New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1612852 = | 46 (0.780) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 9.4% | coding (649/693 nt) | ung | uracil‑DNA glycosylase |
? | NC_002947 | 1612894 = | 35 (0.640) | coding (691/693 nt) | ung | uracil‑DNA glycosylase |
TGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTCCTG > NC_002947/1612760‑1613036 | tGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTg > 4:180963/1‑149 (MQ=255) ggTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTgg > 6:143945/1‑149 (MQ=255) gTTTTGATGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGTCGTATCTCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTTGGCACTTCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTgg < 6:342636/148‑1 (MQ=255) gTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTggg > 6:202864/1‑149 (MQ=255) gTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTgg < 7:343899/148‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTAc < 7:101018/148‑1 (MQ=255) ggTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCg > 6:108559/1‑149 (MQ=255) cATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCTACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCa < 1:131309/149‑1 (MQ=255) aTCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAg < 7:200604/149‑1 (MQ=255) gcTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGtcatgc < 1:94494/149‑1 (MQ=255) gCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGCGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCGGTGAGAACCCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTGATGCTCATgcg > 8:72351/1‑149 (MQ=255) gTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGcgcg > 6:254546/1‑149 (MQ=255) gcgGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTc < 7:150145/148‑1 (MQ=255) cgGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTcgc > 3:218558/1‑149 (MQ=255) cATCGGGTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGGGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCAGCGagccgcgc < 7:72351/148‑1 (MQ=255) aTCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCAGCGagccgcgca < 5:143945/148‑2 (MQ=255) tCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTgg < 5:202864/149‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCTGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTgg < 2:61055/146‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtgtg > 1:170329/1‑82 (MQ=255) gTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCtgtg < 2:170329/82‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCAGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTgg > 1:61055/1‑146 (MQ=255) ttGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCCAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCaa < 7:26664/149‑1 (MQ=255) gCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATg > 1:358857/1‑149 (MQ=255) cGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAACgg < 2:204504/149‑1 (MQ=255) cAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGt > 1:129478/1‑149 (MQ=255) aaCAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGtt > 5:125117/1‑149 (MQ=255) aaCAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGtt < 3:180963/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGgcg > 8:46063/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGgcg > 8:40306/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCTGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCAc < 2:62500/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCAc < 2:129478/149‑1 (MQ=255) gAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTa > 8:344512/1‑149 (MQ=255) CAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTc > 5:254546‑M1/1‑149 (MQ=255) gcgggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTcca > 7:69838‑M2/41‑149 (MQ=255) ggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTcgctgc > 8:69560‑M2/38‑98 (MQ=255) ggggcagtgcccagtcgatgggcccgagcccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTcgctgc < 7:69560‑M2/61‑1 (MQ=255) gCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCaa < 5:108559/149‑1 (MQ=255) ccATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAgg > 6:24010/1‑149 (MQ=255) gACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGt < 7:344512/149‑1 (MQ=255) aCTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGt > 6:157135/1‑148 (MQ=255) gggcccgagcccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGa < 8:69838‑M2/130‑1 (MQ=255) gggCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATg > 4:300051/1‑149 (MQ=255) aCTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCgg > 6:283311/1‑149 (MQ=255) cTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGgt < 5:157135/149‑1 (MQ=255) cccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTc < 5:283311‑M2/140‑1 (MQ=255) ccccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTcc > 3:355749‑M2/9‑149 (MQ=255) cccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACACAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTCCt > 6:312785‑M2/8‑149 (MQ=255) ccgctgTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTCCTg < 4:355749‑M2/143‑1 (MQ=255) | TGGTTTTGAAGTCGGTCCATCCTTCGCCGCTGTCGGCGTATCGCGGGTTCATCGGTTGCGGGCATTTCAGCCGTGCCAACAGCTTCCTCGAGCAGCGGGGGCTCGGGCCCATCGACTGGGCACTGCCCCCGCTGTGAGAAACCGCGGTGGGGTACGCAATCGCTCAGGGCGTCATGCTCATGCGCGGCTCGCTGCGCTGGCCAATGGCAATCCCCCGCTCATGGTTCTGGCGCACGTACTCCACCAAGGCTTCAAGGTCGGTGATGCCGGTGTCCTG > NC_002947/1612760‑1613036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |