New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4819815 = | 47 (0.800) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 9.5% | coding (11375/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | 4819867 = | 31 (0.540) | coding (11323/12954 nt) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
GAAGCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCTC > NC_002947/4819719‑4820014 | gAAGCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCtt < 4:268706/149‑1 (MQ=255) aaGCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGTCAGGTAGCCGGCGCCGGCCtt > 2:288442/1‑148 (MQ=255) aGCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGa < 3:304782/149‑1 (MQ=255) gCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGaa < 3:86528/149‑1 (MQ=255) gCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGaa < 7:219893/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCt > 5:258803/1‑149 (MQ=255) gCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCTCCGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGcc > 1:209827/1‑149 (MQ=255) cGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCcg < 4:62419/143‑1 (MQ=255) cGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCcg > 3:62419/1‑143 (MQ=255) aaCTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGc > 5:106719/1‑136 (MQ=255) aaCTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGc < 6:106719/136‑1 (MQ=255) ccgccCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCACCACTGGCGTCCGGCTGAGCTGGATGATGCATTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGCCAGGTAACCCGCGCCCGCCTAGAACCTGCCGACGATCATGCCcagca > 5:175777/1‑149 (MQ=255) cccTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCgg > 2:292366/1‑149 (MQ=255) gttGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGc < 2:218721/147‑1 (MQ=255) ccTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCgg > 1:89927/1‑148 (MQ=255) cTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCCGCAGCGGc > 3:20036/1‑148 (MQ=255) gcAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGc < 6:302359/128‑1 (MQ=255) gcAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGc > 5:302359/1‑128 (MQ=255) gcAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCt > 5:195177/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCgg > 1:283878/1‑148 (MQ=255) cgcTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGTCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGc < 1:288442/149‑1 (MQ=255) gcTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAg > 7:285500/1‑147 (MQ=255) gcTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCa < 2:129144/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCActggctg < 1:292366/149‑1 (MQ=255) gcgggATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCg < 6:258803/146‑1 (MQ=255) gatgatGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCa < 4:20036/148‑1 (MQ=255) tgCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGccac > 5:176844/1‑148 (MQ=255) cTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAg < 2:283878/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAgc < 6:195177/147‑1 (MQ=255) ggccggcgccggctacctgccgctggacccgggcctgccggcggcgcgcctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATgg > 3:90835‑M2/52‑149 (MQ=255) GGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATgg < 5:122298‑M1/149‑1 (MQ=255) gccggcgccggctacctgccgcgggacccgggcctgccggcggcgcgcctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCCCTGGCTGGTCCACGCCGACGCCGGCAGCCCCCCGCGCATGGc > 7:234102‑M2/51‑149 (MQ=255) GCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCAc > 5:94593‑M1/1‑120 (MQ=255) GCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCAc < 6:94593‑M1/120‑1 (MQ=255) ccggcgccggctacctgccgctggacccgggcctgccggcggcgcgcctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGcc > 3:83053‑M2/50‑149 (MQ=255) cgccgGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGc > 1:363598/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTg > 2:188610/1‑149 (MQ=255) gggTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAg < 6:150385/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGtt > 2:287028/1‑147 (MQ=255) gCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGc > 7:45515/1‑149 (MQ=255) gCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGc > 1:149423/1‑149 (MQ=255) aGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGc < 8:285500/149‑1 (MQ=255) cggcgcgcctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATa < 4:90835‑M2/139‑1 (MQ=255) cgccggcCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAg < 5:285202/149‑1 (MQ=255) cgccggcCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAg < 6:122298/149‑1 (MQ=255) gccggcCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAgg < 8:45515/149‑1 (MQ=255) gccggcCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAg > 1:15803/1‑148 (MQ=255) cggcCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGAt < 2:209827/149‑1 (MQ=255) gcctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGc < 1:287028‑M2/145‑1 (MQ=255) ctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCGCGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCt > 1:203030‑M2/3‑149 (MQ=255) ctTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCt > 2:155714‑M2/3‑149 (MQ=255) tTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGTCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCTc > 1:270163‑M2/2‑149 (MQ=255) tTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCTc > 1:68405‑M2/2‑149 (MQ=255) tTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCTc > 7:242023‑M2/2‑149 (MQ=255) | GAAGCCTCCAGCTCACCGAGCAACTGCCGCCCCTGCT‑CGGCGCAGGCCGCGCTGCACACCAGCACTGGCGTGCGGCTGAGCTGGATGATGCTTTGCAGGCGCGCCGCCGGCAGGCCCGGGTCCAGCGGCAGGTAGCCGGCGCCGGCCTTGAAGCTGCCGACGATCATGCCCAGCAGCGGCAACCCACGCTCGGCAAGCAGTGCCACTGGCTGGTCCACGCAGACGCCGGCAGCCACCAGCGCATGGCCCAGGCGGTTGGCCGCCAGGTTCAGCCCGGCGTAATCATAGGATGCCTC > NC_002947/4819719‑4820014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |