New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1266384 = | 50 (0.850) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.5% | coding (1604/2442 nt) | quiP | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
? | NC_002947 | 1266425 = | 38 (0.680) | coding (1563/2442 nt) | quiP | acyl‑homoserine lactone acylase QuiP |
GTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTCCCAGTCGT > NC_002947/1266278‑1266573 | gTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGtt > 5:276113/1‑149 (MQ=255) caggacccacccgcgggctggatcggccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaaCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTc > 6:272676‑M1/106‑149 (MQ=255) gATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCg < 4:118098/148‑1 (MQ=255) ccTGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTTGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGc > 2:32393/1‑149 (MQ=255) tGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTc > 2:104820/1‑149 (MQ=255) gCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACAGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCg > 7:67300/1‑149 (MQ=255) cTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTc < 7:271732/147‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCggg < 2:87503/147‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCggg < 5:228144/147‑1 (MQ=255) aGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGgta < 4:117526/149‑1 (MQ=255) tGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCAGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTAc > 6:295805/1‑147 (MQ=255) ccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaaCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCg < 5:76060‑M1/45‑1 (MQ=255) ccatgccaaccagcgcagcctgccgcgcggctatggcatgcagctgtccagcacctggtactaccccgagcgtgccgaaCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCg > 6:76060‑M1/80‑124 (MQ=255) ccGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACAAGGTGCTGGa > 8:255928/1‑149 (MQ=255) gTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGc > 8:331492/1‑149 (MQ=255) tCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCAt < 6:276113/149‑1 (MQ=255) tCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCAt > 4:25413/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCa > 5:109865/1‑147 (MQ=255) gCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCcg > 2:68629/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGcc < 6:115916/147‑1 (MQ=255) aGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCcgcgcg < 8:241603/148‑1 (MQ=255) cTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCgg > 3:55130/1‑147 (MQ=255) cTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCa < 2:334828/149‑1 (MQ=255) gttgGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGc > 6:124662/1‑149 (MQ=255) ccAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTgcgc < 5:124662/149‑1 (MQ=255) cAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGt < 2:253600/149‑1 (MQ=255) aaGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGtt < 4:55130/149‑1 (MQ=255) aGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTg < 1:149140/149‑1 (MQ=255) tCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCa < 7:331492/149‑1 (MQ=255) tCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCa > 1:268421/1‑149 (MQ=255) gTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACGGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATc < 8:67300/148‑1 (MQ=255) ggCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCgg < 2:268421/149‑1 (MQ=255) ccATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCgggt > 3:186495/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCTGTGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCgggtgg > 6:231149/1‑149 (MQ=255) tCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCgggtggg > 7:125136/1‑149 (MQ=255) cgaacgactggcacagctggccggcaacggtcgccacgacagtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATgg > 6:76060‑M2/46‑124 (MQ=255) cgaacgactggcacagctggccggcaacggtcgccacgacagtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATgg < 5:76060‑M2/79‑1 (MQ=255) gaacgactggcacagctggccggcaacggtcgccacgacagtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTg > 6:272676‑M2/45‑149 (MQ=255) cTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTg > 2:3275/1‑149 (MQ=255) GACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCg > 5:207802‑M1/1‑149 (MQ=255) GACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCg < 6:207802‑M1/149‑1 (MQ=255) tCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTAc < 1:104820/147‑1 (MQ=255) tGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTg > 5:111058/1‑149 (MQ=255) gCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTg > 5:183931/1‑147 (MQ=255) cGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCACGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATc < 5:295805/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGGAGCATCGGGTCGGc < 4:122078/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCgg > 3:122078/1‑148 (MQ=255) aGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTCGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATa < 1:32393/149‑1 (MQ=255) tgCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCg < 3:25413/148‑1 (MQ=255) tgCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGt < 8:143629/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTcc > 1:365916/1‑149 (MQ=255) gtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTc < 2:328767‑M2/102‑1 (MQ=255) gtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTc > 1:328767‑M2/5‑106 (MQ=255) gtcgTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTCCCAg > 8:53000‑M2/5‑149 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGc < 2:121636/80‑1 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGc > 1:121636/1‑80 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTCCCAGTCg > 4:127969/1‑148 (MQ=255) ttCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTCCCAGTCGt < 1:3275/149‑1 (MQ=255) | GTCGATTGCCTGCTTCAGTGGCTGGGCCATGCCGGGTGCGTCGAACATCTGCTTGAGCTTGTTGGCCAGCAAGGTCACCTGGTCGTTCTGCAGGGCCATCAGGCTGCGACTGTCGTGGCGACCGTTGCCGGCCAGCTGTGCCAGTCGTTCGGCACGCTCGGGGTAGTACCAGGTGCTGGACAGCTGCATGCCATAGCCGCGCGGCAGGCTGCGCTGGTTGGCATGGCCGATCCAGCCCGCGGGTGGGTCCTGGTCGTACGGGTGCAGCATCGGGTCGGCATAGCCGTCCCAGTCGT > NC_002947/1266278‑1266573 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |