New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 923914 | 44 (0.750) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 6.5% | coding (1279/2169 nt) | PP_0804 | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 923954 | 44 (0.790) | coding (1239/2169 nt) | PP_0804 | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
CTTGGCCTGCTGCCAGCGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCGTGCCTCTGCCTGCA > NC_002947/923816‑924093 | cTTGGCCTGCTGCCAGCGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCa > 2:104561/1‑148 (MQ=255) ccTTCTGCCAGCGGGTCAGCAGATGGGTCAGTTGGGCGAACGTCGCCATCATTCGCGATTAAATAATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGTCAAACACg < 2:75039/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCAGCGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACg > 5:232044/1‑149 (MQ=255) tgctgcCAGCGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACgg > 6:366161/1‑148 (MQ=255) cGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAc < 7:10949/149‑1 (MQ=255) cAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCt < 8:33422/149‑1 (MQ=255) acaTGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACAATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGt > 2:269304/1‑149 (MQ=255) gggTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAg > 7:268639/1‑149 (MQ=255) ggTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAg < 1:73398/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAg < 3:231873/148‑1 (MQ=255) gggCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCAGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAg < 3:257773/148‑1 (MQ=255) cAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGt < 8:183768/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTg < 8:268639/149‑1 (MQ=255) ggCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACAATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGt < 1:269304/149‑1 (MQ=255) gcgcCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGt > 2:219280/1‑148 (MQ=255) gcCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAg > 6:320204/1‑149 (MQ=255) ccATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAgg > 7:122754/1‑149 (MQ=255) atcatTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGt < 8:317836/149‑1 (MQ=255) atcatTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGt < 5:366161/149‑1 (MQ=255) 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cATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTgg > 4:322614/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGTACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTgcg > 8:289534/1‑149 (MQ=255) accaGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGc < 4:95622/90‑1 (MQ=255) accaGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGc > 3:95622/1‑90 (MQ=255) accaGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGc > 3:288586/1‑149 (MQ=255) ggCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGaccacgggtagcctggtggcggcatccatgctttcatcgcgaatgatggcgccgttggcccaactgacccatgtgctgacccgctggcagcaggc < 4:86429‑M2/148‑96 (MQ=255) ggCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCcgcg > 6:340812/1‑149 (MQ=255) gCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCGGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGt < 5:320204/149‑1 (MQ=255) cTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGtt < 5:340812/149‑1 (MQ=255) cTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTAGGTGTGCGCGCAGGCCGCGtt > 1:82722/1‑149 (MQ=255) tACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGaccacgggtagcctggtggcggcatccatgctttcatcgcgaatgatggcgccgttggcccaactgacccatgtgctgacccgctggcagcaggccaag < 6:32502‑M2/149‑100 (MQ=255) ccGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTAc > 4:328412/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACt < 6:232044/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACt > 4:37414/1‑149 (MQ=255) cGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCTCGATGACCAGGGGAAACACGTGACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGt < 2:171667/149‑1 (MQ=255) ggCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGaccacgggtagcctggtggcggcatccatgctttcatcgcgaatgatggcgccgttggcccaactgacccatgtgctgacccgctggcagcaggccaaggtcgcgctgcaaggcctgg > 3:86429‑M2/1‑31 (MQ=255) gCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGtt < 4:295930/128‑1 (MQ=255) gCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGtt > 3:295930/1‑128 (MQ=255) aTGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGaa < 3:328412/149‑1 (MQ=255) aTGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGaa < 1:219280/149‑1 (MQ=255) ccATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCACTGTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCg > 1:87443/1‑149 (MQ=255) cATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTCGGAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCGt > 1:290458/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCGTGCctct > 2:127377/1‑149 (MQ=255) gATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCGTGCCTCTGCCTGCa < 1:104561/149‑1 (MQ=255) | CTTGGCCTGCTGCCAGCGGGTCAGCACATGGGTCAGTTGGGCCAACGGCGCCATCATTCGCGATGAAAGCATGGATGCCGCCACCAGGCTACCCGTGGTGAGGTCGCCGGCGATGACCATGGGAGCGCCGATCACGATGACCACGGCAAACACGGCACCCTGCAC‑GTTCTGCGTC‑CAGGTCACCAGGCCGTTGGTGAGGGTGCGCAGGCGCAGGTTGGTGTGCGCGCAGGCCGCGTTGTACTGGTTCCACTGCCGTTCGAAGCGTGCCTCTGCCTGCA > NC_002947/923816‑924093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |