCTGTAGcc > 1:100486/1‑148 (MQ=255) cgcgCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGaa < 4:212662/107‑1 (MQ=255) cgcgCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGaa > 3:212662/1‑107 (MQ=255) cgcgCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTAGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGaa < 1:173112/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAg > 3:165125/1‑149 (MQ=255) ccGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCaa < 7:296153/149‑1 (MQ=255) aTGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTGCCGCGACCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGTGCGTACACCGGGCCTGTCGCGTGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCAAAGGTAGAAGGCAATgg < 6:203135/149‑1 (MQ=255) tGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGc < 5:140902/149‑1 (MQ=255) cACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAGGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCt < 3:34497/149‑1 (MQ=255) aCGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCt > 6:38823/1‑148 (MQ=255) ggTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGaa > 3:221599/1‑149 (MQ=255) gTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGACGAAGGCAATGGCCTGAAt > 6:281505/1‑149 (MQ=255) tGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATc < 6:56136/149‑1 (MQ=255) gATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCg > 7:21753/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGc < 8:315209/148‑1 (MQ=255) gAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCa < 5:356495/148‑1 (MQ=255) aGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAgg < 8:8338/149‑1 (MQ=255) cTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGcc < 7:111069/149‑1 (MQ=255) gtgtAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCt < 8:21753/149‑1 (MQ=255) tAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTcc < 1:6809/149‑1 (MQ=255) tAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTc < 7:208450/148‑1 (MQ=255) gCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAg < 5:281505/149‑1 (MQ=255) ccAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCt > 4:241404/1‑126 (MQ=255) ccAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCt < 3:241404/126‑1 (MQ=255) ccAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAgc < 6:174019/149‑1 (MQ=255) ccAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAgc > 6:40015/1‑149 (MQ=255) aaGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGaa < 7:42738/127‑1 (MQ=255) aaGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAgcgc > 3:333166/1‑149 (MQ=255) aaGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAgcgc > 1:250491/1‑149 (MQ=255) aaGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTCCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGaa > 8:42738/1‑127 (MQ=255) aGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGAtgaacattcttggctacactcagctcgatcaccgtgcatcgggcgcggagccaacgagaccactccatga < 4:282293‑M2/148‑71 (MQ=255) tGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGAtgaacattcttggctacactcagctcgatcaccgtgcatcgggcgcggagccaaggagaccactccatgaaagtg < 2:1885‑M2/149‑76 (MQ=255) ttCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGAt < 3:100269/148‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGAt < 4:165125/148‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATg > 6:143443/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATgg > 4:326316/1‑149 (MQ=255) cAtcgccatgttccagcgccaggcccggtgtacgcccgagcagtaccgccggcaggcgcggacggggcgctgaacattcttggctacactcagctcgatcaccgtgcatcgggcgcggagccaaggagaccactccatgaaagtgctg < 4:290149‑M1/148‑147 (MQ=255) atcgccatgttccagcgccaggcccggtgtacgcccgagcagtaccgccggcaggcgcggacggggcgctgaacattcttggctacactcagctcgatcaccgtgcatcgggcgcggagccaaggagaccactccatgaaagtgctgc < 5:56136‑M1/148‑148 (MQ=255) aGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATGGCa > 7:323938/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATGGCa > 3:357632/1‑149 (MQ=255) | CTGCTGCGCGGTATTGGCAGCGAAACCTTGGGCACTGAACAACACCGCCAGCGCCAGTAACGGGATTTGCAGCACTTTCATGGAGTGGTCTCCTTGGCTCCGCGCCCGATGCACGGTGATCGAGCTGAGTGTAGCCAAGAATGTTCAGCGCCCCGTCCGCGCCTGCCGGCGGTACTGCTCGGGCGTACACCGGGCCTGGCGCTGGAACATGGCGATGAACGCCGAAGCGCTGCTGTAGCCAAGGTCGAAGGCAATGGCCTGAATCGGCAGGCCGGCTTCCAGCGCTTCGATGGCA > NC_002947/5518797‑5519091 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |