New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1126593 = | 34 (0.580) | 7 (0.120) | 7/248 | NT | 20.0% | intergenic (‑47/+102) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1126650 = | 23 (0.400) | intergenic (‑104/+45) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
AGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAA‑CCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACA > NC_002947/1126446‑1126735 | gaaggcaagtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGc < 1:19826‑M1/2‑1 (MQ=255) cagttCGGCAATCCGCGCAGCGGAGCTCAGCGGGCCGACCATGTGGTAGCTGGCGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCgg < 4:44851/146‑1 (MQ=255) aggcaagtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCgg > 6:298082‑M1/146‑149 (MQ=255) ggcaagtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgctacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCgg > 8:137724‑M1/145‑148 (MQ=255) ggcaagtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCggg > 8:308162‑M1/145‑149 (MQ=255) ggcaagtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCggg > 5:57917‑M1/145‑149 (MQ=255) cTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGt > 3:306778/1‑149 (MQ=255) ttCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGtt > 6:335709/1‑149 (MQ=255) agtactggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTa > 7:117784‑M1/141‑149 (MQ=255) cAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAccc < 5:335709/149‑1 (MQ=255) ctggccgccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCcg < 2:210637‑M1/13‑1 (MQ=255) aCCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCcgc > 8:201757/1‑148 (MQ=255) ccGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTAAACCcgcgc < 4:204310/149‑2 (MQ=255) gcgcAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAACCGCGAAt > 2:19826/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGACGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTCCACCTCCTGCCAGGTACTTGGGAGGACATTGAGCACTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAt > 5:183277/1‑149 (MQ=38) gccggtcggccgggtcgacaacgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccaccgggcttgggtggcgggcgctgtgtaggagccg < 8:160126‑M1/4‑3 (MQ=255) gcggcgCGCATCGGGCCTACCGTGTGGGAGATGGAGGGGCAGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGTACATTGATCCGTGTAGGCGCGGGTTTAGCCGCGAATGCGGa < 6:183277/149‑1 (MQ=38) cggcgCGCATCGGGCCTTCCGTCTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCAGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAg < 5:373117/149‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGt < 8:178328/149‑1 (MQ=255) gcATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAg < 2:307887/149‑1 (MQ=255) gCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTTCCCGCGAATGGGGAGGTATAGGCACCAt > 4:141137/1‑149 (MQ=255) gACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGc < 4:77222/149‑1 (MQ=255) cgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTAc > 2:204645‑M1/110‑119 (MQ=255) cgtgttcggcgaccgcaacctggtgtgcgcctgcccgtcgatcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTAc < 1:204645‑M1/10‑1 (MQ=255) gtgtGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTTACATGTGGACCTCCTTCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTc < 7:167213/149‑1 (MQ=255) gtgtGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTc < 6:309406/149‑1 (MQ=255) gtgGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGAGATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTcgc > 5:77848/1‑149 (MQ=255) gggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 7:148667/149‑1 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGCCGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 5:326819/148‑1 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 6:77848/148‑1 (MQ=255) ggAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg > 6:326819/1‑148 (MQ=255) ggggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGa > 1:128453/1‑107 (MQ=255) ggggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGa < 2:128453/107‑1 (MQ=255) ggCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAA‑cccgctc < 4:306778/149‑6 (MQ=255) gatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGCAAGCGGAGGGTAAGGCACCAACCCCATCGCCGG‑TGAAC‑CCGCACCCACACagcc > 6:150081/1‑147 (MQ=255) gAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGccc < 3:141137/146‑1 (MQ=255) tcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg > 6:362944‑M1/69‑116 (MQ=255) tcgagagctatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCgg < 5:362944‑M1/48‑1 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTTACCGCGGATGCGGGGGGTTAGGCCCCCACGCCATCGCGGGTT‑AAC‑CCGCGCCGACACAGAGccccccccccca > 6:94222/1‑147 (MQ=255) gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCa > 5:106106/1‑141 (MQ=255) gAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCa < 6:106106/141‑1 (MQ=255) tatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTc > 2:178131‑M1/61‑104 (MQ=255) tatcaggacgcctgatagccctccccgccacctggcttgggtggcgggctctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTc < 1:178131‑M1/44‑1 (MQ=255) tGACCTGGGGCCCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGa < 5:150081/149‑1 (MQ=38) ccAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCt < 4:366172/148‑1 (MQ=255) aCATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGAc < 5:94222/149‑1 (MQ=255) tGAGCCCCGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCtcga < 5:142485/140‑1 (MQ=255) gAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAACCGCGAATGCGGAGGGATAGCCACCCACGCATTAGCGGG‑TAAAA‑CCGCAGCAACACAGAGCCCCCCACCCCACCCAGGTGGCGGGGGGGGCTATAAGGCGGGCGGATTGCGCTCGCACGACggg > 2:88910/1‑147 (MQ=255) tGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAggg < 5:116218/107‑1 (MQ=255) tAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTGGCGGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGcaca > 1:127478/1‑149 (MQ=255) | AGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGG‑T‑AAA‑CCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACA > NC_002947/1126446‑1126735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |