New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2303118 | 44 (0.740) | 4 (0.070) | 4/236 | NT | 7.5% | intergenic (‑203/+92) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2303178 | 58 (1.060) | intergenic (‑263/+32) | PP_mr30/PP_2027 | C4 ncRNA/hypothetical protein |
GGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCTG > NC_002947/2302972‑2303266 | ggAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACg > 1:271553/1‑149 (MQ=255) ggAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACg > 8:231015/1‑149 (MQ=255) cGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGc < 1:302575/149‑1 (MQ=255) cGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGc < 7:162366/149‑1 (MQ=255) gTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCt > 2:303549/1‑149 (MQ=255) aTCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 3:1361/148‑1 (MQ=255) gAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAgg > 3:370587/1‑148 (MQ=255) gAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAgg > 1:8684/1‑148 (MQ=255) cccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTATGGCGCAAg < 7:291375/149‑1 (MQ=255) ccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgcc > 1:300104‑M1/1‑121 (MQ=255) ccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAgg > 5:333289/1‑149 (MQ=255) ccGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAgg > 2:284705/1‑149 (MQ=255) cGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACCGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCg > 6:212351/1‑148 (MQ=255) cGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg < 6:199676/145‑1 (MQ=255) cGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg > 5:199676/1‑145 (MQ=255) gATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTa < 2:8684/149‑1 (MQ=255) tAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTAcg > 1:229245/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTAcgcg < 5:314299/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTAcgcg < 7:231015/149‑1 (MQ=255) aGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCGCCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTTCGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGt < 1:303549/149‑1 (MQ=255) gcgcgcGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg > 3:141650/1‑132 (MQ=255) gcgcgcGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCg < 4:141650/132‑1 (MQ=255) gTAGTGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCgg < 3:220699/149‑1 (MQ=255) gTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAt > 1:284705‑M2/1‑148 (MQ=255) gTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtg < 3:303458‑M2/149‑3 (MQ=255) tAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtgc < 6:291957‑M2/149‑4 (MQ=255) tAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtgc > 6:333289‑M2/1‑146 (MQ=255) aTTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgccc < 2:300104‑M1/149‑66 (MQ=255) tAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggc < 2:100231‑M1/138‑60 (MQ=255) tAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggc > 1:100231‑M1/1‑79 (MQ=255) gTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTAc > 8:320339/1‑112 (MQ=255) gTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTAc < 7:320339/112‑1 (MQ=255) tGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCg > 8:291083/1‑148 (MQ=255) cTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAg < 6:91505/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTg < 2:271553/148‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTgg < 6:329374/148‑1 (MQ=255) aGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGa < 7:237140/149‑1 (MQ=255) gTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGa > 7:75904/1‑147 (MQ=255) aGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATagag < 4:328206/148‑1 (MQ=255) gAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAgcg > 6:119614/1‑149 (MQ=255) ttACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTgg < 6:76531/132‑1 (MQ=255) ttACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTgg > 5:76531/1‑132 (MQ=255) cGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTg < 5:165375/149‑1 (MQ=255) ggtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGcc > 2:358461/1‑147 (MQ=255) ggtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGcc < 1:352736/147‑1 (MQ=255) ggtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGcc < 1:358461/147‑1 (MQ=255) ggtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGcc > 2:352736/1‑147 (MQ=255) gtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGtt > 1:42460/1‑149 (MQ=255) gtAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGt < 2:42460/148‑1 (MQ=255) cTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCAGCTTGCCGCCGctctat < 5:291957/149‑3 (MQ=39) tGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACGTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcgc > 3:275273/1‑149 (MQ=255) cg‑cCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcgc < 8:75904/147‑1 (MQ=255) g‑cCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTcgcccg > 6:120368/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGgcagc > 3:145676/1‑148 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCAtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaat < 2:300104‑M2/149‑85 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTtctc < 5:120500/132‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTtctc > 6:120500/1‑132 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAaca < 4:370587/149‑1 (MQ=255) gCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaatta > 6:333289‑M1/1‑3 (MQ=255) gCAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaatta < 6:291957‑M1/149‑147 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGtt < 1:341480/127‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGtt > 2:341480/1‑127 (MQ=255) cAtgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaattac < 3:303458‑M1/149‑148 (MQ=255) atgcccgctcccactgaccgcgtacgccgagaaccttgcgccgtacctgtggggagcgggcgtgcccgcgaacaccggcgcagctaccaccgtaagatatttctgaacctgcaacccaatgcttcagaatcaacccgcttaggaattac > 1:284705‑M1/1‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCC‑ACCGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCTg < 5:212351/149‑1 (MQ=255) | GGAAACGTTATCCGTGAGGTGTTTCCCCGACAACAGCGATAGTTCGGCAGCGCGCGTAGGGTAATTCCTAAGCGGGTTGATTCTGAAGCATTGGGTTGCAGGTTCAGAAATATCTTACGGTGGTAGCTGCG‑CCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCC‑ACAGGTACGGCGCAAGGTTCTCGGCGTACGCGGTCAGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACCACTTACTTGGGATAGAGCGGCGGCAAGCTGCCGTTCTCGCCCGCCGGCAGCAACACCTG > NC_002947/2302972‑2303266 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |