| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5727157 = | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 5.3% | coding (1481/1680 nt) | opgG | glucans biosynthesis protein G |
| ? | NC_002947 | 5727201 = | 74 (1.330) | coding (1437/1680 nt) | opgG | glucans biosynthesis protein G | |||||
GTTGTTCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGGGCGGCAAGC > NC_002947/5727053‑5727348 | gttgttCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGAc > 4:127354/1‑149 (MQ=255)ggtgatCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCCCCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGAc < 1:197856/144‑1 (MQ=255) ggCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTcc < 2:233035/148‑1 (MQ=255) gCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCt < 4:179851/148‑1 (MQ=255) gATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGAc < 8:6056/149‑1 (MQ=255) gATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGAc > 4:348208/1‑149 (MQ=255) cTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCa < 5:146898/149‑1 (MQ=255) tCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAg > 5:359058/1‑149 (MQ=255) tCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAg > 5:125710/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAgg > 8:20377/1‑149 (MQ=255) ccTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGgcg > 5:324722/1‑148 (MQ=255) ccTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGgcg > 5:318845/1‑148 (MQ=255) cTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCa < 3:348208/149‑1 (MQ=255) ttGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAg > 3:311351/1‑149 (MQ=255) tGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGgcgcct > 8:307368/1‑146 (MQ=255) gtcGGCTTTGTGGGCCTTGGCTTGCTTGGCTGGGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAgg < 8:56969/146‑1 (MQ=255) ggCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGt > 8:304324/1‑147 (MQ=255) ggCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGt > 2:162647/1‑147 (MQ=255) gCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAg < 1:360455/149‑1 (MQ=255) tctcGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGgc < 2:176300/147‑1 (MQ=255) tcGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGgcgc > 5:35065/1‑147 (MQ=255) cTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGCTGTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGccc > 1:61439/1‑149 (MQ=255) ggCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg < 6:359058/148‑1 (MQ=255) gCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGt > 2:232325/1‑149 (MQ=255) aTGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGtct > 5:210551/1‑149 (MQ=255) aTGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGtct > 3:105709/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGtct > 1:179903/1‑147 (MQ=255) cTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCa < 7:100845/148‑1 (MQ=255) cTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCAACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAg > 5:55558/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAggg < 2:87073/148‑1 (MQ=255) ggCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAgg < 1:162647/147‑1 (MQ=255) gCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATATCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGt > 2:167558/1‑148 (MQ=255) gCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCCGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTta > 6:347132/1‑147 (MQ=255) ggCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGTCGCGCATTTCGGTAGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCACGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAgc > 5:33872/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAgc < 2:61439/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTGATTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg < 1:76289/131‑1 (MQ=255) cTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTg > 2:76289/1‑130 (MQ=255) ttGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAgcg > 4:289261/1‑146 (MQ=255) gTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGAt > 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gTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGgcggcg > 7:138111/1‑149 (MQ=255) cggcgCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCt > 8:87316/1‑149 (MQ=255) ggcgCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCtt < 2:243632/149‑1 (MQ=255) cgcgcATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTcc < 3:361781/149‑1 (MQ=255) cgcgcATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTcc < 1:152864/149‑1 (MQ=255) gcgcATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCg > 4:331471/1‑149 (MQ=255) cgcATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTTTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCCAGGCGGCGTCTTCCgg > 7:331782/1‑149 (MQ=255) cggtcgaCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCgg > 6:39706‑M2/8‑142 (MQ=255) cggtcgaCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCgg < 5:39706‑M2/135‑1 (MQ=255) ggtcgaCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGggcgg > 3:159227‑M2/7‑149 (MQ=255) aCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGGGCGGCAAGc < 7:304324‑M2/148‑1 (MQ=255) aCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGGGCGGCAAGc > 5:124920‑M2/2‑149 (MQ=255) aCTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGGGCGGCAAGc < 4:318871‑M2/148‑1 (MQ=255) | GTTGTTCGGCCTTGGCAGATTGCTCAGCCTTGACGGCTTTCTCGGCCTTGGCATGCTTGGCTGCGGCCTTGTCCTGCTTGGC‑GTCCTGGGCAGGCTTGGCAGGCTCGACCGGTACATCACGCACCAGTGCGGCGCGCATTTCGGTCGACTTG‑TTGGCTTCCTTGACCTTCAGGCGCAGGGTCAGGCGCCAGCCCTTGGTCTCAGGGTTATAGCGCAGATTGTTCTCGACCACCTCGGCGTTGTCGCCCACGCTGATCTGGCTGCGCACGGCGGCGTCTTCCGGCAGGGCGGCAAGC > NC_002947/5727053‑5727348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |