New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5978244 = | 63 (1.070) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.2% | coding (873/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5978305 = | 52 (0.960) | coding (812/993 nt) | PP_5241 | LuxR family transcriptional regulator |
GTCGTCGACGATGCACACCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGC > NC_002947/5978098‑5978390 | gtcgtcgACGATGCACACCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTc > 2:64757/1‑149 (MQ=255) gtcgACGATGCACACCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCt > 5:134542/1‑149 (MQ=255) gtcgACGATGCACACCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCt < 7:237874/149‑1 (MQ=255) accaagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcgcccgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGc > 2:295872‑M1/144‑148 (MQ=255) caagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcgcccgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTgg > 7:29226‑M1/142‑149 (MQ=255) aagccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcgcccgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGt > 6:94382‑M1/141‑149 (MQ=255) agccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcgcccgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGTg > 8:243060‑M1/140‑149 (MQ=255) gccgttcgatgaagaccagttgctgaccctgttgcagacagtgcgcgcccgggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGTGc < 8:184650‑M1/11‑1 (MQ=255) cacaCCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCAGGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGGCACCTCGCTGGTGCCGAt < 6:104681/148‑1 (MQ=255) acacCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCt > 8:212241/1‑149 (MQ=255) acCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTg > 8:261698/1‑140 (MQ=255) acCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTg < 7:261698/140‑1 (MQ=255) acCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGc < 2:32371/149‑1 (MQ=255) cccTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCt > 6:46939/1‑149 (MQ=255) cccTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCt > 7:348432/1‑149 (MQ=255) ctctGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTgg < 4:255976/149‑1 (MQ=255) cTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGAt < 4:225318/148‑1 (MQ=255) tCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCt > 2:45533/1‑141 (MQ=255) tCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCt < 1:45533/141‑1 (MQ=255) cgccgcCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTtg > 1:310243/1‑149 (MQ=255) gccgccCCGACTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTtgt < 7:225182/149‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCCCCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTtgt > 5:117933/1‑149 (MQ=255) cgccCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGc < 1:64757/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGAc < 5:35162/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCgcc > 4:259868/1‑146 (MQ=255) gCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAgc > 5:160382/1‑149 (MQ=255) tCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGAt > 8:288099/1‑130 (MQ=255) cGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAgccgc > 1:63166/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAgccgcc > 2:90752/1‑149 (MQ=255) gCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAgccgcc < 5:46939/149‑1 (MQ=255) gCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCACTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTCGCACAAgcagat < 8:153604/149‑5 (MQ=255) aGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCt < 6:319953/105‑1 (MQ=255) aGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCt > 5:319953/1‑105 (MQ=255) aGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTa < 6:117933/149‑1 (MQ=255) aCCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTac > 3:108949/1‑148 (MQ=255) cgcgCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTaccac > 3:286402/1‑149 (MQ=255) cgcTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTaccac > 2:77496/1‑147 (MQ=255) gcacgggcagtcgcctaaggccacaactggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaactaccagcgcctcaatcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGgtgctag < 2:107557‑M1/14‑4 (MQ=255) ggccgtggccgaaggccacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCgaga > 7:184650‑M1/88‑149 (MQ=255) gaggTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGagaaga < 6:134542/149‑1 (MQ=255) ttGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTg < 8:348432/149‑1 (MQ=255) gCATGGCCGCGAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCATAGAGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGgcgc > 1:119084/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGgcgc > 1:69608/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCa < 4:108949/149‑1 (MQ=255) cacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCga > 7:42132‑M1/72‑131 (MQ=255) cacaagtggctgcaggcgcggcaggtcgaggaaaagtaccagcgcctgactcagcgtgagcgccaggtcttCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCga < 8:42132‑M1/60‑1 (MQ=255) gCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTc < 7:212241/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCa < 6:160382/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCt > 8:25272/1‑141 (MQ=255) ccAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCt < 7:25272/141‑1 (MQ=255) gcgagcgGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTgg < 4:188965/149‑1 (MQ=255) cTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCt > 7:334610/1‑149 (MQ=255) cTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCt < 4:286402/149‑1 (MQ=255) aTCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGAc > 6:117205/1‑149 (MQ=255) aTCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGAc > 4:12511/1‑149 (MQ=255) ttGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTg > 1:332826/1‑149 (MQ=255) tGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGc > 7:25700/1‑149 (MQ=255) gTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGc < 8:334610/148‑1 (MQ=255) tCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTAccacca > 6:47070/1‑90 (MQ=255) tCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTAccacca < 5:47070/90‑1 (MQ=255) caagatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCg < 4:229896/136‑1 (MQ=255) caagatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCg > 3:229896/4‑139 (MQ=255) atgatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCgcgc > 3:333537/1‑149 (MQ=255) gatgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCt > 1:340313/1‑149 (MQ=255) atgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCt < 2:340313/148‑1 (MQ=255) atgTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCt < 1:90752/148‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTg > 4:263233/1‑147 (MQ=255) ttcttcTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCa < 3:259868/148‑1 (MQ=255) cttGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCa < 5:117205/147‑1 (MQ=255) tgCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTtgtg < 2:332826/149‑1 (MQ=255) cACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTgg < 4:333537/148‑1 (MQ=255) aCCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGcc > 1:258179/1‑149 (MQ=255) cgtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCa > 5:51119/1‑149 (MQ=255) gtcACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCAc < 8:25700/149‑1 (MQ=255) aCCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGc > 3:62492/1‑149 (MQ=255) | GTCGTCGACGATGCACACCCCTCTGCTCATGCGCCGCCCAGGCTCGCAGACCGCGCTCCGAGGAGGTTGTGCATGGCCGCAAGCTCCAGCAGCGAGCGGGACTGCATCTTGTTCATGATGTTCTTCTTGTGCACCTTGGTCGTCACCTCGCTGGTGCCGATCTGCCTGGCGATCTGCTTGTGCGACAAGCCGCCTACCACCAGCGAGAAGACCTGGCGCTCACGCTGAGTCAGGCGCTGGTACTTTTCCTCGACCTGCCGCGCCTGCAGCCACTTGTGGCCTTCGGCCACGGC > NC_002947/5978098‑5978390 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |