| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2357793 | 78 (1.320) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 5.3% | coding (518/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 2357821 | 68 (1.220) | coding (490/825 nt) | PP_2072 | AraC family transcriptional regulator | |||||
GCAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTG > NC_002947/2357650‑2357941 | gcAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGATACACCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGATCCATCATGAAGCCTCGGGCGCGTTCg > 4:320254/1‑149 (MQ=255) ggTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTg > 8:131003/1‑149 (MQ=255) aCAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTg < 3:320254/149‑1 (MQ=255) aaaGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGcgcg > 7:32887/1‑135 (MQ=255) aaaGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGcgcg < 8:32887/135‑1 (MQ=255) aaaGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTgg > 6:112591/1‑148 (MQ=255) aTAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATc > 2:33352/1‑147 (MQ=255) tAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCTACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAg < 1:149541/149‑1 (MQ=255) ggggCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAATGTCCCGCGACGGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAgg < 6:38362/148‑1 (MQ=255) ggggCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGgc < 5:98803/149‑1 (MQ=255) ggggCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGgc > 8:332506/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt < 5:306255/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTACAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt < 2:347186/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcg > 4:27373‑M2/1‑146 (MQ=255) gCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcc < 5:377845‑M2/149‑6 (MQ=255) gTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCcgc > 1:44073/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCcgc > 8:39064/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCcgc > 7:187475/1‑149 (MQ=255) aCAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccga > 2:215259‑M1/1‑111 (MQ=255) aCAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgccaggattaccaggcagccgaacgcgcccga < 1:215259‑M1/147‑37 (MQ=255) cAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCcgcg‑c < 1:242453/148‑1 (MQ=255) aGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑Cgg > 2:114971/1‑149 (MQ=255) cGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgc > 7:243126‑M2/1‑135 (MQ=255) cGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgc < 8:243126‑M2/137‑3 (MQ=255) cGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCt > 3:280282/1‑149 (MQ=255) gTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCtt < 7:101565/149‑1 (MQ=255) gTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCtt > 2:57060/1‑149 (MQ=255) cGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTgcc < 7:249737/149‑1 (MQ=255) cGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTgcc > 2:90820/1‑149 (MQ=255) gAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTgccg > 4:153892/1‑149 (MQ=255) aaaGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTgccgc < 1:114971/149‑1 (MQ=255) aaaGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTgccgc < 7:332506/149‑1 (MQ=255) aaGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagcc > 2:313294‑M1/1‑100 (MQ=255) aaGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagcc < 1:313294‑M1/139‑40 (MQ=255) gTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGa > 5:48102/1‑149 (MQ=255) gTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGa < 6:48102/149‑1 (MQ=255) cgcgACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGc < 3:153892/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGc > 2:188191/1‑148 (MQ=255) gCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg > 5:125972/1‑149 (MQ=255) gCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAgg > 6:362498/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGc < 5:280333/149‑1 (MQ=255) cAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCg < 4:280282/147‑1 (MQ=255) cAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGAt > 6:375494/1‑149 (MQ=255) gCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATc < 6:109940/99‑1 (MQ=255) gCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATc > 5:109940/1‑99 (MQ=255) gTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGcc < 1:33352/149‑1 (MQ=255) cgcgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAg < 8:187475/148‑1 (MQ=255) cgcgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAg < 2:44073/148‑1 (MQ=255) gcgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCGCCGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAg < 1:57060/148‑1 (MQ=255) cgGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTc < 7:39064/149‑1 (MQ=255) cACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATAc < 5:202101/149‑1 (MQ=255) cACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATAc < 1:188191/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATa > 1:47887/1‑147 (MQ=255) gCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAgg < 6:377845/147‑1 (MQ=255) cTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGt > 4:313441/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt > 5:361942/1‑87 (MQ=255) ttCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt < 6:361942/87‑1 (MQ=255) ttCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTc < 1:90820/147‑1 (MQ=255) ttCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTc < 7:131003/147‑1 (MQ=255) cAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGtt < 5:112591/149‑1 (MQ=255) cAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTACCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGtt > 2:294936/1‑149 (MQ=255) ccAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTcc < 1:155200/146‑1 (MQ=255) ccAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTcc > 2:155200/1‑146 (MQ=255) ccAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAAt > 5:6032/1‑149 (MQ=255) cAGTGTTATGCACACATGAAGGTGTTCAATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGTCGATTGCGCCCGCG‑CGGATTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATg > 4:191024/1‑149 (MQ=255) gtgtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATg < 1:28503/147‑1 (MQ=255) gtgtTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATg > 2:28503/1‑147 (MQ=255) ttATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTc < 3:313441/148‑1 (MQ=255) aTGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCa < 2:47887/148‑1 (MQ=255) ccACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt < 4:354468/64‑1 (MQ=255) ccACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCtt > 3:354468/1‑64 (MQ=255) aGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCAc > 6:357569/1‑149 (MQ=255) gtgtTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTg > 4:87608/1‑149 (MQ=255) gtTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGcc > 6:368194/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGtt > 6:150097/1‑116 (MQ=255) ttCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGtt < 5:150097/116‑1 (MQ=255) ttCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCt > 4:68391/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCt < 5:375494/149‑1 (MQ=255) ccATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCCCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCaa < 4:153084/121‑1 (MQ=255) atgatgAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTAc > 1:195907/1‑149 (MQ=255) atgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGaa < 6:6032/149‑1 (MQ=255) tgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTgg > 5:124116/1‑131 (MQ=255) tgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTgg < 6:124116/131‑1 (MQ=255) tgaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAAc > 1:215140/1‑149 (MQ=255) gaAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCCAGGCGCTCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGCTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTCGACGACCg > 5:67087/1‑149 (MQ=255) aGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTg > 2:358919/1‑127 (MQ=255) aGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCt < 3:68391/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactt > 2:313294‑M2/1‑39 (MQ=255) ggCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactt < 1:313294‑M2/139‑101 (MQ=255) tCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCTGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgt < 1:215259‑M2/147‑112 (MQ=255) tCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgt > 2:215259‑M2/1‑36 (MQ=255) gggCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAAt < 4:191834/107‑1 (MQ=255) gggCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTg > 8:54501/1‑149 (MQ=255) ggCGCaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtacggc < 5:377845‑M1/149‑145 (MQ=255) cgcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacgctgtacggcac > 4:27373‑M1/1‑3 (MQ=255) gcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacg < 8:243126‑M1/137‑136 (MQ=255) gcaagcgcctggattaccaggcagccgaacgcgcccgagccttcatcatggaacacctgcatgtgggcataacactggacatgctggaacaggccagtggccgcgaacgctggagcctgtcgcgggactttcgcacg > 7:243126‑M1/1‑2 (MQ=255) cgTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTg < 3:87608/149‑1 (MQ=255) | GCAGGGTGACAAAGCGATAGGGGCTGGTGCCGTACAGCGTGCGAAAGTCCCGCGACAGGCTCCAGCGTTCGCGGCCACTGGCCTGTTCCAGCATGTCCAGTGTTATGCCCACATGCAGGTGTTCCATGATGAAGGCTCGGGCGCGTTCGGCTGCCTGGTAATCCAGGCGCTTGCGCCCGCG‑CGGCTTGCCGCCGACGGCCCGCAAGGCGATCGCCAGGTCATACAGGGCGTCCTGTTCTTCCAATGGTTCCAGCGCGTGGTCCACTGCCTGTACGAACGCTTCGCTGGCGTG > NC_002947/2357650‑2357941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |