| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CTAAGGCCTTGCCCCGCCAGATGCTGTAGCTATTCAGGTCTGCCAGCGATCGGCTTTGCCCGCTGTAGCCGATGCTGTAATGCCCGGTCGGGTCGCGGAAGGTTATCGGGTTGCCTTGGCAATAGCCGTAGTAGTTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGATCGT > NC_002947/2109983‑2110273 | cTAAGGCCTTGCCCCGCCAGATGCTGTAGCTATTCAGGTCTGCCAGCGATCGGCTTTGCCCGCTGTAGCCGATGCTGTAATGCCCGGTCGGGTCGCGGAAGGTTATAGGGTTGCCTTGGCAATAGCCGTAGTAGTTCAG‑CCCCCCcgcg > 5:211839/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTTGCCCCGCCAGATGCTGTAGCTATTCAGGTCTGCCAGCGATCGGCTTTGCCCGCTGTAGCCGATGCTGTAATGCCCGGTCGGGTCGCGGAAGGTTATCGGGTTGCCTTGGCAATAGCCGTAGTAGTTCAG‑CCCCCCCGCGcc > 2:70285/1‑149 (MQ=255) cTTGCCCCGCCAGATGCTGTAGCTATTCAGGTCTGCCAGCGATCGGCTTTGCCCGCTGTAGCCGATGCTGTAATGCCCGGTCGGGTCGCGGAAGGTTATCGGGTTGCCTTGGCAATAGCCGTAGTAGTTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAgg < 1:154115/149‑1 (MQ=255) 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tagtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGa < 6:143094/148‑1 (MQ=255) agtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAg < 1:227910/94‑1 (MQ=255) agtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAg > 2:227910/1‑94 (MQ=255) agtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGa > 8:294096/1‑147 (MQ=255) agtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGa < 7:294096/147‑1 (MQ=255) gtTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGc < 3:191124/148‑1 (MQ=255) ttCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTcgggggggctgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctaca < 3:100438‑M2/118‑85 (MQ=255) ttCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTcgggggggctgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctaca > 4:100438‑M2/1‑34 (MQ=255) cAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGt < 2:193859/148‑1 (MQ=255) cAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCCGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGt < 3:272497/148‑1 (MQ=255) g‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTcgggggggctgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctacagcgggcaaagccgatcgctggcagacctgaatagc < 5:286658‑M2/149‑120 (MQ=255) g‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTcgggggggctgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctacagcgggcaaagccgatcgctggcagacctgaatagc < 5:263596‑M2/149‑120 (MQ=255) g‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGa < 3:188536/149‑1 (MQ=255) g‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGa < 4:58241/149‑1 (MQ=255) cccccGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGAtcg < 5:140552/149‑1 (MQ=255) cccccGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGAtcg > 7:208447/1‑149 (MQ=255) cccGacgcactcagccccttcggcgcgggggggctgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctacagcgggcaaagccgatcgctggcagacctgaatagctacag < 1:92457‑M1/149‑146 (MQ=255) ccGacgcactcagccccttcggcgcgggggggttgaactactacggctattgccaaggcaacccgataaccttccgcgacccgaccgggcattacagcatcggctacagcgggcaaagccgatcgctggcagacctgaatagctacag > 2:359212‑M1/1‑3 (MQ=255) | CTAAGGCCTTGCCCCGCCAGATGCTGTAGCTATTCAGGTCTGCCAGCGATCGGCTTTGCCCGCTGTAGCCGATGCTGTAATGCCCGGTCGGGTCGCGGAAGGTTATCGGGTTGCCTTGGCAATAGCCGTAGTAGTTCAG‑CCCCCCCGCGCCGAAGGGGCTGAGTGCGTCGGGGCTGTGAAAGCGCATCAGCACCGGGTTGTAGGCGCGGTAGCCGCTACCGAGCAGGTACCAGCCGCTGTCGGGA‑TCGAGCGCTTCGCCGTTGTAGCCCAGGGTGCCGAGCAGTGGATCGT > NC_002947/2109983‑2110273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |