New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6062121 = | 37 (0.630) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 6.2% | coding (583/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
? | NC_002947 | 6062168 = | 55 (0.960) | coding (536/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
TCGGTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGT > NC_002947/6061973‑6062266 | tCGGTACGTGGGCGCAGGCCGATGTCCGAAACCACCAGTTCGCAGGCGATCTCGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAg < 5:53016/149‑1 (MQ=255) tggaagactacgcacgcttccgtgctgccgccgctggcaagcagcgtgtactgatcctcggtgccggcctgatcggctgcgaattcgcaaacgacatgagcctgggcggcttcaaggtcgacgttgtggcgccgtgtgaacagatcatg < 5:320920‑M1/1‑1 (MQ=255) gTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGcc > 7:235228/1‑148 (MQ=255) cGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCAACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAgccgc < 1:101890/149‑1 (MQ=255) cGATGGCCGAAACCACCAGGTAGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAgccgcc > 4:193217/1‑149 (MQ=255) gCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc > 6:114287/1‑149 (MQ=255) gCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc < 8:127900/149‑1 (MQ=255) caccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGt < 2:193954/149‑1 (MQ=255) accaGGTCGCCGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGGCACCTGCTGAAGCCGGGGCAGC‑CCCGGCCCCAGGTGGCAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCCCCCTGCACCGCCGCCGCAGCGGCCGGGTg > 7:328842/1‑149 (MQ=255) ccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgc < 7:29027/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGcagcag < 3:146907/149‑1 (MQ=255) aGGCGATAACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTc < 7:155361/149‑1 (MQ=255) cGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGc < 5:135223/149‑1 (MQ=255) gATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCa < 1:184805/149‑1 (MQ=255) tCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCAt > 1:263244/1‑148 (MQ=255) aCGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGa < 2:159378/148‑1 (MQ=255) atcctcggtgccggcctgatcggctgcgaattcgcaaacgacatgagcctgggcggcttcaaggtcgacgttgtggcgccgtgtgaacagatcatGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt > 1:83686‑M1/96‑147 (MQ=255) gACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACCCCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACgg > 2:62284/1‑149 (MQ=255) aCAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgc < 5:194935/149‑1 (MQ=255) aaGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgcgc < 4:204969/149‑1 (MQ=255) atcggctgcgaattcgcaaacgacatgagcctgggcggcttcaaggtcgacgttgtggcgccgtgtgaacagatcatGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGc > 3:288150‑M1/78‑124 (MQ=255) atcggctgcgaattcgcaaacgacatgagcctgggcggcttcaaggtcgacgttgtggcgccgtgtgaacagatcatGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGc < 4:288150‑M1/47‑1 (MQ=255) aGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGAc < 3:193217/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGAcc > 5:62758/1‑149 (MQ=255) cTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTg < 5:39122/149‑1 (MQ=255) aGTTACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAg < 3:4178/148‑1 (MQ=255) cACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACACTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAgccgc > 5:92598/1‑149 (MQ=255) tgctgAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAg > 5:213392/1‑149 (MQ=255) ctgAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGc > 2:245537/1‑149 (MQ=255) aGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCAt < 5:114287/149‑1 (MQ=255) tCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt > 2:349474/1‑149 (MQ=255) tCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt > 6:160412/1‑149 (MQ=255) tCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt > 5:46012/1‑149 (MQ=255) ggC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt > 2:334791/2‑147 (MQ=255) gCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCg > 8:296625/1‑149 (MQ=255) ccccAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGc < 6:62758/149‑1 (MQ=255) tGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGAt < 1:245537/149‑1 (MQ=255) gAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATc < 1:326947/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCAcc > 6:132909/1‑148 (MQ=255) aGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAg > 6:360722/1‑149 (MQ=255) ggCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAgg < 1:62284/149‑1 (MQ=255) gCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGa < 7:296625/149‑1 (MQ=255) cccTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCAACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGa > 6:269087/1‑148 (MQ=255) tCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAg > 6:320920/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAg > 8:14364/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAg > 5:13657/1‑148 (MQ=255) cAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAg < 6:213392/147‑1 (MQ=255) cAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGt < 5:160412/148‑1 (MQ=255) GCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCa < 7:184485‑M1/99‑1 (MQ=255) GCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCa > 8:184485‑M1/1‑99 (MQ=255) | TCGGTACGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGC‑ACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACCCAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGT > NC_002947/6061973‑6062266 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |