| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2434743 = | 45 (0.760) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 8.4% | coding (55/465 nt) | PP_2133 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2434791 = | 45 (0.810) | coding (103/465 nt) | PP_2133 | hypothetical protein | |||||
GTATTGCATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAGGA > NC_002947/2434597‑2434885 | gTATTGCATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCtt > 7:352870/1‑149 (MQ=255)ctcatgcccacggcgccgggatctgtgatactgcgggcaggggcttggagactccttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagtagcatggccaaacccatgctactcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCt < 6:366783‑M1/2‑1 (MQ=255) tATTGCATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTg > 1:355209/1‑149 (MQ=255) aTTGCATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTgc > 8:193864/1‑149 (MQ=255) atgcccacggcgccgggctctgtgatactgcgggcaggggcttggcggctccttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCtt > 5:265442‑M1/145‑147 (MQ=255) cccacggcgccgggctctgtgatactgcgggcaggggcttggcggctccttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTgcgc > 2:339025‑M1/142‑148 (MQ=255) cATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCt > 5:324327/1‑148 (MQ=255) ccacggcgccgggctctgtgatactgcgggcaggggcttggcggctccttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTgcgc < 8:363065‑M1/7‑1 (MQ=255) aTGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGAGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGa > 1:280627/1‑149 (MQ=255) tCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGTGCTGATTCTCa > 6:303908/1‑144 (MQ=255) tCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGTGCTGATTCTCa < 5:303908/144‑1 (MQ=255) cTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCt > 8:14541/1‑149 (MQ=255) cTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCt > 2:118735/1‑149 (MQ=255) cTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCt > 5:305287/1‑149 (MQ=255) tGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCtt < 8:45187/128‑1 (MQ=255) tGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCtt > 7:45187/1‑128 (MQ=255) aaTCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCt > 4:264596/1‑149 (MQ=255) tCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTgg < 5:216968/149‑1 (MQ=255) tgcgggcaggggcttggcggctccttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTg < 1:342781‑M1/33‑1 (MQ=255) gATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTgc < 2:355209/149‑1 (MQ=255) aTAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTgcg > 6:257210/1‑149 (MQ=255) aagaagTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGC‑TTAAGGGAACGTCATCAT‑TGACCGTTTTGGGGGGGGGGTGAAAGCTTGCGCGGTTTCTGAGCCCGGGTTCCTGGGTGCGCAg > 2:62203/1‑147 (MQ=255) agTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTcgc > 5:391188/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCTTACGGGCGGGCCAACCGTCAAAAAGGGCTACCCCGCTAATTGCCAAC‑CCTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAg < 1:62203/149‑1 (MQ=255) gTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGc < 6:324327/149‑1 (MQ=255) gTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACACTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAg > 7:144392/1‑148 (MQ=255) gCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCaga < 7:14541/149‑1 (MQ=255) tttAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAgagc > 8:206066/1‑149 (MQ=255) tAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAgagc < 8:352870/147‑1 (MQ=255) cttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAgagc > 2:342781‑M1/94‑147 (MQ=255) ttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCaga < 2:221703‑M1/52‑1 (MQ=255) ttttccagccagtgcggccactgctgcggcgccagttgcatggccaaacccatgcgccgcgcctccaggcgcaacttcatctgctcgctctgCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCaga > 1:221703‑M1/93‑144 (MQ=255) cGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTgc < 6:305287/149‑1 (MQ=255) tGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTgcgc < 5:257210/149‑1 (MQ=255) aaaaaTGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCt > 7:257836/1‑149 (MQ=255) aTGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAg > 8:89079/1‑149 (MQ=255) cAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAggcgcggcgc < 1:118735/149‑1 (MQ=255) cAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAggcgcggcgc < 7:89079/149‑1 (MQ=255) gCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCAt > 8:328210/1‑149 (MQ=255) aTTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATgg < 7:328210/147‑1 (MQ=255) cAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTgg < 7:193864/148‑1 (MQ=255) cAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGc > 3:52322/1‑149 (MQ=255) ttATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCaa > 6:342761/1‑149 (MQ=255) aTGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAg < 7:347939/102‑1 (MQ=255) aTGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAg > 8:347939/1‑102 (MQ=255) gAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGgcg > 7:363065/1‑149 (MQ=255) ac‑tactGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATg < 7:106006/138‑1 (MQ=255) ac‑tactGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATg > 8:106006/1‑138 (MQ=255) ccGGTAGTGCTGGGGGGGGCACTCCGTGCGCTGCTGCTCAGCCCGCGTGCCTGGCGGCGCCGCGCGCGCAAGCCGAGCGAGCCGATGAAGTTGCGCCTGGCGGCGCGGCGCAGGGGTTTGGCCATGCCACTGGCGCCGCAGCAGTGGcc < 1:346491/148‑1 (MQ=255) ggTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCg > 6:22956/1‑148 (MQ=255) ttGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTAGAGGCGCGGCGCAAGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCActg > 5:45914/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCActggct < 8:144392/149‑1 (MQ=255) gtggtgTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCActggctgg > 8:95689/1‑148 (MQ=255) tgtCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGAGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAg > 1:200967/1‑149 (MQ=255) tCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAgg > 8:147014/1‑148 (MQ=255) tCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAgg < 7:147014/148‑1 (MQ=255) tCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAGGa < 4:52322/149‑1 (MQ=255) tCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAGGa < 3:264596/149‑1 (MQ=255) tCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTgg > 2:123110/1‑99 (MQ=255) tCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTgg < 1:123110/99‑1 (MQ=255) | GTATTGCATGAGCGGTACTCCTGACAATCGCGATAGAAGAAGTATGGTCGCTTTAGGGCGGGTCTACCGTGAAAAATGGCTAACCAGCTCATTTGCAACGCTTTATGGGAAC‑TACTGATATGACGGTATTGCTGGTGGTGTCAATCCTTGCGCTGATTCTCAGCCCGCTTTCCTGGCTGCGCAGCTCGCGCAAGCAGAGCGAGCAGATGAAGTTGCGCCTGGAGGCGCGGCGCATGGGTTTGGCCATGCAACTGGCGCCGCAGCAGTGGCCGCACTGGCTGGAAAAGGA > NC_002947/2434597‑2434885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |