New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1845868 | 53 (0.900) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.1% | coding (159/1377 nt) | pfeS‑II | histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1845921 | 62 (1.100) | coding (212/1377 nt) | pfeS‑II | histidine kinase |
ATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGATCATGC > NC_002947/1845723‑1846016 | aTTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGccgccg > 5:169081/1‑147 (MQ=255) ttCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAg > 8:202121/1‑149 (MQ=255) tCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGc > 5:154161/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAg < 7:191874/148‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACGTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTg < 7:202121/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcgg > 5:115885/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcgggcg > 3:194824/1‑149 (MQ=255) tggtggGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGgcgggcgg < 4:172654/149‑1 (MQ=255) gtggGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGcgggcggg > 8:47501/1‑148 (MQ=255) ggccTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAg < 3:71569/146‑1 (MQ=255) ctCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcgg < 6:281214/136‑1 (MQ=255) ctCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcgg > 5:281214/2‑137 (MQ=255) cctgcTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTgg < 5:230809/146‑1 (MQ=255) cctgcTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGAc < 6:115885/148‑1 (MQ=255) tgctgATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAg > 2:238707/1‑149 (MQ=255) ctgATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAgt < 6:154161/148‑1 (MQ=255) tgtgccGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAgtgggt > 7:8824/6‑149 (MQ=255) tGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTg > 6:122488‑M2/1‑148 (MQ=255) aTCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggc > 1:26117‑M2/1‑146 (MQ=255) ccgGCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACATGGAAACCCAGAAAGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcg < 1:78219‑M2/148‑5 (MQ=255) ccGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGaa < 1:248584/95‑1 (MQ=38) ccGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGaa > 2:248584/2‑95 (MQ=39) ccTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggcat < 5:107547‑M1/149‑62 (MQ=255) ccTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggca > 8:289359‑M1/1‑88 (MQ=255) cTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCAt > 7:30371/1‑149 (MQ=255) tCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATg > 3:144115/1‑149 (MQ=255) aGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggcataa < 7:289359‑M1/147‑64 (MQ=255) ttATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATc > 7:288746/1‑149 (MQ=255) ccTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAgcgc > 3:242926/1‑149 (MQ=255) gCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGTAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACgg > 1:248503/1‑149 (MQ=255) ccGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATc < 1:206066/137‑1 (MQ=255) ccGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATc > 2:206066/1‑137 (MQ=255) gCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCATGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCt < 1:79300/149‑1 (MQ=255) gCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCt < 8:8824/149‑1 (MQ=255) acaTGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTgg < 8:30371/149‑1 (MQ=255) caTGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGgc < 5:253055/83‑1 (MQ=255) caTGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGgc > 6:253055/1‑83 (MQ=255) aGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTc < 1:238707/149‑1 (MQ=255) aGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTc < 4:242926/149‑1 (MQ=255) aGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTc < 4:144115/149‑1 (MQ=255) aaTGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCg > 8:66661/1‑148 (MQ=255) aaTGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGa > 7:42028/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGa > 5:25709/1‑148 (MQ=255) ccTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACAt > 7:306022/1‑148 (MQ=255) ccTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAAc < 7:47501/148‑1 (MQ=255) ccTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAAc < 4:194824/148‑1 (MQ=255) tctcGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCACGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTg > 5:116592/1‑149 (MQ=255) tcGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCACCCTgcg > 2:274844/1‑149 (MQ=255) tcGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTgcg > 7:25467/1‑149 (MQ=255) tcGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTgcg > 3:363864/1‑149 (MQ=255) cGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTgcgc > 1:218021/1‑149 (MQ=255) cGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGACGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCTCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTgcgc > 1:212238/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCt > 3:96905/1‑149 (MQ=255) gCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGa > 7:138763/1‑149 (MQ=255) gCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTCGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAgc > 7:329112/1‑149 (MQ=255) ccAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAgcg > 5:18624/1‑149 (MQ=255) ttGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACt > 3:68747/1‑149 (MQ=255) gCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTc < 8:42028/148‑1 (MQ=255) gCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGGGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACt < 2:137738/147‑1 (MQ=255) cGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCaa < 4:68747/149‑1 (MQ=255) ggggTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAAc > 6:113165/1‑149 (MQ=255) ttATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggcattctgggtttccatgtgccggccccaggtataact < 7:289359‑M2/147‑85 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggcattctgggtttccatgtgccggccccaggtataactgagg < 5:107547‑M2/149‑89 (MQ=255) tGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggcattctgggtttccatgtgccggccccaggtataactgagg > 8:289359‑M2/1‑60 (MQ=255) tGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAgc < 6:283362/77‑1 (MQ=255) tGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAgc > 5:283362/1‑77 (MQ=255) tGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGGGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGa < 2:59648/149‑1 (MQ=255) ccgccgAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGAt > 2:298745/1‑148 (MQ=255) cgccacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggctttctgggtttccatgtgccggcctcagttatacctggggccgg < 1:78219‑M1/149‑146 (MQ=255) gccgAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGATCAt < 7:66661/149‑1 (MQ=255) gccacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggcattctgggtttccatgtgccggccccaggtataactgaggccgat > 1:26117‑M1/1‑3 (MQ=255) ccgAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGATCATg < 6:169081/149‑1 (MQ=255) cacccactggtccagccctgcccgcccgccactgcgccaggcctgttcagcttcggcggcataaccccgcaaggtctggcgtgccggctccgagaggaaggcattctgggtttccatgtgccggccccaggtataactgaggccgatca > 6:122488‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAG‑CCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGCATCAGCGCGAACGGGGCTGGGTCGGGGTGCTCGACATCAACCTGCGCCCGCTCGACAGCGCCACACTCAACCCACAGATCATGC > NC_002947/1845723‑1846016 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |