New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1243942 = | 54 (0.910) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 5.5% | coding (543/675 nt) | rnt | ribonuclease T |
? | NC_002947 | 1243990 = | 52 (0.920) | coding (495/675 nt) | rnt | ribonuclease T |
GCCTTTAGCAGATCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGTC > NC_002947/1243798‑1244076 | ggcactcaaggccaacggctgcaagcgggcgattctggtcggccacaacagcagcttcgacctgggtttcctcaatgcagcagtggcgcgcaatgacctgaagcgcaacccgttccacccgttctccagcttcgacaccgccaccCTgg < 5:335094‑M1/4‑1 (MQ=255) tttAGCAGATCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAgg > 1:53799/1‑149 (MQ=255) tAGCAGATCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGcc > 3:56695/1‑149 (MQ=255) aGATCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCAGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCcgcg > 7:178975/1‑149 (MQ=255) tCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGATC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCACGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGcc > 5:41273/1‑148 (MQ=255) tCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCAc > 5:159998/1‑149 (MQ=255) tCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCAc > 8:79300/1‑149 (MQ=255) tCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGGGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCAc > 7:201750/1‑149 (MQ=255) gAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCt > 2:311006/1‑149 (MQ=255) aaaTCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTg < 2:53799/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTAGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGc > 1:112272/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCa > 2:183439/1‑148 (MQ=255) gcCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTCAAGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATa > 1:284726/1‑149 (MQ=255) cccATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCcgc > 4:328109/1‑120 (MQ=255) cccATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCcgc < 3:328109/120‑1 (MQ=255) aTTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGc > 4:42602/1‑149 (MQ=255) aTTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGc > 5:149601/1‑149 (MQ=255) tttctttcCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGc > 6:69053/1‑148 (MQ=255) tttctttcCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGc > 1:314004/1‑148 (MQ=255) tttctttcCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGc > 5:101994/1‑148 (MQ=255) ctttcCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAg < 1:311006/148‑1 (MQ=255) caacagcagcttcgacctgggtttcctcaatgcagcagtggcgcgcaatgacctgaagcgcaacccgttccacccgttctccagcttcgacaccgccaccCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAgg > 6:335094‑M1/101‑149 (MQ=255) cAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTgg < 4:56695/148‑1 (MQ=255) cGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGgt < 1:183439/149‑1 (MQ=255) gTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGgtgt < 6:159998/149‑1 (MQ=255) gTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGgtgt < 1:199738/149‑1 (MQ=255) ccGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTgg < 5:69053/148‑1 (MQ=255) ccGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGga < 3:115779/149‑1 (MQ=255) gCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGgag > 4:226730/1‑148 (MQ=255) gCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGgag > 6:70278/1‑148 (MQ=255) gAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACg < 6:228911/149‑1 (MQ=255) cAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGt < 8:201750/149‑1 (MQ=255) aGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTg < 2:314004/149‑1 (MQ=255) cagcagtggcgcgcaatgacctgaagcgcaacccgttccacccgttctccagcttcgacaccgccaccCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCa > 4:352905‑M1/69‑115 (MQ=255) cagcagtggcgcgcaatgacctgaagcgcaacccgttccacccgttctccagcttcgacaccgccaccCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCa < 3:352905‑M1/47‑1 (MQ=255) c‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAAc > 8:251361/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCcgcg < 4:281600/77‑1 (MQ=255) ggTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCcgcg > 3:281600/1‑77 (MQ=255) ctcGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTgcgc < 1:285968/148‑1 (MQ=255) ggTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCACGTCGAATTCGATGTCGGCGCTCTGGCATTCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGCACGGGGGGACCGCGTTGCGCta > 6:264215/1‑146 (MQ=255) aTAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGGGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCa < 6:149601/148‑1 (MQ=255) gTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTgcgc < 3:42602/149‑1 (MQ=255) gCCGAGAGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCGCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGTTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTgcgcgc < 6:41273/149‑1 (MQ=255) aGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCAct > 1:147201/1‑149 (MQ=255) cTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCAt > 8:132530/1‑149 (MQ=255) cGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAg < 7:251361/149‑1 (MQ=255) cGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAg < 8:178975/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTGGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCa < 5:264215/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGNGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAAccc < 5:70278/148‑1 (MQ=255) gAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAAccc < 3:226730/148‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTgcgc < 5:36064/107‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAgg > 5:79887/1‑149 (MQ=255) aGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAgg < 7:132530/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGCTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTgcgc > 6:36064/1‑107 (MQ=255) gTCGATGTCGGCTCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGt < 6:101994/149‑1 (MQ=255) cGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGTc > 5:63986/1‑148 (MQ=255) gATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCTCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGt > 6:3578/1‑146 (MQ=255) gATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCTCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGt < 5:3578/146‑1 (MQ=255) | GCCTTTAGCAGATCAATCGTTGAAATCGCGCCAGCCGCCCATTTCTTTCCAGCGGTTGACGATGCCGCAGAACAGCTC‑AGCGGTTTTCTCGGTGTCATAACGTGCCGAGTGCGCCTCACGCCCGTCGAAGTCGATGTCGGCGCTCTGGCAGGCCCGCGCCAGCACGGTCTGGCCATACGCCAGGCCCGCCAGGGTGGCGGTGTCGAAGCTGGAGAACGGGTGGAACGGGTTGCGCTTCAGGTCATTGCGCGCCACTGCTGCATTGAGGAAACCCAGGTC > NC_002947/1243798‑1244076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |