| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4738166 = | 55 (0.930) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.6% | coding (204/1773 nt) | sdhA | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit |
| ? | NC_002947 | 4738204 = | 48 (0.850) | coding (166/1773 nt) | sdhA | succinate dehydrogenase flavoprotein subunit | |||||
CCCATGTGGTCCAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCACCGATGATGATGGCGTCGAAGGAAATG > NC_002947/4738056‑4738352 | cggcatgcgcgcagcgctgcaactggctcaaggcggccacaagactgccgtagtcaccaaggtcttcccgacccgttcgcacaccgtatccgcccagggcggcatcacctGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCa > 4:69046‑M1/111‑149 (MQ=255) ccATGTGGTCCAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAg < 6:320300/149‑1 (MQ=255) cATGTGGTCCAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAgg < 4:287660/149‑1 (MQ=255) aTGTGGTCCAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGt > 3:308595/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATgccg > 5:25202/1‑149 (MQ=255) agcgctgcaactggctcaaggcggccacaagactgccgtagtcaccaaggtcttcccgacccgttcgcacaccgtatccgcccagggcggcatcacctGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAg > 6:331154‑M1/99‑138 (MQ=255) agcgctgcaactggctcaaggcggccacaagactgccgtagtcaccaaggtcttcccgacccgttcgcacaccgtatccgcccagggcggcatcacctGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAg < 5:331154‑M1/40‑1 (MQ=255) gTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGccc > 7:267697/1‑149 (MQ=255) gAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACGGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTggg > 1:96423/1‑149 (MQ=255) gAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTggg > 3:343961/1‑149 (MQ=255) aaGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGc < 5:327374/149‑1 (MQ=255) gACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCTGGGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑gg < 4:343961/149‑1 (MQ=255) aCCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGa < 2:96423/149‑1 (MQ=255) ccTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑c < 4:308595/147‑1 (MQ=255) ccTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑c < 6:293839/147‑1 (MQ=255) ccTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑Cgg > 5:340799/1‑149 (MQ=255) cTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑Cgg < 5:38668/148‑1 (MQ=255) acaTGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCgg > 5:247496/1‑148 (MQ=255) aTGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGaa > 4:64342/1‑149 (MQ=255) tGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTc > 8:2760/1‑143 (MQ=255) tGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTc < 7:2760/143‑1 (MQ=255) tATTCCATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGCATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGa < 4:287727/148‑1 (MQ=255) cGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCtt < 8:267697/148‑1 (MQ=255) aTAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑TGGGTCGGGAAGACCTTGGt < 5:82258/149‑1 (MQ=255) cGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGt > 6:123809/1‑145 (MQ=255) cGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGt < 5:123809/145‑1 (MQ=255) tCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑Cg > 7:236367/1‑114 (MQ=255) tCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑Cg < 8:236367/114‑1 (MQ=255) aCCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACTGCAGTCt > 4:201374/1‑149 (MQ=255) gATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGAcc > 6:360811/1‑127 (MQ=255) gATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGAcc < 5:360811/127‑1 (MQ=255) gAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCTTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGgccgc < 2:258556/145‑1 (MQ=255) gAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGgccgc > 1:258556/1‑145 (MQ=255) gAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTg < 6:247496/149‑1 (MQ=255) aCCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAg < 4:296533/149‑1 (MQ=255) aCGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTg < 6:340799/149‑1 (MQ=255) cGGTATCGTACATGTGCCCGCGCCAGGCGTCGGTCGGGTCGGCCGCAGCGAGGGCGCAGGTGAGGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGGCGGGAAGCCCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGCGCCAGTTg > 6:377169/1‑148 (MQ=255) ggTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTg > 5:5494/1‑147 (MQ=255) gTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTg > 3:281716/1‑149 (MQ=255) tACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGCGGGGTAGAGGGGTGGGAACCGGGTAGGGAAAACCTTGGTTACAACGGCATTATTTTTGCCGCCTTTACCCAATTTCCgcgc > 1:299452/1‑149 (MQ=255) tACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTgc > 3:317376/1‑149 (MQ=255) cATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGACGCCtt > 7:248796/1‑128 (MQ=255) cATGTGCCAGCGCCAGGCGGCGGTCGGTGCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGGGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCtt < 8:248796/128‑1 (MQ=255) aTGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGt < 8:290254/101‑1 (MQ=255) aTGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGt > 7:290254/1‑101 (MQ=255) gtgCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCa > 4:111767/1‑149 (MQ=255) tgCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGACAGTTGCAGCGCTGCGCGCa < 3:201374/148‑1 (MQ=255) ctgcgccatcgcttcggccgacccgaacgacgactggcgcAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCt < 5:331154‑M2/98‑1 (MQ=255) ctgcgccatcgcttcggccgacccgaacgacgactggcgcAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCt > 6:331154‑M2/41‑138 (MQ=255) tgcgccatcgcttcggccgacccgaacgacgactggcgcAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCg > 4:69046‑M2/40‑149 (MQ=255) aGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCg > 1:93586/1‑149 (MQ=255) CGCCAGTCGTCGTTCGGGGCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGGGCGAA‑CGGGGCGGGAAGACCGTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTGGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGgc > 5:377169‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGACGCCTTGAGCCAGTTGCATCGCTGCGCGCATGCCGgcg < 8:263265‑M1/149‑1 (MQ=255) CAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGgcgc < 7:107080‑M1/148‑1 (MQ=255) CAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGgcgc > 8:107080‑M1/1‑148 (MQ=255) gtcgtTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGcgccgccg < 2:93586/148‑1 (MQ=255) cgtTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCa > 4:241629/1‑149 (MQ=255) gtTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCa < 6:25202/148‑1 (MQ=255) gtTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCAc > 8:35927/1‑149 (MQ=255) gtTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAAACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCAc > 1:300219/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCACCgatgatgat > 8:132803/1‑149 (MQ=255) ctggcgcAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCACCGATGATGATGGCGTCGaa < 3:69046‑M2/142‑1 (MQ=255) aGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCACCGATGATGATGGCGTCGAAGGAAATg < 6:5494/149‑1 (MQ=255) | CCCATGTGGTCCAGTTCGAAGACCGCAGCCGGGCCTTCCTGACACATGTATTCGATAGCGTCCTGGTCACCGATGTAGTCGGAACCCTTGACGGTATCGTACATGTGCCAGCGCCAGTCGTCGTTCGGGTCGGCCGAAGCGATGGCGCAGGTGATGCCGCCCTGGGC‑GGATA‑CGGTGTGCGAA‑CGGGTCGGGAAGACCTTGGTGACTACGGCAGTCTTGTGGCCGCCTTGAGCCAGTTGCAGCGCTGCGCGCATGCCGGCGCCGCCGCCACCGATGATGATGGCGTCGAAGGAAATG > NC_002947/4738056‑4738352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |