New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1455925 = | 54 (0.920) | 5 (0.090) | 5/254 | NT | 8.9% | intergenic (+4/+245) | PP_1273/PP_1274 | multidrug MFS transporter outer membrane protein/short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
? | NC_002947 | 1455962 = | 50 (0.880) | intergenic (+41/+208) | PP_1273/PP_1274 | multidrug MFS transporter outer membrane protein/short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
TGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGT > NC_002947/1455814‑1456107 | tGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCa < 7:299777/149‑1 (MQ=255) gATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATg > 2:78600/1‑149 (MQ=255) aTCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGCCGCTGCGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGCGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGCAGCGCGGGCTACTGCG‑GTCCAtcg > 8:303828/1‑147 (MQ=255) ctacaccagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgctgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccagtacaggctgtaaagcatcatgccatGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGc < 5:77988‑M1/42‑1 (MQ=255) ctacaccagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgctgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccagtacaggctgtaaagcatcatgccatGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGc > 6:77988‑M1/107‑148 (MQ=255) aCAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGATTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCat > 2:368536/1‑148 (MQ=255) tCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCt > 5:186369/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCtt > 6:189662/1‑148 (MQ=255) ttggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgctgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccagtacaggctgtaaagcatcatgccatGGAC‑CGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTAc > 8:249689‑M1/97‑149 (MQ=255) ccGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTa > 4:212221/1‑148 (MQ=255) cgcgGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACa < 8:59890/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCt < 7:4907/149‑1 (MQ=255) tgtCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTg < 1:78600/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTa > 3:182249/1‑149 (MQ=255) tCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTa < 8:236333/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTa < 2:6154/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGCGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTa < 5:332154/138‑1 (MQ=255) gCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGCGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTa > 6:332154/1‑138 (MQ=255) cAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTg < 3:212221/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTg < 4:182249/149‑1 (MQ=255) acatcggtggttggacacaggccgctgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccagtacaggctgtaaagcatcatgccatGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTGCTGCG‑GGCCATGGCCTGATGAGTTACCGCCTGTTCTGGc < 8:306074‑M1/67‑1 (MQ=255) acatcggtggttggacacaggccgctgtaggagcgggttcacccgcgaagaggccagtacaggctgtaaagcatcatgccatggacgcgcagtatctggagggcggggtactgcggtccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGc < 7:306074‑M2/30‑1 (MQ=255) gtggGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTcg > 2:72163/1‑149 (MQ=255) ggggCTGTACTAGGCGCGGGGTGTAGGCTGGAAGGCGTTTGAGTAGCCGCCGACGAATTCTCACGGTTAGAGATGACGCGCAGTATCTTGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTcgcg < 1:83061/149‑1 (MQ=255) ggggCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTcgcg > 5:117760/1‑149 (MQ=255) gtgCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTGTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTCCTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTTGCCTCTTcgag > 2:83061/3‑146 (MQ=255) gggCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTcgcg > 2:87960/1‑148 (MQ=255) gggCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTcgcg < 1:87960/148‑1 (MQ=255) gggCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCgg < 1:262019/149‑1 (MQ=255) gggCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCgg < 6:186369/149‑1 (MQ=255) cTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTg < 1:368536/149‑1 (MQ=255) tGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTg > 2:272971/1‑148 (MQ=255) tACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAAc > 4:327843/1‑149 (MQ=255) tACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAAc < 7:303828/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTGGAGGCTGGCAGGGGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc > 8:302944/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGGGGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc < 7:247210/149‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGAG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCtgtg > 4:206828/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTgtgt < 6:117760/148‑1 (MQ=255) ggCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCaa < 4:280430/149‑1 (MQ=255) gCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAac > 1:163540/1‑149 (MQ=255) ggttGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGGATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAAACGGCTCCTCCAGCGGCCTGTGTCAAacca > 3:31570/3‑149 (MQ=255) gatgaGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGa > 4:342520/1‑149 (MQ=255) attcgccgccgccTTATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTTCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGa < 8:54069/144‑1 (MQ=255) gccagtacaggctgtaaagcatcatgccatGGAC‑CGCAGTACCCCGCCCTCCAGATACTGCGCGTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGAtgt < 7:306074‑M1/119‑1 (MQ=255) gccagaacaggcggtaactcatcaggccatggcccgcagcaccccgccctccagatactgcgcgtccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGAtgt < 8:306074‑M2/82‑1 (MQ=255) ccgccgccgAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGAtgtgtg > 5:157560/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGAtgtgtg < 5:189662/149‑1 (MQ=255) ccgAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTccac > 7:311273/1‑148 (MQ=255) aaTGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCAAACCACCGATGTGTGTccaccac > 4:119588/1‑148 (MQ=255) gtaaagcatcatgccatggaccgcagtaccccgccctccagatactgcggtccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCaa > 8:249689‑M2/54‑149 (MQ=255) aCGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGCAGGGCGGGGTACTGCG‑CTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTCTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTgg > 6:329379/1‑149 (MQ=255) cGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGTCCGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGgt < 6:341016/149‑1 (MQ=255) gccatggaccgcagtaccccgccctccagatactgcgcgtccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAg > 6:77988‑M2/43‑148 (MQ=255) gccatggaccgcagtaccccgccctccagatactgcgcgtccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAg < 5:77988‑M2/106‑1 (MQ=255) gagagGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCtgt > 2:282385/1‑107 (MQ=255) gagagGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCtgt < 1:282385/107‑1 (MQ=255) gagGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGc < 7:302944/149‑1 (MQ=255) cagGCCGCGCAGTATGAGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTAACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGc < 8:283081/148‑1 (MQ=255) GACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCggg > 8:311273‑M1/1‑149 (MQ=255) GACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCggg > 3:119588‑M1/1‑149 (MQ=255) GACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCgg > 3:176325‑M1/1‑148 (MQ=255) GACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCgg < 4:176325‑M1/148‑1 (MQ=255) gcgcAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGtt > 7:11724/1‑148 (MQ=255) cAGTATCTGGAGGGCGGGGGACTGCG‑GTCCATGGCATGAGGCTTTACAGCCTGAACTGGCCGCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCATCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:72163/149‑1 (MQ=37) aGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCAAACCACCGATGTGTGACAACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:367701/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACg < 1:272971/149‑1 (MQ=255) tACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAgcggcg < 3:327843/149‑1 (MQ=255) tGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTgg < 4:35853/109‑1 (MQ=255) tGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTgg > 3:35853/1‑109 (MQ=255) tGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCggcggc > 2:238096/1‑148 (MQ=255) ccATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGt > 5:338853‑M2/3‑148 (MQ=255) | TGGATCGACAGCTCGGCCGCGGTGTCGCAGGCGCTGGTGGGGCTGTACAAGGCGCTGGGTGGAGGCTGGCAGGCGTTTGATGAGCCGCCGCCGAATGCTCACGGTTAGAGAGGACGCGCAGTATCTGGAGGGCGGGGTACTGCG‑GTCCATGGCATGATGCTTTACAGCCTGTACTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAGCGGCCTGTGTCCAACCACCGATGTGTGTCCACCACCAATCTGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGT > NC_002947/1455814‑1456107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |