New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ATACTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACG > NC_002947/4780093‑4780384 | aTACTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGc > 6:74868/1‑149 (MQ=255) tACTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGcc > 7:71839/1‑149 (MQ=255) ctggtcaacgcctacggcccggcggagtgttccgacgacgtggcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGcc < 8:360045‑M1/3‑1 (MQ=255) aCTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCg > 1:79461/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCgg > 3:164420/1‑149 (MQ=255) cTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCgg > 7:247659/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGc > 4:69800/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGc > 6:295415/1‑149 (MQ=255) gtcaacgcctacggcccggcggagtgttccgacgacgtggcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGc < 1:242421‑M1/6‑1 (MQ=255) gtcaacgcctacggcccggcggagtgttccgacgacgtggcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgagctcaacgacctgctcgaaccgaaGCCg > 1:216594‑M1/144‑147 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGc > 1:168088/1‑148 (MQ=255) cAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGcc < 4:72580/148‑1 (MQ=255) cAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGc < 1:161889/147‑1 (MQ=255) 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tGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGt < 4:971/149‑1 (MQ=255) ccGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTg > 7:114686/1‑148 (MQ=255) ccGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTg < 4:164420/148‑1 (MQ=255) agcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGCCCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCGCCGAGcggg < 7:250598‑M1/106‑2 (MQ=255) cACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGc < 1:144558/149‑1 (MQ=255) cGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTg < 5:125942/149‑1 (MQ=255) ggATCCCCAAGGTAACCGCGACCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTAGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGc < 2:355659/149‑1 (MQ=255) gATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCg > 6:326367/1‑149 (MQ=255) cccAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCgg < 6:348373/116‑1 (MQ=255) cccAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCgg > 5:348373/1‑116 (MQ=255) cccAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGtcat < 2:51478/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTg < 2:242388/84‑1 (MQ=255) ccAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTg > 1:242388/1‑84 (MQ=255) cAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGtcatca > 5:348214/1‑149 (MQ=255) aaGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATcac < 3:261405/149‑1 (MQ=255) ggTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATcacgc < 3:334377/149‑1 (MQ=255) ccGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAg > 4:139779/1‑149 (MQ=255) acCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGtt > 2:251252/1‑63 (MQ=255) acCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGtt < 1:251252/63‑1 (MQ=255) acCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCa < 6:166448/149‑1 (MQ=255) cTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCa < 5:19088/147‑1 (MQ=255) cTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCAcg > 6:55219/1‑149 (MQ=255) cTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCAcg > 7:360045/1‑149 (MQ=255) cTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCAcg > 2:372579/1‑149 (MQ=255) cTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCCGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCa > 6:19088/1‑147 (MQ=255) | ATACTCCAGGGTCTGCCCATCGGCGCACACGTGCGCCAGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCC‑‑‑‑‑‑ACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAT‑CGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACG > NC_002947/4780093‑4780384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |