| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1519906 | 56 (0.950) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 6.8% | coding (246/1083 nt) | mraY | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide‑ transferase |
| ? | NC_002947 | = 1519929 | 56 (1.000) | coding (269/1083 nt) | mraY | phospho‑N‑acetylmuramoyl‑pentapeptide‑ transferase | |||||
GGCCCCTGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTGGCAATCGG > NC_002947/1519781‑1520075 | ggCCCCTGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGAAGGCCCGCAATCGCCCCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCGCCT‑TGAtgtg > 6:378534/1‑149 (MQ=255) gCCCCTGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGGCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGg > 4:327577‑M2/1‑148 (MQ=255) ccTGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCACTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggcc < 2:257078‑M2/149‑5 (MQ=255) tGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccga < 3:71249‑M2/149‑7 (MQ=255) gatgatCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGTCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGAcc > 8:129945/1‑149 (MQ=255) gatgatCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccgac > 1:365037‑M2/1‑141 (MQ=255) atCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGa < 3:241443/148‑1 (MQ=255) atCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGa < 2:184556/148‑1 (MQ=255) atACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAAc < 7:229326/148‑1 (MQ=255) tACCCTGCAAATTCGCCTGTTCGGCCAGGCCGTGCTTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCGAAGTCCGGCACGCCGACCATGGGTGGGTCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAAcc < 5:306472/149‑1 (MQ=255) cccTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCg > 2:305198/1‑148 (MQ=255) cAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGTGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCtatgt < 5:378534/149‑1 (MQ=255) cAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGa > 6:237989/1‑136 (MQ=255) cAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGa < 5:237989/136‑1 (MQ=255) aaTTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCtatgtat < 1:262896/149‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCtatgtatg < 7:342028/149‑1 (MQ=255) ttagCCACATCCGCCAGGCCGTTCGTAACGACTGCCCGCAAGCGCACCTGTCCAAGGCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTCGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATgg < 4:30078/146‑1 (MQ=255) ttCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATgg < 1:305198/149‑1 (MQ=255) gCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACGCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGtt < 7:27241/149‑1 (MQ=255) gCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGtt < 4:333660/149‑1 (MQ=255) ccAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTtg > 2:198182/1‑149 (MQ=255) aGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATCAGCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTtgt < 1:96284/149‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCACTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCTCTGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCt < 1:257078/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCAAGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCCACCGCTATGTATGGCTTGTGCTGATTg > 4:17083/1‑148 (MQ=255) aGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTc > 6:231691/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCAGACCTGAGCCACCGCTATGTATGGGGTGTGCTGATTGt > 4:42225/1‑148 (MQ=255) cGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGc < 7:129945/149‑1 (MQ=255) gacgGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCgg > 5:221457/1‑149 (MQ=255) gCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTggg > 6:341699/1‑149 (MQ=255) aCCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTc > 8:185614/1‑149 (MQ=255) cTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGa > 4:231292/1‑149 (MQ=255) tCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATG‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACATGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGAt < 3:17083/147‑1 (MQ=255) tCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGAt < 3:42225/147‑1 (MQ=255) tCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGa < 6:221457/149‑1 (MQ=255) tCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGa > 3:255207/1‑149 (MQ=255) cAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGAc > 8:236560/1‑148 (MQ=255) cAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGAc > 2:204218/1‑148 (MQ=255) cAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGAc > 2:66165/1‑148 (MQ=255) cAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGGATGGGTTGTGCTGATTGTCCCCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGAc > 4:319569/1‑148 (MQ=255) aaGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTa > 2:327282/1‑149 (MQ=255) cGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGTACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGc > 5:12278/1‑148 (MQ=255) cGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTAcc < 4:318286/146‑1 (MQ=255) cGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTAcc > 3:318286/1‑146 (MQ=255) cGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTCGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGc < 7:185614/148‑1 (MQ=255) aCCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGt > 3:349893/1‑149 (MQ=255) cGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATc < 5:369941/149‑1 (MQ=255) cATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGaaa < 1:198182/149‑1 (MQ=255) aTGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGaaaa < 5:341699/149‑1 (MQ=255) ggtgggGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGCTTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGaa < 1:239791/149‑1 (MQ=255) gtgggGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAAc < 1:66165/149‑1 (MQ=255) ggggCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTc < 4:349893/149‑1 (MQ=255) gggCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTcg > 1:132301/1‑149 (MQ=255) aTCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCt > 3:110151/1‑149 (MQ=255) tCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAATGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCtt < 1:204218/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccgacaggatcagcgccccacccatggtcggggtgccggacttggacaggtgcgattgcgggccgtcgttacgcacggcctggccgatctggcgaatttgcagggtacggatcat < 4:57323‑M2/149‑118 (MQ=255) cTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTccc > 5:278174/1‑149 (MQ=255) tGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccgacaggatcagcgccccacccatggtcggggtgccggacttggacaggtgcgattgcgggccgtcgttacgcacggcctggccgatctggcgaatttgcagggtacggatcatc < 6:11132‑M2/149‑119 (MQ=255) tGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccgacaggatcagcgccccacccatggtcggggtgccggacttggacaggtgcgattgcgggcagtcgttacgcacggcctggccgatctggggaatttgcagggtacggatcatc < 1:145508‑M2/149‑119 (MQ=255) tGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTcc > 7:200072/1‑148 (MQ=255) gTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGggccgacaggatcagcgccccacccatggtcggggtgccggacttggacaggtgcgattgcgggccgtcgttacgcacggcctggccgatctggcgaatttgcagggtacggatcatc < 1:177839‑M2/148‑119 (MQ=255) tCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGa < 7:236560/148‑1 (MQ=255) ggCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGc < 4:255207/148‑1 (MQ=255) aTC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTg > 5:201242/1‑149 (MQ=255) tC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTg > 8:329934/1‑148 (MQ=255) gCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGaa < 5:231691/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGt > 6:20822/1‑77 (MQ=255) ccGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGt < 5:20822/77‑1 (MQ=255) ccGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAg > 5:268390/1‑149 (MQ=255) cT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTgg > 5:145457/1‑148 (MQ=255) t‑tGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTGGc > 7:112711/1‑148 (MQ=255) gtgGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTGGCAATCgg > 2:89662/1‑149 (MQ=255) tgGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTGGCAATCg < 7:329934/147‑1 (MQ=255) | GGCCCCTGGATGATCCGTACCCTGCAAATTCGCCAGATCGGCCAGGCCGTGCGTAACGACGGCCCGCAATCGCACCTGTCCAAGTCCGGCACCCCGACCATGGGTGGGGCGCTGATCCTGTCGGCCATC‑GCCGTCAGCACCT‑TGCTGTGGGCCGACCTGAGCAACCGCTATGTATGGGTTGTGCTGATTGTCACCCTGGCGTTCGGTGCCATTGGCTGGGTCGATGACTACCGCAAGGTGATCGAAAAGAACTCGCGTGGCCTTCCGAGCCGCTGGAAGTACTTCTGGCAATCGG > NC_002947/1519781‑1520075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |