New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 619998 = | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 5.6% | coding (692/693 nt) | PP_0534 | transcriptional regulator PfeR |
? | NC_002947 | 620048 = | 67 (1.190) | coding (642/693 nt) | PP_0534 | transcriptional regulator PfeR |
CACCGAAAGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCA > NC_002947/619902‑620196 | cacagggcctatacccgactggaccgaggcctggatgtgcatgtgtgcaacctgcgccgcaaactggccgacatcaatgcccagcacctgcagatcCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGa > 7:30940‑M1/97‑148 (MQ=255) aCCGAAAGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATc > 8:166593/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCt > 3:21908/1‑149 (MQ=255) aaaGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCt < 5:87991/146‑1 (MQ=255) aaaGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCt > 6:87991/1‑146 (MQ=255) aaaGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCa < 2:21836/149‑1 (MQ=255) cgaGGTGCAGATGAGGCAGATCACCAAGAGGCAGAAGCTGACTTGCTGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGCCGACGCATCAGCCCTGCTCCGAGTCGACCAGGATGTACGCTTGGCCAGGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCtc > 7:220575/3‑148 (MQ=255) ccAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGCTCTGCAGGTGCTg > 5:276656/1‑149 (MQ=255) gTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCTACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCa > 2:72390/1‑149 (MQ=255) cAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCGTGCTCCGTGTCGACCAGGAAGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCAtt < 1:258033/148‑1 (MQ=255) cAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTTGATCTGCAGGGGCTAGGAAtt > 6:258243/1‑148 (MQ=255) cAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCAtt < 8:132658/148‑1 (MQ=255) aGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAACCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑a > 1:207449/1‑149 (MQ=255) gATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑At > 3:108900/1‑149 (MQ=255) ccAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGc > 7:324837/1‑149 (MQ=255) ccAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGc < 2:131847/149‑1 (MQ=255) ccAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGATGGGCATTG‑ATGTCGGc > 8:77009/1‑149 (MQ=255) aGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGc > 3:211384/1‑147 (MQ=255) aTCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGt > 3:269211/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGt < 2:308279/149‑1 (MQ=255) gCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTgc > 2:160977/1‑149 (MQ=255) aGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTgc > 6:331912/1‑144 (MQ=255) aGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTgc < 5:331912/144‑1 (MQ=255) ggCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTc < 1:191435/132‑1 (MQ=255) ggCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTc > 2:191435/1‑132 (MQ=255) cAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAgg > 3:310790/1‑149 (MQ=255) aGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGt > 4:6754/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGtt < 2:299815/149‑1 (MQ=255) gAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGtt < 4:21908/149‑1 (MQ=255) gAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGtt < 4:173463/149‑1 (MQ=255) aaGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTg < 7:77009/149‑1 (MQ=255) gCTGTCTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGACCAGTTTGCGGCGCAGGTTGca < 7:56977/149‑1 (MQ=255) cTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGgac < 6:276656/149‑1 (MQ=255) aCTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGTCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGcacac < 2:329269/148‑1 (MQ=255) cTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACAt < 3:328654/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGCAAGGCCAGGTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACAt < 7:166593/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATg > 4:213059/1‑149 (MQ=255) gcagcaAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATg < 2:207449/147‑1 (MQ=255) gcagcaAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGc < 8:324837/148‑1 (MQ=255) cagcaAGGCCATTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCAAGCACGGCCTGGATCTTCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCATTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGcac < 1:287182/149‑1 (MQ=255) cagcaAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGca > 8:14182/1‑148 (MQ=255) agcaAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCa < 6:110841/120‑1 (MQ=255) ggCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGttt > 2:52543/1‑119 (MQ=255) ggCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGttt < 1:52543/119‑1 (MQ=255) gCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAgg < 3:213059/149‑1 (MQ=255) tCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGTCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGt > 2:144166/1‑149 (MQ=255) cacaGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCATGATGTACCCTTGGCCACGCACGGGCTGGATCTGTAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCgggc < 5:258243/148‑3 (MQ=255) cacaGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTGCTTGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTc < 1:97245/149‑1 (MQ=255) cacaGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTc < 4:211384/148‑1 (MQ=255) gCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTc < 4:269211/149‑1 (MQ=255) cAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCg > 3:82907/1‑149 (MQ=255) aaCGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACGAGGATCTTCCCTTGGCCACGCACGCCCTGGTTCTGCAGGTGGAGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCAGTCATGCACATGCAGGCCTCGGTCCAGTCgg < 8:220575/149‑1 (MQ=255) ggCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATACAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAgg > 1:121291/1‑149 (MQ=255) gCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGc > 8:142000/1‑149 (MQ=255) cATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGTCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCtgtg < 1:144166/149‑1 (MQ=255) tccaggccgtgcgtggccaagggtacatcctggtcgacacggagcaggcctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCtgtg > 7:30940‑M2/53‑148 (MQ=255) caggccgtgcgtggccaagggtacatcctggtcgacacggagcaggcctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTgcag < 8:30940‑M2/99‑1 (MQ=255) caggccgtgcgtggccaagggtacatcctggtcgacacggagcaggcctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCGGTgcag > 6:352825‑M2/51‑149 (MQ=255) GGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGt > 8:14356‑M1/1‑127 (MQ=255) GGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGt < 7:14356‑M1/127‑1 (MQ=255) gtgtCGACCAGGATGTACCCTTGGCTACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTa < 1:72390/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACa < 7:142000/148‑1 (MQ=255) gACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAgg > 8:262157/1‑148 (MQ=255) cAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAgg > 7:255336/1‑149 (MQ=255) cAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAgg > 8:187207/1‑149 (MQ=255) cAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAgg > 1:13182/1‑149 (MQ=255) tGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTg < 7:187207/149‑1 (MQ=255) tGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTg < 4:310790/149‑1 (MQ=255) tGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTg > 5:25676/1‑149 (MQ=255) tACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTg < 4:108900/147‑1 (MQ=255) tACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGc < 3:6754/148‑1 (MQ=255) tACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCt < 6:25676/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGAAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCaa > 3:222653/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCACGCACGGCCTGGATCAGCAGGTCCTGCGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCACGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCaa > 2:334464/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCAAGCACGGCATGGATATGGAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACAAATGCACATCCAGGCCTAGGTGCAATCGGGTATAGTCCCTGGGGAGCAAGGTCTGGTACAGGAAGTGGTTGCTCaa > 8:157184/1‑149 (MQ=255) tcgacacggagcaggcctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCCGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAAc < 5:352825‑M2/130‑1 (MQ=255) cacgcacgGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGc > 7:238203/1‑103 (MQ=255) cacgcacgGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGc < 8:238203/103‑1 (MQ=255) gcctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTg > 5:305606‑M2/6‑149 (MQ=255) cctgGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGAACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTgg > 1:129872‑M2/5‑149 (MQ=255) gATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGc > 8:104545/1‑147 (MQ=255) gATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGc < 4:82907/147‑1 (MQ=255) gATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCca > 7:96948/1‑149 (MQ=255) | CACCGAAAGGCCCCAGGTCCAGATGAGCCAGATCAGCAACAGGCAGAAGCTGACTTGCAGCAAGGCCAGTTTCCACAGCAACGGGTGGCGACGCATCAGGCCTGCTCCGTGTCGACCAGGATGTACCCTTGGCCACGCACGGCCTGGATCTGCAGGTGCTGGGCATTG‑ATGTCGGCCAGTTTGCGGCGCAGGTTGCACACATGCACATCCAGGCCTCGGTCCAGTCGGGTATAGGCCCTGTGCAGCACGGTCTGGTACAGGAAGGGCTTGCTCAACGCTTCGTCGGGGTGGGCCA > NC_002947/619902‑620196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |