New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5404550 | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 5.7% | coding (670/801 nt) | PP_4748 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5404646 | 64 (1.160) | coding (574/801 nt) | PP_4748 | amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
GCGTGCAAGGCCTGGATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCA > NC_002947/5404504‑5404793 | gCGTGCAAGGCCTGGATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAgccgcc < 8:126672‑M2/149‑7 (MQ=255) tcatcgCCTGGATATTCTTGCCCAGTGCGTCGCCCTGGGCGGCGTTGGCCGTGTTGTCCGTGAAGGCGGTCTGCTGGGGCTGAAGTGTGGCCTTGAGCCGTTGATCGGGCTCGGACATCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTc < 2:312057/144‑1 (MQ=255) cTGGATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGAGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATAGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCtgctgc > 3:268035/1‑148 (MQ=255) ggATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCg > 1:63975/1‑147 (MQ=255) gATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCg > 4:276826/1‑146 (MQ=255) ttCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAAc < 5:153188/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACg > 7:76078/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGGCGGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACg < 1:214607/146‑1 (MQ=255) gCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGc < 1:181808/147‑1 (MQ=255) ccAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCAcc > 1:246593/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACAGCCa < 2:205605/146‑1 (MQ=255) cAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCATGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACAGCCa > 1:205605/1‑146 (MQ=255) tGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACcgcg > 7:96873/1‑148 (MQ=255) ccTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCga > 1:360430/1‑130 (MQ=255) ccTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCga < 2:360430/130‑1 (MQ=255) cTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGc > 7:213811/1‑149 (MQ=255) tCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑t > 3:142119/1‑149 (MQ=255) tCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGACCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑t > 3:18837/1‑149 (MQ=255) cGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAgccgccctgggcgaggcactgggcaagaatatccaggcct < 3:242341‑M2/149‑41 (MQ=255) gCCCTGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGt < 3:46199/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAgccgccctgggcgaggcactgggcaagaatatccaggccttgcac < 4:357392‑M2/149‑46 (MQ=255) aGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCcgc > 4:77967/1‑149 (MQ=255) ggTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATgcgc < 4:142119/148‑1 (MQ=255) gtACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTg > 4:16060/1‑148 (MQ=255) cGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCACCCTGGATGCGCCTGGACg > 5:122185/1‑149 (MQ=255) gggAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGt < 3:233331/149‑1 (MQ=255) ggAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTc < 8:42987/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGTCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCa < 3:16060/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCa < 8:96873/149‑1 (MQ=255) aaGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAg < 6:44350/149‑1 (MQ=255) aGGAGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAgg < 8:153071/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTa > 8:37583/1‑75 (MQ=255) ggCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTa < 7:37583/75‑1 (MQ=255) cgcTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTcc > 8:202882/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTgg < 2:63975/147‑1 (MQ=255) cccGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAgccgccctgggcgaggcactgggcaagaatatccaggccttgcacgcctcgggcgaaatcgcagaaatcctcgcctcgtttg > 4:242341‑M2/1‑66 (MQ=255) cccGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCa > 4:7997/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCAc > 4:93973/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCAc > 1:298024/1‑149 (MQ=255) gCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACgggg > 3:186603/1‑149 (MQ=255) gCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACgggg > 4:338752/1‑149 (MQ=255) tgggattGCCCCGTTGAGCGGGCCCGTCCACCTTTATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTCCGAAGCAACGGCCACCGCGACGC‑TGCCCGCGCCAACCTTGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGTGCCTTGGCCACGGGGCTc < 4:268035/144‑1 (MQ=255) gCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCgg > 1:364398/1‑149 (MQ=255) gCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCg < 8:168479/148‑1 (MQ=255) gCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCg < 4:186603/148‑1 (MQ=255) ccTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCggg < 7:202882/149‑1 (MQ=255) cTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCggg > 8:274627/1‑148 (MQ=255) ggatctcGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTa < 7:138061/143‑1 (MQ=255) gACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTag < 3:231144/148‑1 (MQ=255) aCCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTaga < 3:93973/148‑1 (MQ=255) ccGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCa > 3:340968/1‑149 (MQ=255) gTTGGTCGGGCGCGGCCACCATGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCGTATGCGGCGAAGAAACGGCCACCCCGCAGC‑TGTGCGCGCCAACCAGGCTGCGCCGGGACGTCAGGGCCAGGGCCCAGGCCCCCGGGGTGGGGGagggagcg > 8:138061/1‑143 (MQ=255) gTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAgccgccctgggcgaggcactgggcaagaatatccaggccttgcacgcctcgggcgaaatcgcagaaatcctcgcctcgtttggcctggaccgcgaggctgcaaaagtgg > 3:357392‑M2/1‑40 (MQ=255) gTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAc > 1:274606/1‑148 (MQ=255) gTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCAc > 4:95087/1‑148 (MQ=255) ttGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGGCGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCa < 7:126672/149‑1 (MQ=255) tCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGtt < 8:213811/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATc < 3:95087/149‑1 (MQ=255) acCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGc > 4:337323/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCtt > 2:11062/1‑149 (MQ=255) gATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttc < 2:246593/148‑1 (MQ=255) gATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttc < 3:276826/148‑1 (MQ=255) aTGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttctt < 7:274627/149‑1 (MQ=255) aTGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttct > 8:351906/1‑148 (MQ=255) aTGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttct < 4:18837/148‑1 (MQ=255) tctTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATc > 1:254567/1‑130 (MQ=255) tctTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATc < 2:254567/130‑1 (MQ=255) tctTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCaaa > 5:223447/1‑149 (MQ=255) tctTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTATGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGCATGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCa > 1:92224/1‑148 (MQ=255) ttGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCaaa < 7:351906/147‑1 (MQ=255) ttGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCaaa < 6:223447/147‑1 (MQ=255) ccGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTc < 3:7997/149‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttct < 8:179257/133‑1 (MQ=255) tAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTttct > 7:179257/1‑133 (MQ=255) tAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTccaccca < 2:364398/149‑1 (MQ=255) | GCGTGCAAGGCCTGGATATTCTTGCCCAGTGCCTCGCCCAGGGCGGCGTTGGCCTTGGTGTACGGGAAGGCGCTCTGCCCGGGCTCAAGCGTGGCCTTGACCCGTTGATCGGGCTCGGACACCTTGATGCTCTTGCCGG‑GGTAGCCGCCCTTCTGCTGCGAAGAAACGGCCACCGCGAAGC‑TGTCCGCGCCAACCTGGATGCGCCTGGACGTCAGGTCCTGGGCCATGGCCACGGGGTTCGGGTAGAGCACCAGGTTATCACCAAAGGCTTTCTTCAAATCGTCCACCCA > NC_002947/5404504‑5404793 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |