| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2973220 = | 59 (1.000) | 5 (0.090) | 5/242 | NT | 8.6% | coding (654/1713 nt) | PP_2600 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2973289 = | 51 (0.910) | coding (585/1713 nt) | PP_2600 | hypothetical protein | |||||
ACGGCCTTGGCGCGGATCAGCTGCTCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAGGCGGCAAGGTCGGCACC > NC_002947/2973077‑2973363 | gcgccctgctgccacgcttgcgcaagaccatgcgcgaaacctcgttcatgggcatgccgatcatggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcCGccac > 3:23615‑M1/144‑149 (MQ=255) gcgcGGATCAGCTGCTCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCca > 3:348122/1‑148 (MQ=255) gATCAGCTGCTCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGt > 5:321812/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGCTCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCACGCCACCAGTGCCACACCGtt < 6:369496/149‑1 (MQ=255) ttgcgcaagaccatgcgcgaaacctcgttcatgggcatgccgatcatggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcc > 8:189880‑M1/127‑127 (MQ=255) ttgcgcaagaccatgcgcgaaacctcgttcatgggcatgccgatcatggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcc < 7:189880‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgctCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGAc > 3:85996/1‑147 (MQ=255) ctCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTCTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCGACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGt < 3:236893/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGc > 1:207582/1‑131 (MQ=255) tCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGc < 2:207582/131‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTg > 8:258392/1‑149 (MQ=255) cGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGc < 6:321812/149‑1 (MQ=255) gCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTNCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCa > 1:119757/1‑149 (MQ=255) gCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCa > 8:244250/1‑149 (MQ=255) gTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGccacca < 1:185201/115‑1 (MQ=255) gTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCCCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGccacca > 2:185201/1‑115 (MQ=255) tcgttcatgggcatgccgatcatggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcgCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATgg < 2:198503‑M1/46‑1 (MQ=255) cgACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGATGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATgg < 3:137668/149‑1 (MQ=255) gACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑c > 6:251484/1‑149 (MQ=255) gttcatgggcatgccgatcatggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑Cgg < 1:194478‑M1/49‑1 (MQ=255) cccACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑Cgg < 4:32353/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑Cggg > 1:25484/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑Cggg > 5:248838/1‑149 (MQ=255) cACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGc > 3:93248/1‑149 (MQ=255) gCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCG‑CCATGGTCGGGCCat < 4:282403/149‑2 (MQ=255) ccccGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCCGCGCCGACGCTAGCAGGTCCACACCCACGTCATGTGCCGAATTAGCCAGGCGCGCCACCAGAGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑gg > 7:317191/1‑149 (MQ=255) cccGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑ggt > 6:210135/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑ggtg > 4:224036/1‑149 (MQ=255) cgcgCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑ggtgg < 6:248838/149‑1 (MQ=255) gcACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTAc < 5:210135/149‑1 (MQ=255) gcACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTAc < 4:348122/149‑1 (MQ=255) cTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGt > 5:150458/1‑149 (MQ=255) ggCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTgg > 6:309011/1‑149 (MQ=255) ggCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTgc > 1:338870/1‑148 (MQ=255) gCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTggc < 5:251484/149‑1 (MQ=255) tggccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTggcg > 2:194478‑M1/81‑149 (MQ=255) cACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACAAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGCTggcgg > 5:275196/1‑149 (MQ=255) gccggtgccgaccttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTggcgg > 6:136428‑M1/79‑148 (MQ=255) gctCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAgc < 2:160227/147‑1 (MQ=255) gATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCaaa < 4:85996/147‑1 (MQ=255) gATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAgc > 1:323360/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAgcg < 3:224036/149‑1 (MQ=255) accttgccgccttcctcaacatgacccgctcgcccaaagccctgctgcacgtgtgcaagcgctttggcgCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCACGGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAgcgc > 1:198503‑M1/70‑149 (MQ=255) agcagGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCtt < 7:258392/149‑1 (MQ=255) agcagGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCt < 6:116182/148‑1 (MQ=255) gcagGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑gg < 6:34581/122‑1 (MQ=255) gcagGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑gg > 5:34581/1‑122 (MQ=255) gcagGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTg < 2:119757/149‑1 (MQ=255) cgcCGACGCTTGCAGGTGCACACCAAGGTCCGGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTAGACCAGCTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGAAAAGGTGGCGGCCAAAGCGCTAGCACACGTGCAGCAcgg > 8:153035/1‑149 (MQ=255) gACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGc < 3:19195/98‑1 (MQ=255) gACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGc > 4:19195/1‑98 (MQ=255) taggttGCAGGTGCACAACCAGGTGCTTTTCCGATTTAGGCAGGCGCGCCACCAGTGGCACACCGTTGACCAGGTTCATGGCCCGTCCATGG‑GGGGCCA‑GGTTGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTg < 8:193724/145‑1 (MQ=255) aCGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTg < 5:309011/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGc < 2:25484/149‑1 (MQ=255) ggTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCgg < 2:323360/149‑1 (MQ=255) gTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCAGACGTGCAGCAggg < 2:11104/134‑1 (MQ=255) gTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAggg > 1:11104/1‑134 (MQ=255) gCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGt > 7:283536/1‑148 (MQ=255) acCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGt > 4:244979/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCttt < 4:147351/130‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCttt > 3:147351/1‑130 (MQ=255) ccAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTgg < 6:243148/132‑1 (MQ=255) ccAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTgg > 5:243148/1‑132 (MQ=255) cTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAgg > 4:44833/1‑149 (MQ=255) tttAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAGGCGGCAAGGt < 3:44833/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGCCACCAGTGCCAGACCGTTGACCAGGTGGATGGCCCGACCATGG‑CGGTGCA‑GGTGGTACAGGTGGCTGCCAAAGTGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGTGTAATGTTTAGGATGGCGGCAAGGtgtgc < 8:317191/148‑5 (MQ=255) ccAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAGGCGGCAAGGTCGGCa > 2:287231/1‑149 (MQ=255) aGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAGGCGGCAAGGTCGGCAcc > 8:139205/1‑149 (MQ=255) | ACGGCCTTGGCGCGGATCAGCTGCTCGCCCTGTGGCGTCGCGACCCACGCCCCGCGCACCTGGCCACCCTCGATCAGCAGGCGTTTGGCCGGCGCCGACGCTTGCAGGTGCACACCCAGGTCCTGTGCCGATTTAGCCAGGCGCGCCACCAGTGCCACACCGTTGACCAGGTGCATGGCCCGACCATGG‑CGGGCCA‑GGTGGTACAGGTGGCGGCCAAAGCGCTTGCACACGTGCAGCAGGGCTTTGGGCGAGCGGGTCATGTTGAGGAAGGCGGCAAGGTCGGCACC > NC_002947/2973077‑2973363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |