New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1782927 | 45 (0.760) | 5 (0.090) | 4/238 | NT | 11.0% | coding (1150/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
? | NC_002947 | = 1782979 | 39 (0.710) | coding (1098/2703 nt) | glnD | uridylyltransferase |
ATCCGGCGCAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCGGCTGGGTGCTGCCACTTTCCT > NC_002947/1782785‑1783073 | aTCCGGCGCAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTAt > 2:195920/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGCAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTAtc > 3:147208/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCg < 6:85358/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCggg < 6:325322/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTgg < 6:72925/148‑1 (MQ=255) cGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTggg < 1:186337/148‑1 (MQ=255) gCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCa > 1:150002/1‑149 (MQ=255) cGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCGATCAGCAc > 4:94161/1‑148 (MQ=255) cGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTATATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCAc > 7:350570/1‑148 (MQ=255) tttCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAg < 5:347691/149‑1 (MQ=255) gCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGAttt > 3:86065/1‑149 (MQ=255) cACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTc > 3:238303/1‑149 (MQ=255) aCTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCattcgccatgctggaaatcttagtgctgatggcccagcac > 6:103284‑M1/1‑109 (MQ=255) aCTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTgg < 6:340075/128‑1 (MQ=255) aCTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTgg > 5:340075/1‑128 (MQ=255) aCTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTc > 5:318008/1‑148 (MQ=255) aCAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCTGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACTCACGACCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATg > 1:260097/1‑149 (MQ=255) gATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGaa < 7:40702/147‑1 (MQ=255) tGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATggc < 8:349520‑M2/149‑4 (MQ=255) aaCAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATggcgt > 7:349520‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGc < 6:124590/117‑1 (MQ=255) aGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGc > 5:124590/1‑117 (MQ=255) ggCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCattcgccatgctggaaatcttcgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgt < 7:107429‑M1/149‑62 (MQ=255) gCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCattcgccatgctggaaatctttgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgtg < 5:103284‑M1/149‑63 (MQ=255) gCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGtt > 1:131381/1‑149 (MQ=255) gCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTATATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGtt < 8:350570/149‑1 (MQ=255) gTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTc < 6:327184/122‑1 (MQ=255) gTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTc > 5:327184/1‑122 (MQ=255) gCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACTGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAg < 4:15291/120‑1 (MQ=255) gCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACAGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAg > 3:15291/1‑120 (MQ=255) gATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATc < 4:278556/100‑1 (MQ=255) gATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATc > 3:278556/1‑100 (MQ=255) atatCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCgg < 2:131381/149‑1 (MQ=255) ttctggAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCgggtgggt < 3:245535/145‑1 (MQ=255) tGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCCGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGggtgggtg > 2:58948/1‑149 (MQ=255) ggAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGcc > 5:277693/1‑149 (MQ=255) gAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGAATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCgggtgggt > 4:245535/1‑144 (MQ=255) cGTGTCCTCGATCAGGTGGCGGTGGTCGCGCAGCAGGCGCACGGTCTCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCCGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGa < 3:230626/149‑1 (MQ=255) tgtCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGata < 4:147208/149‑1 (MQ=255) gtcgATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCattcgccatgctggaaatcttcgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgtg < 2:332601‑M1/116‑63 (MQ=255) gtcgATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCattcgccatgctggaaatcttcgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgtg > 1:332601‑M1/1‑54 (MQ=255) ggTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATg > 2:21095/1‑148 (MQ=255) gTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGCTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTCGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAAAGCCGTGCGTTTGAACACGTACGGGTGGCTGCCCTCGAGATAGCCGTCATg > 5:143800/1‑147 (MQ=255) gCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGc < 1:195920/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACcgcg < 1:21095/149‑1 (MQ=255) gcagGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTc < 4:238303/149‑1 (MQ=255) gcgcACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCg < 4:86065/149‑1 (MQ=255) gTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACcgc < 4:267269/132‑1 (MQ=255) gTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACcgc > 3:267269/1‑132 (MQ=255) gcacgcacGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCGGCTGGGt < 6:266777/143‑1 (MQ=255) gcacgcacGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCGGCTGGGt > 5:266777/1‑143 (MQ=255) cacgcacgCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgac > 1:332601‑M2/1‑62 (MQ=255) cacgcacgCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgac < 2:332601‑M2/116‑55 (MQ=255) cacgcacgCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACAAAGATTTCCAGCATGGCGAATggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgacgacacgttccgcaccgatatccgcaataccagc < 5:103284‑M2/149‑88 (MQ=255) acgcacgcCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgacgacacgttccgcaccgatatccgcaataccagcc < 7:107429‑M2/149‑89 (MQ=255) gcacgcCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCGGCTGGGTGCTGCCACtt > 5:122988/1‑149 (MQ=255) acgcCattcgccatgctggaaatcttcgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgacgacacgttccgcaccgatatccgcaataccagcctgtt > 7:349520‑M1/1‑5 (MQ=255) gcCattcgccatgctggaaatcttcgtgctgatggcccagcaccccgagataaagggcgtgcgtgccgataccgtgcgcctgctgcgcgaacaccgccacctgatcgacgacacgttccgcaccgatatccgcaataccagcctgttca < 8:349520‑M1/149‑147 (MQ=255) gcCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGc < 8:37688/110‑1 (MQ=255) | ATCCGGCGCAGGTTGCGGTGGATGCCGATTTCGCACTTGAACAGCTCGATGAACAGGCTGGTATTGCGGATATCGGTGCGGAACGTGTCGTCGATCAGGTGGCGGTGTTCGCGCAGCAGGCGCACGGTATCGGCACGCACGCCCTTTATCTCGGGGTGCTGGGCCATCAGCACGAAGATTTCCAGCATGGCGAATGGCGTGCGTTTGAACACGTTCGGGTGGGTGGCCTCGATATAGCCGTCATGCAGGCGGAACCGCGCATTCAGCGGCTGGGTGCTGCCACTTTCCT > NC_002947/1782785‑1783073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |