New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3848194 | 53 (0.900) | 4 (0.070) | 3/242 | NT | 7.3% | coding (1284/1329 nt) | PP_3396 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3848226 | 52 (0.930) | coding (1316/1329 nt) | PP_3396 | hypothetical protein |
CCAGCACCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCGCGTTCG > NC_002947/3848046‑3848341 | ccAGCACCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGC < 2:183816‑M1/149‑1 (MQ=255) cAGCACCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAgcg > 4:48861/1‑149 (MQ=255) cACCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGcc > 6:297058/1‑148 (MQ=255) aCCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCaa > 6:224947/1‑149 (MQ=255) aGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACgg < 5:203637/149‑1 (MQ=255) tGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACggtg < 6:190618/149‑1 (MQ=255) aCGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACggtgg > 7:73332/1‑148 (MQ=255) gAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAg < 3:247365/149‑1 (MQ=255) aacaacACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCg < 3:4537/149‑1 (MQ=255) acaacaCCTCCAGTACTTCCCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGa < 2:296488/149‑1 (MQ=255) acaacaCCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGa > 1:172692/1‑149 (MQ=255) acaacaCCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTCGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCg > 3:116907/1‑148 (MQ=255) acacCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTc < 8:306993/149‑1 (MQ=255) cacCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTcc < 3:48861/149‑1 (MQ=255) cAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGAc > 8:135517/1‑149 (MQ=255) cAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGAc < 4:116907/149‑1 (MQ=255) aCCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgc > 4:304281‑M2/1‑146 (MQ=255) aCCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgc > 5:297058‑M2/1‑146 (MQ=255) aCCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTg > 5:224947‑M2/1‑146 (MQ=255) gCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggt > 1:276914‑M1/1‑111 (MQ=255) gCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggt > 8:279450‑M2/1‑143 (MQ=255) cacaTACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtg < 2:276914‑M1/149‑40 (MQ=255) cacaTACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggtg < 8:23327‑M2/149‑8 (MQ=255) caTACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGcc < 6:50491/149‑1 (MQ=255) tACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCAt < 7:23327/149‑1 (MQ=255) aCCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCAt > 6:232636/1‑148 (MQ=255) ccGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATg < 7:135517/148‑1 (MQ=255) cGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGCCCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGaa > 5:194634/1‑149 (MQ=255) aaCGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGTGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGa < 1:246891/149‑1 (MQ=255) cGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGAc > 4:177427/1‑148 (MQ=255) cGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACa < 6:186806/149‑1 (MQ=255) cACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAg > 2:376325/1‑149 (MQ=255) gATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTc > 2:300359/1‑147 (MQ=255) gATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTc < 1:300359/147‑1 (MQ=255) aTCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGc > 2:206396/1‑149 (MQ=255) cGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtg < 7:335467‑M1/124‑40 (MQ=255) cGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtg > 8:335467‑M1/1‑85 (MQ=255) ggCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCtt > 2:44000/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCtt > 5:237567/1‑148 (MQ=255) gCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGgca < 3:177427/149‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAaggag > 3:1663/1‑145 (MQ=255) cGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAaggag < 4:1663/145‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGgcag < 6:194634/149‑1 (MQ=255) cgcCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAacac < 6:237567/149‑1 (MQ=255) cGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTg > 7:45063/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTc < 8:181257/111‑1 (MQ=255) aCCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGGGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGtt < 2:302923/148‑1 (MQ=255) ccTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGgc > 5:351711/1‑149 (MQ=255) ccTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGgc > 1:346558/1‑149 (MQ=255) gCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGgccgcc < 1:376325/147‑1 (MQ=255) gCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGccgccg < 6:351711/148‑1 (MQ=255) gCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGccgccg < 2:346558/148‑1 (MQ=255) gCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCgg > 2:73014/1‑149 (MQ=255) ccATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGaa > 7:135093/1‑78 (MQ=255) ccATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGaa < 8:135093/78‑1 (MQ=255) ccATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGtt > 6:263482/1‑149 (MQ=255) aTTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTtc > 8:285520/1‑149 (MQ=255) cgccgGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGTCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCa < 1:109288/86‑1 (MQ=255) cgccgGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCa > 2:109288/1‑86 (MQ=255) cgccgGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTtctctc > 1:101372/1‑149 (MQ=255) gccgGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTctctct > 7:188497/1‑149 (MQ=255) cgGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTa < 2:172692/149‑1 (MQ=255) aGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGCTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGtt < 1:73014/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑t < 1:104665/104‑1 (MQ=255) tGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑t > 2:104665/1‑104 (MQ=255) gTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGcgcc > 6:272612/1‑149 (MQ=255) cACCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtg < 8:23327‑M1/149‑143 (MQ=255) cACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtg < 2:276914‑M2/149‑111 (MQ=255) cACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccg < 7:335467‑M2/124‑86 (MQ=255) cACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccg > 8:335467‑M2/1‑39 (MQ=255) aCCAGCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtgc > 8:279450‑M1/1‑6 (MQ=255) aCCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtgc > 1:276914‑M2/1‑38 (MQ=255) cAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCGCGtt > 5:61116/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCGCGtt > 2:312792/1‑149 (MQ=255) gcgcCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCGCGTTcg < 7:285520/149‑1 (MQ=255) gCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtgcggt > 5:297058‑M1/1‑2 (MQ=255) gCaccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtgcggt > 4:304281‑M1/1‑2 (MQ=255) caccacgtcttcggagtcgctaccaccgttggcgctggtgacctgcaccttggccggcggaatgggcgagagggtcatgctcaacgtcttcacggcgccggtaccgcccaggttgccgatcagcgtgccgttgccggtatgtgcggt > 5:224947‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCAGCACCAGTGACGAAACAACACCTCCAGTACTTACCGCACATACCGGCAACGGCACGCTGATCGGCAACCTGGGCGGTACCGGCGCCGTGAAGACGTTGAGCATGACCCTCTCGCCCATTCCGCCGGCCAAGGTGCAGGTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGG‑TCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCGCGTTCG > NC_002947/3848046‑3848341 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |