New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 372927 | 52 (0.880) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.8% | coding (169/1953 nt) | dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
? | NC_002947 | = 372955 | 48 (0.870) | coding (197/1953 nt) | dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
TACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/372775‑372927 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccacgtggGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGCAGGTCCACCAGGTAGCGGCGCGGCATGGCCAGCAGGCCGCCGATCAGGTTGACCTTGGACGGCCGGCCACGGCGCCACAT < NC_002947/372955‑372837 TACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCAC > 5:279333/1‑149 CCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGT > 1:185154/1‑149 CCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGT < 2:370917/149‑1 CCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCA < 5:129266/146‑1 CCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTG > 3:17983/1‑149 CAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCAC < 3:282899/116‑1 CAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCAC > 4:282899/1‑116 GGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTGGGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGT < 4:324668/149‑1 GCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTGGGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGC > 7:149629/1‑79 GCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTGGGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGC < 8:149629/79‑1 CACGTGGGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGCAGGTCCACCAGGTAGCGGCGCGGCATGGCCAGCAGGCCGCCGATCAGGTTGACCTTGGACGGCCGGCCACGGCGCCACAT < 5:15698/126‑1 CACGTGGGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGCAGGTCCACCAGGTAGCGGCGCGGCATGGCCAGCAGGCCGCCGATCAGGTTGACCTTGGACGGCCGGCCACGGCGCCACAT > 6:15698/1‑126 TACCCATCCTGCTGTTCGCTGCCCTTGGCCTGGCAGTGCTCGGTGCCTTGCGCCGGGTGCGCATGTGGCGCCGTGGCCGGCCGTCCAAGGTCAACCTGATCGGCGGCCTGCTGGCCATGCCGCGCCGCTACCTGGTGGACCTGCACCACGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/372775‑372927 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccacgtggGTCTTGGACATGTATTTGTCGCGCTCAACCACGTGGTGCAGGTCCACCAGGTAGCGGCGCGGCATGGCCAGCAGGCCGCCGATCAGGTTGACCTTGGACGGCCGGCCACGGCGCCACAT < NC_002947/372955‑372837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |