New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4316196 | 44 (0.740) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.5% | coding (279/1554 nt) | PP_3788 | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4316253 | 45 (0.800) | coding (336/1554 nt) | PP_3788 | non‑ribosomal peptide synthetase |
ACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCTCTCGTCTCTGTTTTCGGG > NC_002947/4316050‑4316339 | aCCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTgg < 6:390460/148‑1 (MQ=255) cAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTAc < 3:344311/148‑1 (MQ=255) gCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTg < 3:247530/149‑1 (MQ=255) tAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATc > 7:50720/1‑149 (MQ=255) aGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATc < 7:61545/147‑1 (MQ=255) aTCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATcgccg > 5:300038/1‑148 (MQ=255) aaCTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATACCGTCGGTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGc > 3:304769/1‑148 (MQ=255) cTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACt > 6:279250/1‑121 (MQ=255) cTGCACGCTCGGCCGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACt < 5:279250/121‑1 (MQ=255) tCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCAGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGc > 5:146528/1‑149 (MQ=255) tGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTc < 4:304111/104‑1 (MQ=255) tGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTc > 3:304111/1‑104 (MQ=255) gCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGa > 8:68239/1‑149 (MQ=255) cATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGAt > 5:166931/1‑149 (MQ=255) cATGAACTCGGCGTGCGCAGCAGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCg < 6:146528/147‑1 (MQ=255) aTGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATc < 7:68239/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCgg < 1:192073/139‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCgg > 2:192073/1‑139 (MQ=255) aCTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCACTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGc < 8:50720/148‑1 (MQ=255) cgcAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGttcgcagatcgcccgcttgcgctcaggcggcagagctgcggcgattggcaagtagaccaggccag < 7:101354‑M1/149‑66 (MQ=255) gcAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATc < 8:315281/98‑1 (MQ=255) gcAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATc > 7:315281/1‑98 (MQ=255) cAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGttcgcagatcgcccgcttgcgctcaggcggcagagctgcggcgattggcaagtagaccaggccagc < 7:191287‑M1/148‑67 (MQ=255) cAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGttcgcagatcgcccgcttgcgctcaggcggcagagctgcggcgattggcaagtagaccaggccagc > 8:191287‑M1/1‑82 (MQ=255) aTGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTc < 6:166931/149‑1 (MQ=255) gtgGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCAt > 3:309377/1‑149 (MQ=255) ggTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACg > 3:342963/1‑148 (MQ=255) aTGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGa < 4:309377/148‑1 (MQ=255) aTGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAg < 2:272832/149‑1 (MQ=255) tGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAg > 1:291451/1‑148 (MQ=255) gCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCcggccggc < 4:237964/128‑1 (MQ=255) gCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCcggccggc > 3:237964/1‑128 (MQ=255) gACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAAcaggcc < 6:267716‑M2/118‑7 (MQ=255) gACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAAcaggcc > 5:267716‑M2/1‑112 (MQ=255) gACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCaa > 5:369934/1‑148 (MQ=255) gACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCaa > 4:265847/1‑148 (MQ=255) gACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCaa > 7:2985/1‑148 (MQ=255) cAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCtga > 4:215642/1‑149 (MQ=255) cTGAGCTATCGCGTCGTTGTGCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCTAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGATCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGACCTGCCGGCCCTCATGATCACGGAGGAGCAAAATCGtgatga < 4:304769/149‑1 (MQ=255) tGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGACTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGAc > 1:268486/1‑149 (MQ=255) gcTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCa < 4:342963/149‑1 (MQ=255) cTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCaa < 3:215642/149‑1 (MQ=255) tCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAAt < 6:300038/147‑1 (MQ=255) gtTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTATACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTg > 3:138014/1‑149 (MQ=255) tGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGctc > 3:131939/1‑149 (MQ=255) gggggTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGctc < 4:351929/148‑1 (MQ=255) ggggTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGctct > 4:345591/1‑149 (MQ=255) gggTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCtctc < 8:2985/149‑1 (MQ=255) gggTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCtctc < 6:369934/149‑1 (MQ=255) gTTACTGCTCGCTGGCCTTGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCtgat < 7:172364/121‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAAcaggccagcgagcagtaaccccaggacaacgacgggatagcgcagttgcactgtcgcattcaccgcaaccacatccccgctg < 7:191287‑M2/148‑83 (MQ=255) gCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAAcaggccagcgagcagtaaccccaggacaacgacgggatagcgcagttgcactgtcgcattcaccgcaaccacatccccgctg > 8:191287‑M2/1‑66 (MQ=255) gCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAg > 3:350800/1‑105 (MQ=255) gCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAg < 4:350800/105‑1 (MQ=255) cTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAAcaggccagcgagcagtaaccccaggacaacgacgggatagcgcagttgcactgtcgcattcaccgcaaccacatccccgctgcg < 7:101354‑M2/149‑85 (MQ=255) ggCCTGttcgcagatcgcccgcttgcgctcaggcggcagagctgcggcgattggcaagtagaccaggccagcgagcagtaaccccaggacaacgacgggatagcgcagttgcactgtc > 5:267716‑M1/1‑6 (MQ=255) ggCCTGttcgcagatcgcccgcttgcgctcaggcggcagagctgcggcgattggcaagtagaccaggccagcgagcagtaaccccaggacaacgacgggatagcgcagttgcactgtc < 6:267716‑M1/118‑113 (MQ=255) gCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCTCTCGTCTCTGTTTTCggg < 3:345591/148‑1 (MQ=255) gCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCTCTCGTCTCTGTTTTCgg < 5:379348/147‑1 (MQ=255) cTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCt < 8:151030/102‑1 (MQ=255) cTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCt > 7:151030/1‑102 (MQ=255) | ACCTACAGCGAACTAAGGATCGAACTGCTCACACTGCACGCTCGGCTGCATGAACTCGGCGTGCGCAGCGGGGATGTGGTTGCGGTGAATGCGACAGTGCAACTGCGCTATCCCGTCGTTGTCCTGGGGTTACTGCTCGCTGGCCTGGTCTACTTGCCAATCGCCGCAGCTCTGCCGCCTGAGCGCAAGCGGGCGATCTGCGAACAGGCCCGGCCGGCCCTCATGATCACGGACGAGCAAAAGCCTGATGACGCAATACCAACCTGTACGCTCTCGTCTCTGTTTTCGGG > NC_002947/4316050‑4316339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |