New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 855438 | 47 (0.800) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.9% | coding (289/798 nt) | murI | glutamate racemase |
? | NC_002947 | = 855501 | 36 (0.640) | coding (352/798 nt) | murI | glutamate racemase |
AAAGGCCATGGTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAGCCCGGCGGTGCGCCAGCTGCT > NC_002947/855353‑855649 | aaaGGCCATGGTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTgg < 2:152305/149‑1 (MQ=255) aaGGCCATGGTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGc > 3:54711‑M2/1‑148 (MQ=255) aGGCCATGGTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGcc > 7:205537‑M2/1‑147 (MQ=255) gTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCg < 7:199953/148‑1 (MQ=255) tCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCgg > 1:133591/1‑148 (MQ=255) gCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTAccc < 6:245359/148‑1 (MQ=255) gCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGACCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTgg < 5:345131/133‑1 (MQ=255) gCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGACCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTgg > 6:345131/1‑133 (MQ=255) cAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCaga < 7:265422/149‑1 (MQ=255) cAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCaga < 7:26312/149‑1 (MQ=255) cAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCaga < 7:243905/149‑1 (MQ=255) cTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGcc < 8:196144/149‑1 (MQ=255) gcggcAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGc < 2:133591/149‑1 (MQ=255) ccGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGAt > 2:46539/1‑149 (MQ=255) cGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTc < 1:144839/147‑1 (MQ=255) tGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCt < 7:317054/135‑1 (MQ=255) tGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCt > 8:317054/1‑135 (MQ=255) gAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCaaa > 4:174613/1‑149 (MQ=255) aTCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTa > 5:69258/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGt < 2:119476/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGt > 8:92657/1‑148 (MQ=255) ggCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGGGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGttat > 6:127543/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGccaccaacggccaggtcggatacaactcacgcaggtcggccactgccgccaccgtggcagtgttgcaggccagga < 2:276171‑M2/149‑76 (MQ=255) tggtggGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGccaccaacggccaggtcggatacaactcacgcaggtcggccactgccgccaccgtggcagtgttgcaggccaggaccatg < 7:265363‑M2/149‑81 (MQ=255) tggtggGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGttatt < 5:233453/143‑1 (MQ=255) tggtggGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGttatt > 6:233453/1‑143 (MQ=255) ggCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCtt < 7:92657/148‑1 (MQ=255) gCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGc > 5:176496/1‑149 (MQ=255) aTGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGccc > 6:372243/1‑149 (MQ=255) aaCCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCgggg < 5:372243/149‑1 (MQ=255) ggCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTgg > 2:77778/1‑149 (MQ=255) cGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTc > 4:293544/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAg < 1:46539/149‑1 (MQ=255) aGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGccaccaacggccaggtcggatacaactcacgcaggtcggccactgccgccacccgtggcagtgttgcaggccaggaccatggcctttgcgccttgttcatggaa > 1:276171‑M2/1‑45 (MQ=255) cTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATc < 6:69258/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTCGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCATCCATGCTCGATCGCTACGCAAATGACGTACAGGTTAATACGCAGCCTTGCCCGGGGCTGCTCGAGCTGATc > 4:244370/1‑148 (MQ=255) ttgaGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCg < 5:106261/146‑1 (MQ=255) aGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCgggg < 4:133797/124‑1 (MQ=255) aGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCgggg > 3:133797/1‑124 (MQ=255) gCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGa < 3:174613/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCt > 1:188168/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCt > 6:204036/1‑149 (MQ=255) gggCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAg < 2:181716/147‑1 (MQ=255) gTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAGCCCGGCGGt > 7:12379/1‑149 (MQ=255) ggcgtgCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAGCCCGGCGGTgc < 5:127543/145‑1 (MQ=255) ggTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAGCCCGGCGGTgcg > 4:139726/1‑149 (MQ=255) gccaccaacggccaggtcggatacaactcacgcaggtcggccactgccgccaccgtggcagtgttgcaggccaggaccatggcctttgcgccttgttcatggaagaacccggcaatgcgtcggcagcgctcgcggatatagtccggcga > 8:265363‑M2/1‑1 (MQ=255) | AAAGGCCATGGTCCTGGCCTGCAACACTGCCACGGTGGCGGCAGTGGCCGACCTGCGTGAGTTGTATCCGACCTGGCCGTTGGTGGGCATGGAACCGGCCGTCAAGCCTGCAGCGGCAGCCACCCGCTCGGGCGTGGTCGGTGTGCTGGCCACCACCGGTACCCTGCAGAGTGCCAAGTTCGCAGCCTTGCTCGATCGCTTCGCAAATGACGTACAGGTTATTACCCAGCCTTGCCCGGGGCTGGTCGAGCTGATCGAAGCCGGTGACCTGGTAAGCCCGGCGGTGCGCCAGCTGCT > NC_002947/855353‑855649 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |