New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5940404 | 58 (0.980) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.4% | coding (243/1113 nt) | yhhJ | translation‑like protein |
? | NC_002947 | = 5940433 | 50 (0.900) | coding (272/1113 nt) | yhhJ | translation‑like protein |
GCGTGGCGATCTACATGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGATGCTACGGCCATGAGCCAAGCGTT > NC_002947/5940259‑5940550 | gCGTGGCGATCTACATGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCCCTGCCt > 5:242773/1‑149 (MQ=255) tGGCGATCTACATGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCg > 8:148034/1‑149 (MQ=255) gATCTACATGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAgc > 8:218688/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGa < 5:32732/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGa > 6:239860/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGAc > 1:23896/1‑148 (MQ=255) gCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGAc > 1:3918/1‑148 (MQ=255) gCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCAAGCGTGGCGGGGGTGGAGGAAGCCCATAGACTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCAGCTTCCTCCGCCGCGCCAGGAcc > 7:93/1‑149 (MQ=255) gCCAGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGAc > 3:105633/1‑148 (MQ=255) cGGCAGCCTGCTCGGTGATCGTCGTACACAACGCGAGCGTGGATGTTGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGGCATGCTACCGGCCGTGTTCGTGCCAGCCGT‑GCCTCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCa < 4:53635/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGAGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGGGAAGCCCTGCATCCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GACGCTGCCTCCGCAGCGCCTCGAc > 3:53635/1‑146 (MQ=255) ggCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAgg < 7:218688/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATg < 2:23896/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATg < 1:229765/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATgg < 6:192143/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGa < 5:282629/149‑1 (MQ=255) gCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGa > 7:47986/1‑148 (MQ=255) ggTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagc < 8:1903‑M1/148‑34 (MQ=255) aTCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAaagcggc < 4:295940‑M2/147‑8 (MQ=255) aTCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGcc < 7:148034/148‑1 (MQ=255) tCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAg < 8:47986/149‑1 (MQ=255) ggCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTa < 8:114769/149‑1 (MQ=255) acacAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCt > 1:30391/1‑149 (MQ=255) cacaACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCAT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCt < 5:165307/148‑1 (MQ=255) caACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCg < 8:107624/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCCTGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGt > 6:22141/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGtcat < 8:140519/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGtcatc < 2:166792/149‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAcagcg < 3:117861‑M2/127‑6 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAcagcg > 4:117861‑M2/1‑122 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTc > 7:16542/1‑141 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTc < 8:16542/141‑1 (MQ=255) gCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAAc < 5:239860/149‑1 (MQ=255) ggATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagcggcacggctg < 3:279917‑M1/122‑44 (MQ=255) ggATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagcggcacggctg > 4:279917‑M1/1‑79 (MQ=255) gATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACt < 6:242773/148‑1 (MQ=255) aaGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCa < 3:101323/148‑1 (MQ=255) aaGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCa < 2:30391/148‑1 (MQ=255) aGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCaga < 3:295940/149‑1 (MQ=255) cATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGa > 5:356873/1‑149 (MQ=255) aTAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGAc < 6:356873/149‑1 (MQ=255) tAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGAcc > 4:70248/1‑149 (MQ=255) aGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACct > 7:13458/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCTCTCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACct < 2:323110/148‑1 (MQ=255) gCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATgg > 4:317161/1‑93 (MQ=255) gCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATgg < 3:317161/93‑1 (MQ=255) ccTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACctgc < 4:105633/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACctgc > 3:301719/1‑149 (MQ=255) ctctCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGc > 6:340461/1‑149 (MQ=255) ctctCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTACGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACctgctg < 8:310376/147‑1 (MQ=255) tgtcGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCTGAGCGACctg < 4:223057/141‑1 (MQ=255) tctcGCGCAAGCTCAGCGAAGACCTGCAACCGCCCGACTTCCAGCCAGCCGA‑GCCGCAGCCTCCGCACCGCCTGGACCCGCCCATGGACAGCGGCCACTACACCTACGACAACAACGTCACCGTAAACTTCCAGAGCGACctg > 3:223057/1‑143 (MQ=255) tcGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGTGGCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGCCcggccagcag > 1:276328/1‑143 (MQ=255) gcgcAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCgg < 3:264495/147‑1 (MQ=255) aaGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGCCCGGCCAGCAGGTCGCTc < 2:276328/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTGCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGcc > 3:229916/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCg > 2:55498/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCg > 4:114071/1‑149 (MQ=255) ccTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTac < 5:65861/79‑1 (MQ=255) ccTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTac > 6:65861/1‑79 (MQ=255) ccTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGa < 2:53319/149‑1 (MQ=255) gCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCg < 3:70248/149‑1 (MQ=255) ccGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGc < 6:5948/126‑1 (MQ=255) ccGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGc > 5:5948/1‑126 (MQ=255) cagccGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGCCCAGGCCATGGCCAGCGGCCAGGACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGAAGCTACCGCCag > 6:214022/1‑147 (MQ=255) cagccGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatcc > 4:279917‑M2/1‑43 (MQ=255) cagccGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatcc < 3:279917‑M2/122‑80 (MQ=255) gCCGCTTtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatccaccaccgccacgctggcgttgtgtacgccgat < 4:295940‑M1/147‑141 (MQ=255) cGCTGtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatccaccaccgccacgct > 4:117861‑M1/1‑5 (MQ=255) cGCTGtccatggcctggtccaggcgctgcggaggcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatccaccaccgccacgct < 3:117861‑M1/127‑123 (MQ=255) cGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGATGCTACGGCCATGAGCCAAGCg < 4:69272/149‑1 (MQ=255) gCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGAcagcggcacggctggctggaactcgggcggttgcagggcttcgctgagcttgcgcgagagcaggctatggtcttcatccaccaccgccacgctggcgttgtgtacgccgatcacc < 8:1903‑M2/148‑116 (MQ=255) cTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGATGCTACGGCCATGAGCCAAGCGtt > 1:368626/1‑149 (MQ=255) cTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGATGCTACGGCCATGAGCCAAGCGt > 3:64677/1‑148 (MQ=255) | GCGTGGCGATCTACATGCCGGCAGCCGGCTCGGTGATCGGCGTACACAACGCCAGCGTGGCGGTGGTGGATGAAGACCATAGCCTGCTCTCGCGCAAGCTCAGCGAAGCCCTGCAACCGCCCGAGTTCCAGCCAGCCGT‑GCCGCTGCCTCCGCAGCGCCTGGACCAGGCCATGGACAGCGGCCAGTACACCTTCGTCATCAACGTGCCGGTTAACTTCCAGAGCGACCTGCTGGCCGGGCGCTCGCCGGAGCTGCAGATCAACGTCGATGCTACGGCCATGAGCCAAGCGTT > NC_002947/5940259‑5940550 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |