New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 785785 = | 52 (0.880) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.3% | coding (141/3831 nt) | PP_0672 | sensory box protein |
? | NC_002947 | 785818 = | 52 (0.920) | coding (108/3831 nt) | PP_0672 | sensory box protein |
GGGCGGCAGGTGTCGGTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAGGTTGGTCAAGCGTT > NC_002947/785637‑785930 | tcattccctgccatcgccagcccaatcgcaggatcaacgcttgaccaaccttactcatccgtcgtcattgcgttccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgc < 3:159916‑M1/1‑1 (MQ=255) gcggcAGGTGTCGGTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCGAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCGTGGGTAGGCTGGAAC‑Tg > 4:360847/1‑149 (MQ=255) ttccctgccatcgccagcccaatcgcaggatcaacgcttgaccaaccttactcatccgtcgtcattgcgttccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgC‑Tgg > 6:32140‑M1/146‑149 (MQ=255) gcAGGTGTCGGTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGc < 8:325521/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAAc > 8:80911/1‑149 (MQ=255) gTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGc > 7:201321/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCcaca < 1:361086/149‑1 (MQ=255) cAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCAcag > 2:303412/1‑148 (MQ=255) ggtagggtTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCAcagcagc < 4:247861/149‑1 (MQ=255) gtTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGcc > 7:327303/1‑148 (MQ=255) caccacGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCcag > 4:32564/1‑147 (MQ=255) ccacGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCcagcag > 4:277137/1‑148 (MQ=255) acGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGa > 3:47238/1‑148 (MQ=255) tCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCa < 7:20931/147‑1 (MQ=255) tCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCa > 8:20931/1‑147 (MQ=255) cACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAgg < 2:38956/148‑1 (MQ=255) cACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAgg < 8:327303/148‑1 (MQ=255) aCGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGc > 4:317946/1‑149 (MQ=255) ggCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCca < 4:47238/149‑1 (MQ=255) cgcCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGcagcgcca > 8:165952/1‑149 (MQ=255) ttGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCAcagcagcag > 1:17987/1‑116 (MQ=255) ttGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCAcagcagcag < 2:17987/116‑1 (MQ=255) gcCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCca < 6:323953/130‑1 (MQ=255) gcCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCca > 5:323953/1‑130 (MQ=255) ccATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAACACGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCtt < 1:303412/149‑1 (MQ=255) attgcgttccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGcc > 7:306360‑M1/83‑112 (MQ=255) attgcgttccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGcc < 8:306360‑M1/30‑1 (MQ=255) tGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATc < 3:317946/149‑1 (MQ=255) gTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATc > 7:148339/1‑148 (MQ=255) gTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATc > 3:263851/1‑148 (MQ=255) ttCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGAt > 8:60589/1‑146 (MQ=255) ttCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGAt < 7:60589/146‑1 (MQ=255) cAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGAc < 4:189859/148‑1 (MQ=255) ccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCcagca < 3:187068‑M1/35‑1 (MQ=255) ccgccccacaagcacccgcgactctcctgcgcgggtcgatcaagggtgcgctggcgctgctggccctgatcctgC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCcagca > 4:187068‑M1/75‑109 (MQ=255) gCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCcgc > 1:41220/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCcgcg < 3:32732/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAg < 8:201321/149‑1 (MQ=255) gtCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGgaga < 3:277137/148‑1 (MQ=255) aGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCggg < 3:32564/149‑1 (MQ=255) gTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGt < 4:263851/149‑1 (MQ=255) ccGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGc < 7:165952/148‑1 (MQ=255) gcgGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAgg < 3:132232/93‑1 (MQ=255) gcgGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAgg > 4:132232/1‑93 (MQ=255) ggAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTtgtg > 1:152380/1‑149 (MQ=255) gAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTgg < 7:80911/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCgg < 6:34935/132‑1 (MQ=255) ccAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCgg > 5:34935/1‑132 (MQ=255) gCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTgg < 4:345616/138‑1 (MQ=255) gCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTgg > 3:345616/1‑138 (MQ=255) ctctGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCaa < 3:360847/149‑1 (MQ=255) tGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGGATGCTTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAAt < 7:132762/147‑1 (MQ=255) ttGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTTAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATgacga > 1:9334/1‑149 (MQ=255) cAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGAt < 2:41220/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAgg < 4:112004/149‑1 (MQ=255) gTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCa < 6:367151/124‑1 (MQ=255) gTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCa > 5:367151/1‑124 (MQ=255) tGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAGGTTgg < 7:222092/145‑1 (MQ=255) tGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAGGTTgg > 8:222092/1‑145 (MQ=255) aaC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAGGTTGGTCAAGCGtt > 5:212556/1‑148 (MQ=255) | GGGCGGCAGGTGTCGGTGCATCAGGGTAGGGTTGCACCACGTTCACGGCCTGTTGCGCCTTGAGCGCCATGTTCAGGCTCAGGTGGTCGGCCAGTTCCGCGGAGGCGTCCAGGCTCTGTTTGCGCAATTCGGCCTGGGTATGATTGAAC‑TGGGCGAACAGCTGCCACAGCAGCAGGCCCAGCAGGATCAGGGCCAGCAGCGCCAGCGCACCCTTGATCGACCCGCGCAGGAGAGTCGCGGGTGCTTGTGGGGCGGAACGCAATGACGACGGATGAGTAAGGTTGGTCAAGCGTT > NC_002947/785637‑785930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |