New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2329127 = | 50 (0.850) | 4 (0.070) | 4/238 | NT | 7.5% | coding (715/1239 nt) | PP_2047 | 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 2329196 = | 52 (0.950) | coding (784/1239 nt) | PP_2047 | 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase family protein |
TGGTTTCATTGGCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCCCGGCAGCCGGCAGG > NC_002947/2328979‑2329274 | tGGTTTCATTGGCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCa > 8:149933/1‑149 (MQ=255) gTTTCATTGGCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATc > 7:30019/1‑149 (MQ=255) acgtcggtagccaaggttctgggacacctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGa > 3:329820‑M1/145‑149 (MQ=255) gtgggttgccatggttctgggtcacctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgtcggctgcctggggcatagtgttaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcgtccgagctcgcacagcgcattATCGAc > 7:56923‑M1/143‑148 (MQ=255) tcggtagccaaggttctgggacacctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGACCt < 3:67140‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGGCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTg > 1:197456/1‑149 (MQ=255) gCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGa < 4:327730/148‑1 (MQ=255) cAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGt < 3:132633/149‑1 (MQ=255) aaTCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTg > 7:349768/1‑149 (MQ=255) aaTCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTg > 2:19174/1‑149 (MQ=255) tCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGgc > 7:217573/1‑149 (MQ=255) tCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGgc > 7:211891/1‑149 (MQ=255) tCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGgc < 2:197456/149‑1 (MQ=255) caaggttctgggacacctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGAc > 5:30547‑M1/134‑139 (MQ=255) caaggttctgggacacctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGAc < 6:30547‑M1/6‑1 (MQ=255) cATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGgcgcg > 5:232286/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGa > 2:235829/1‑132 (MQ=255) gTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGa < 1:235829/132‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTg < 2:67897/136‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTg > 1:67897/1‑136 (MQ=255) cgcAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCa < 7:149933/149‑1 (MQ=255) ctgcagcaccaacgcgtcgacctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGc < 3:23728‑M1/32‑1 (MQ=255) ggCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGGCCCGCGGTTGGgcgcgcg > 2:178644/1‑148 (MQ=255) ggCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGc < 1:119390/148‑1 (MQ=255) ggCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGc < 4:38729/148‑1 (MQ=255) cGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAg < 7:189172/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAgg < 7:252857/149‑1 (MQ=255) acctgcgggtcatgctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGAc < 2:244394‑M1/51‑1 (MQ=255) ctgctTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGc < 6:17585/148‑1 (MQ=255) ctTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGTCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGt < 8:349768/149‑1 (MQ=255) aGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCCGCCGGTGGGCGGGGCAGGCAAGCACCCCCCCCGGGTGGAgg > 2:187592/1‑149 (MQ=255) ctcggcctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGt > 4:23728‑M1/85‑149 (MQ=255) gTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGGCGAt > 5:361352/1‑148 (MQ=255) ctgccggctgccgggggcatagcggtaatagccctgcccggtcttctgcccaaggcggccgagctcgcacagcgcattATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATaa > 1:244394‑M1/79‑149 (MQ=255) cacaTCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGGATGCACGACCCGCTGGGGGAGGGGGATAATtcg > 6:35559/1‑149 (MQ=255) cacaTCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATgcg < 1:187592/149‑1 (MQ=255) acaTCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATgcgc < 8:30019/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCtg > 8:24673/1‑149 (MQ=255) aGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGc < 2:42875/149‑1 (MQ=255) aGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGc < 1:178644/149‑1 (MQ=255) tGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAg > 5:29611/1‑149 (MQ=255) cGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCgg < 3:160194/148‑1 (MQ=255) tACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTCGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGgccgc < 1:299672/149‑1 (MQ=255) agcagTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTggg < 8:211891/149‑1 (MQ=255) agcagTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTggg < 8:217573/149‑1 (MQ=255) agTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGTAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTggg > 2:7586/1‑146 (MQ=255) ttCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCagaa < 6:29611/149‑1 (MQ=255) ggCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCt > 1:105790/1‑119 (MQ=255) ggCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCt < 2:105790/119‑1 (MQ=255) ttCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCgg > 3:56859/1‑149 (MQ=255) aTGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAggg > 1:6990/1‑149 (MQ=255) ggCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTAt > 3:271992/1‑149 (MQ=255) cGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGACCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCAGCGGCAGCTCGATAATGAGCTGAGCGAGCTCGGCCGCCGTggg > 6:72927/1‑120 (MQ=255) cGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGGGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTggg < 5:72927/120‑1 (MQ=255) gCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTAt < 6:104503/149‑1 (MQ=255) cATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATg > 4:29946/1‑149 (MQ=255) cATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATg > 1:165079/1‑149 (MQ=255) tACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGcccc < 6:361352/149‑1 (MQ=255) gacgTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCg < 1:174420/121‑1 (MQ=255) cgTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCTCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCccgg > 5:149425/1‑147 (MQ=255) tggtggGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCccggcagc < 3:29946/149‑1 (MQ=255) tggtggGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCCGCAGTTGGGCGGGCAAGGCATGCACCACCCCCTGGTGCAGGTCGATAAAGCGCGGTGCGAGCTCGGCCGCCGTGGGGAGAAGCCCGGGCAGGGCGATTTCCGCAATGCCCcccgccgc > 6:213923/1‑149 (MQ=255) gtggGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCccggcagccg < 6:232286/149‑1 (MQ=255) ggCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCccggcagccggca < 7:24673/149‑1 (MQ=255) gCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCccggcagccggcag < 2:6990/149‑1 (MQ=255) cATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCCCGGCAGCCGGCAgg > 7:354003/1‑149 (MQ=255) cATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCCCGGCAGCCGGCAgg > 5:371107/1‑149 (MQ=255) | TGGTTTCATTGGCAATCGCATGTTGCGCAGCTATGTGGGCGAAGCGCGCAAGTTGCTGCTTGAAGGGGCGTTGCCACATCAGGTGGATGCGGTACTGCAGCAGTTCGGCTTCGCCATGGGGCCGTTCCGCATGTACGACGTGGTGGGCATCGACCTGGAGTGGCGCGCCCGGCAGTTGGCCGGGCAAGGCATGCACGACCCGCTGGTGCAGGTCGATAATGCGCTGTGCGAGCTCGGCCGCCTTGGGCAGAAGACCGGGCAGGGCTATTACCGCTATGCCCCCGGCAGCCGGCAGG > NC_002947/2328979‑2329274 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |