New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 196941 | NA (NA) | 9 (0.160) | 5/248 | NT | 7.5% | coding (2447/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 197221 | 114 (1.930) | coding (2727/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
CGCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAAcggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/196794‑196941 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGGGGTCAGTTGCTC < NC_002947/197221‑197072 ccCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACTTACACCGTGACCCTGAGCAACCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACCGTGACCCTGTCCAAC < 2:271358/147‑1 CGCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAAC < 5:376145/149‑1 cCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACG < 7:133243/148‑1 cCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTAATCACCTACACCGTGACACTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCAAACG > 8:181395/2‑149 CCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGG > 4:91974/1‑149 CGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGC > 8:17337/1‑149 CGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGC < 2:320040/149‑1 CGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGC < 6:313673/149‑1 CACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACG > 6:347997/1‑137 CACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTAATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACG < 5:347997/137‑1 ACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACTTACACCGTGACCCTGAGCAACCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACCGTGACCCTGTCCAACG < 8:67604/129‑1 ACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACTTACACCGTGACCCTGAGCAACCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACCGTGACCCTGTCCAACG > 7:67604/1‑129 GCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACGTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGTTGGACAGGGTCCCTGT‑CACCGGCGTCT > 1:159552/1‑112 TGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAAC < 8:204509/98‑1 TGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAAC > 7:204509/1‑98 CCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCT > 3:115875/1‑149 AGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTATGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGC > 2:159552/1‑112 AGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCG < 1:339708/83‑1 AGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCAAGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCG > 2:339708/1‑83 ACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGC > 4:233099/1‑149 ACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTACGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGG > 7:202625/1‑112 GCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCG > 8:115768/1‑149 CGGT‑GACAGTGACCCTGT‑CACCGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGG > 5:315737/1‑149 ACCCTGTCCAACGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGG < 7:115768/149‑1 CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGGTTCGGGGTCAGT < 2:277755/145‑1 CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGGTTCGGGGTCAGT > 1:277755/1‑145 CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGGGGTCAGTTGCT > 6:294857/1‑149 CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGGGGTCAGTTGCT > 5:112987/1‑149 CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGGGGTCAGTTGCT > 1:376092/1‑149 GGCGTCTGGTCAGGCTTGCGCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGGGCCCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTC < 5:310214/149‑1 CGCCGGCTCAGACCACGATCAACGACTCGGTCGATGCCACCACCGCGACCCTGACGGCGAGCCCGTCGGTCACCGAAGGCGGCGTGATCACCTACACCGTGACCCTGAGCAATCCTGCCCAGACGCCGGT‑GACAGTGACCCTGTCCAAcggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/196794‑196941 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTCTGGGCAGGATTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATTACGCCGCCTTCGGTGACCGACGGGCTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCATCGACCGAGTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGGGTCGGATTCGGGGTCAGTTGCTC < NC_002947/197221‑197072 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |