New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3881230 = | 61 (1.030) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.6% | coding (3065/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
? | NC_002947 | 3881324 = | 54 (0.940) | coding (3159/3180 nt) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
CTGGAAGCCTGCCGCCTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCTTGACCCCAAGCCTGC > NC_002947/3881082‑3881375 | cTGGAAGCCTGCCGCCTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGt > 7:167808/1‑149 (MQ=255) aggccttggcctgcacatcgctgctcaattgcgcaggttcggtggctggcgcctggtagtccgggcctaccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactt < 6:390894‑M1/1‑1 (MQ=255) aggccttggcctgcacatcgctgctcaattgcgcaggttcggtggctggcgcctggtagtccgggcctaccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactt < 5:191546‑M1/1‑1 (MQ=255) aggccttggcctgcacatcgctgctcaattgcgcaggttcggtggctggcgcctggtagtccgggcctaccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactt < 5:186136‑M1/1‑1 (MQ=255) gccttggcctgcacatcgctgctcaattgcgcaggttcggtggctggcgcctggtagtccgggcctaccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactTGa > 3:291208‑M1/147‑149 (MQ=255) gCCTGCCGCCTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCgt > 1:10381/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCCTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCgtgt > 6:94525/1‑149 (MQ=255) ccgccTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGtt < 1:265587/147‑1 (MQ=255) cgcctgcgcctgCGGCCGAGCCTGATGACCTCGAGCGCCTTCATCATGGGGGTGGGGCCCCTGGGGGTCAGCTCCGGCGCAGGGTCGGAAAGGCGCCATGCAAGGGGGGTGGCGGGGTTCGCGGGGAGGATCGGCGTGCCCGTGTTCgg > 5:252767/1‑149 (MQ=255) cgcctgcgGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGt < 2:10381/148‑1 (MQ=255) ctgcgGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCt < 4:79906/149‑1 (MQ=255) tgatgaCCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGttc > 1:203161/1‑149 (MQ=255) tgaCCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGttcttc < 8:23867/149‑1 (MQ=255) aCCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCTGCCTGTTCCTCACCCCGGTGttcttct < 5:185111/148‑1 (MQ=255) aCCGCGCTCGCCTGCAGGATTTGTGTGGTGCGCCTGTGGGTCAGCGCCGGCGCAGGTGCGGATATGCGCCATGGCCTTGGGGTGGCTGGGTTCTCGGGTTTGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTGCCTCACCCCGGTGttcttct < 6:252767/148‑1 (MQ=255) ccTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGttcttcttc > 5:244089/1‑149 (MQ=255) cTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTcc < 3:256482/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTcc > 3:38668/1‑149 (MQ=255) gATCGCCTTCATCATGGGTTGGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCTCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGTGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGTTCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGa < 1:249015/149‑1 (MQ=255) ttCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATccgccg > 7:169006/1‑149 (MQ=255) atcatGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGttt > 5:254630/1‑149 (MQ=255) tccgggcctaccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTtcgtc < 8:134561‑M1/59‑1 (MQ=255) tgtgGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGc > 5:251642/1‑149 (MQ=255) tgCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGc > 2:179622/1‑149 (MQ=255) tgCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGc < 2:203161/149‑1 (MQ=255) taccgcacaggccgccagggccagtgccagcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGc < 4:237093‑M1/68‑1 (MQ=255) gtgtTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGccc < 6:251642/148‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGCCGGTGCGGAACTGCGCCATGCCATGGGGGGGGCGGTGGTCTCGGGGCTGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCt < 8:167808/149‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAg > 3:258042/1‑146 (MQ=255) gCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAg < 4:258042/146‑1 (MQ=255) gCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCt > 1:238846/1‑149 (MQ=255) cGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGaa < 4:175704/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTc < 4:295040/80‑1 (MQ=255) gcgcAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTc > 3:295040/1‑80 (MQ=255) gcAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGc < 4:38668/149‑1 (MQ=255) aGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTc < 8:220804/149‑1 (MQ=255) ttCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAg < 8:111043/115‑1 (MQ=255) ttCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAg > 7:94022/1‑149 (MQ=255) agcaggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAg > 7:134561‑M1/54‑149 (MQ=255) ggAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGc > 5:382018/1‑149 (MQ=255) ggcttggggtcaagggtttgagcaggttcatgcgtggttctccagcactTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCt > 3:237093‑M1/50‑149 (MQ=255) gAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCt > 6:169366/1‑149 (MQ=255) aaaTGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGc < 3:174780/121‑1 (MQ=255) aaaTGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGc > 4:174780/1‑121 (MQ=255) aaaTGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGCGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTAACACCGGTGTTATTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGACGCCACGCCCGCAAGGCAGAACACGCTCAAGTGCTg > 6:83236/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTgg < 6:244089/149‑1 (MQ=255) tGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGgag < 5:94525/149‑1 (MQ=255) cgcCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGaa < 8:169006/149‑1 (MQ=255) gccatgccatGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCg > 1:95747/1‑109 (MQ=255) gccatgccatGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCg < 2:95747/109‑1 (MQ=255) ccatgccatgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTc < 4:61112/61‑1 (MQ=255) ccatgccatgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTc > 3:61112/1‑61 (MQ=255) catgccatgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCa < 8:356941/149‑1 (MQ=255) catgccatgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCa > 3:366592/1‑149 (MQ=255) gccatgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACg > 4:361161/1‑148 (MQ=255) tgGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATg > 5:390894/1‑148 (MQ=255) ggCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCt < 6:382018/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTc < 5:83236/149‑1 (MQ=255) cGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGt > 7:8778/1‑77 (MQ=255) cGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGt < 8:8778/77‑1 (MQ=255) cGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTc > 6:37957/1‑148 (MQ=255) cGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCa < 6:254630/149‑1 (MQ=255) tgtTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAAc < 5:169366/149‑1 (MQ=255) ctcGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCACGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGACGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCtt > 6:271608/1‑149 (MQ=255) ggggATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCTTGa < 3:361161/148‑1 (MQ=255) ggggATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCTTGAc > 2:275883/1‑149 (MQ=255) gggATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCAc > 6:87505/1‑123 (MQ=255) gggATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCAc < 5:87505/123‑1 (MQ=255) tgatCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCTTGACCCCaa < 1:275883/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCGAACCCTTGACCCCAAGcc > 3:111898/1‑149 (MQ=255) gCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCCCAAACCCTTGACCCCAAGCctgc > 5:337125/1‑149 (MQ=255) | CTGGAAGCCTGCCGCCTGCGCCTGCGGCCGATCCTGATGACCTCGATCGCCTTCATCATGGGTGTGGTGCCCCTGGTGTTCAGCTCCGGCGCAGGTTCGGAAATGCGCCATGCCATGGGGGTGGCGGTGTTCTCGGGGATGATCGGCGTGACCGTGTTCGGCCTGTTCCTCACCCCGGTGTTCTTCTTCCTGATCCGCCGTTTCGTCGAGCGTCGCCAGGCCCGCAAGGCTGAACACGCTCAAGTGCTGGAGAACCACGCATGAACCTGCTCAAACCCTTGACCCCAAGCCTGC > NC_002947/3881082‑3881375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |