New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3684225 | 57 (0.970) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.6% | coding (521/1284 nt) | PP_3250 | transporter |
? | NC_002947 | = 3684249 | 47 (0.840) | coding (545/1284 nt) | PP_3250 | transporter |
AGCGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTGGCAACCCGTTTACCGGC > NC_002947/3684104‑3684379 | aGCGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagc < 2:132006‑M2/149‑4 (MQ=255) cGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcgg > 4:276070‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcgg > 7:169435‑M2/1‑144 (MQ=255) cGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcgg > 7:174292‑M2/1‑144 (MQ=255) cTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGTCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGcggcgg < 1:26765/148‑1 (MQ=255) tCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTg > 3:235085/1‑149 (MQ=255) tCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTg > 7:303134/1‑149 (MQ=255) aTCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTctg > 3:68320/1‑149 (MQ=255) tCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTctgc > 7:342316/1‑149 (MQ=255) tGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTctgctg > 8:163993/1‑149 (MQ=255) ttttCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTggg > 5:333147/1‑149 (MQ=255) ttttCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTggg < 7:174092/149‑1 (MQ=255) tCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCa < 7:52580/148‑1 (MQ=255) cACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTc < 8:152018/137‑1 (MQ=255) cACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTc > 7:152018/1‑137 (MQ=255) cACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTa > 7:145356/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTctgc < 8:103385/139‑1 (MQ=255) aCCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTctgc > 7:103385/1‑139 (MQ=255) gggCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGa < 1:222437/149‑1 (MQ=255) cAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGAGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGacac < 4:351493/149‑1 (MQ=255) tGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTg > 6:70469/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAAc < 6:158384/148‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGc < 8:167631/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGGGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCt < 8:122502/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTg < 3:327645/149‑1 (MQ=255) tgctgGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTgg > 2:119560/1‑149 (MQ=255) tgGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGc > 4:73729/1‑147 (MQ=255) ggCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCGACGCTGGCGAg > 3:358188/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGa < 8:342316/147‑1 (MQ=255) ggCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAAc < 5:70469/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAAc < 1:132006/147‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCa > 6:353842/1‑149 (MQ=255) gcTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCaaa < 7:163993/149‑1 (MQ=255) gcTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCa < 6:203920/147‑1 (MQ=255) gcTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCa > 5:203920/1‑147 (MQ=255) cTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAAc < 6:333147/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAAcc < 3:359878/133‑1 (MQ=255) tCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAAcc > 4:359878/1‑133 (MQ=255) tCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAAcc > 3:71813/1‑149 (MQ=255) aGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAAcc < 4:68320/147‑1 (MQ=255) aGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCg > 2:207830/1‑148 (MQ=255) gTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGaa < 3:73729/149‑1 (MQ=255) cGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCAc < 4:26029/116‑1 (MQ=255) cGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCAc > 3:26029/1‑116 (MQ=255) tGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTcgc > 6:42391/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGc > 6:294976/1‑148 (MQ=255) tggtggCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGt > 6:281635/1‑149 (MQ=255) tggtggCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGt > 6:180348/1‑149 (MQ=255) gtggCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCGACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTgg < 4:358188/149‑1 (MQ=255) gtggCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGt < 5:353842/147‑1 (MQ=255) gcgcCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcggcgccaccagcaacgtgccaagcacggggccactgagcccgcccaggctggccccggctcccagcacacctaacagccgcttgccctggccggtcgaaaacagatcgccgag < 8:38161‑M2/148‑117 (MQ=255) gccgcTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcggcgccaccagcaacgtgccaagcacggggccactgagcccgcccaggctggccccggct > 7:320093‑M2/1‑30 (MQ=255) gccgcTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTagcggcgccaccagcaacgtgccaagcacggggccactgagcccgcccaggctggccccggct < 8:320093‑M2/93‑64 (MQ=255) gccgcTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAggg < 6:153001/126‑1 (MQ=255) cTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGGGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTGGCAACCCGtt < 3:298568/149‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTGGCAACCCGTTTAc > 5:262027/1‑149 (MQ=255) aTGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTGGCAACCCGTTTACCGgc < 8:145356/149‑1 (MQ=255) | AGCGTGCTCGCCGATCTGTTTTCCACCGCCCAGGGCAAGCGGCTGTTCGGTCTGCTGGCAGCCGGGGCCAGCCTGGGCGGGCTCAGTGGCCCCGTGCTTGGCACGTTGCTGGTGGCGCCGCTCGGCCATGCCGGGTTGTTGGTGCTAGCGGCGGTGCTTCTGCTGGGCAGTATCGGCGCGACACTGTTCCTGCAACGCTGGCGAGCACGCCAACCCATTGCGATGCAAACCGAACACCAGGGCTCGCGGCCACTGGGTGGCAACCCGTTTACCGGC > NC_002947/3684104‑3684379 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |