New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3915087 = | 51 (0.860) | 9 (0.160) | 8/244 | NT | 15.2% | coding (56/1176 nt) | PP_3455 | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
? | NC_002947 | 3915136 = | 52 (0.920) | coding (105/1176 nt) | PP_3455 | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
TTCACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGAA > NC_002947/3914940‑3915232 | ttcAGACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGc < 7:67751/149‑1 (MQ=255) ttcACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGc > 4:350888/1‑149 (MQ=255) ttcACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGc > 6:155090/1‑149 (MQ=255) cacaCTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGc < 3:326884/147‑1 (MQ=255) acacTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCATTAGCATATACACGGTCATCAACGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCt > 5:66024/1‑148 (MQ=255) cgcggtacacccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggTCCt > 8:281189‑M1/144‑147 (MQ=255) cacTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGt < 5:155090/149‑1 (MQ=255) gCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCa < 2:250571/149‑1 (MQ=255) gagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGcc < 8:196299‑M1/3‑1 (MQ=255) gagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGcc > 7:196299‑M1/128‑130 (MQ=255) cTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGc > 1:276445/1‑148 (MQ=255) cTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGc > 5:147822/1‑148 (MQ=255) aGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAg < 4:369211/149‑1 (MQ=255) gTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAgcg > 3:154275/1‑149 (MQ=255) gTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAgcg > 5:91129/1‑149 (MQ=255) gTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAgcg > 6:249058/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGAc > 6:149867/1‑140 (MQ=255) aaCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGAc < 5:149867/140‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGa < 7:256253/148‑1 (MQ=255) aCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGTTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGc < 2:276445/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGc > 5:330073/1‑147 (MQ=255) gcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTTCGTCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGa > 5:320850‑M1/108‑149 (MQ=255) cccAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACg > 7:356727/1‑148 (MQ=255) acgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGaa < 1:56529‑M1/44‑1 (MQ=255) cgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAg > 2:56529‑M1/103‑149 (MQ=255) gCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg > 8:101051/1‑149 (MQ=255) tcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg < 7:216354‑M1/48‑1 (MQ=255) tcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg > 8:216354‑M1/97‑144 (MQ=255) gTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGccccc < 7:17031/149‑1 (MQ=255) tGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCAcc > 4:117926/1‑149 (MQ=255) aGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCgcgc > 3:185270/1‑147 (MQ=255) ggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAg < 5:192156‑M1/47‑1 (MQ=255) ggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAg > 6:192156‑M1/85‑131 (MQ=255) tataCACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTgc < 4:154275/149‑1 (MQ=255) ataCACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTgcg > 3:80344/1‑149 (MQ=255) cacGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCACTTGcgcgg < 7:305510/149‑2 (MQ=255) cacGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGcgcg < 6:91129/148‑1 (MQ=255) acGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCA‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGcgcg > 7:242531/1‑147 (MQ=255) ggTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAg > 4:187847/1‑148 (MQ=255) tcatcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAAccc < 3:117926/149‑1 (MQ=255) catcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg > 5:69512/1‑118 (MQ=255) catcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg < 6:69512/118‑1 (MQ=255) atcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCt < 4:80344/148‑1 (MQ=255) tcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTg > 7:36899/1‑148 (MQ=255) ctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGcc > 5:89608‑M1/67‑103 (MQ=255) ctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGcc < 6:89608‑M1/37‑1 (MQ=255) aaGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACt < 8:356727/149‑1 (MQ=255) cGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGc < 8:36899/148‑1 (MQ=255) cATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCAc < 3:187847/149‑1 (MQ=255) gCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTgg > 5:230183/1‑149 (MQ=255) ctactaCCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGc > 5:165816/1‑148 (MQ=255) actacCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCAt < 3:350888/149‑1 (MQ=255) tacCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACCGCGCCGAGCCAGACGACCAGGCCCCCACCGCGCAAGGGCGCGTAGACACCCTGCAACTGCCGCCACTGGCCAGca > 7:153662/1‑149 (MQ=255) cccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATcag > 8:166166/1‑148 (MQ=255) ccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATcag > 5:293911/1‑147 (MQ=255) tctcCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGt < 4:78915/112‑1 (MQ=255) tctcCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGt > 5:262794/1‑149 (MQ=255) ccGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACt < 6:147822/149‑1 (MQ=255) ccGTGCCCGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACt > 5:179479/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGcc < 6:179479/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGcc > 2:270065/1‑149 (MQ=255) gcCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCg > 4:145680/1‑148 (MQ=255) gcgcTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTcgc < 8:242531/149‑1 (MQ=255) gcgcTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTcg < 6:330073/148‑1 (MQ=255) ccTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAcc > 5:155159/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCt > 7:348761/1‑87 (MQ=255) cTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCt < 8:348761/87‑1 (MQ=255) cTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAccg < 3:145680/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAcc < 6:223392/144‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAcc > 5:223392/1‑144 (MQ=255) tGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGc > 1:224341/1‑140 (MQ=255) tGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGc < 2:224341/140‑1 (MQ=255) aGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGaa < 6:293911/147‑1 (MQ=255) | TTCACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCTGTCC‑‑CTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGAA > NC_002947/3914940‑3915232 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |