New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5164442 | 60 (1.020) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 6.6% | coding (3438/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
? | NC_002947 | = 5164477 | 55 (0.970) | coding (3403/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
CACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAG > NC_002947/5164298‑5164588 | cacCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAg < 3:67304/148‑1 (MQ=255) acCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGGTGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCCCGGCATGCTCGGCCCAGCt < 3:345686/149‑1 (MQ=255) gCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCt > 3:371143/1‑149 (MQ=255) cTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCtgg > 2:287726/1‑147 (MQ=255) cTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTg > 6:299032/1‑149 (MQ=255) cTAGCTGATGAATGATGTCGTTCACTGACACCCCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCACTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCTCAGCTTCAGCACTACCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGCCCCTCGGAATGCTCGGCCCAGCTGCCGCTCtt > 8:311580/1‑148 (MQ=255) tgctgctTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGtt > 5:140707/1‑148 (MQ=255) aTGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAgcgc < 4:296572/149‑1 (MQ=255) tCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGc < 2:137042/149‑1 (MQ=255) gTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGc‑‑c < 7:326562/148‑1 (MQ=255) gTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGc‑‑c > 2:62596/1‑148 (MQ=255) ttCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑Caa < 7:311580/149‑1 (MQ=255) aGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggc < 5:169451‑M1/149‑39 (MQ=255) aCCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCcagctgccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgag < 1:287726‑M1/149‑45 (MQ=255) aCCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCAcc > 4:138146/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGCTCAGGTCCATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgagcat < 3:12542‑M1/149‑46 (MQ=255) cTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCa < 6:153085/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTc < 5:55649/142‑1 (MQ=255) tCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTc > 6:55649/1‑142 (MQ=255) tCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTgg > 1:231698/1‑148 (MQ=255) aGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCaa < 2:231698/149‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACg > 4:227793/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgtt < 1:62596/143‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 5:299032/147‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 3:102352/147‑1 (MQ=255) cccTTGAAGCGCTTCTCCAGCCCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCCCGGCATGCTCGGCCttggccgcgctggctgaacgcaagcgcggcagctgggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcaga < 6:164908‑M1/148‑68 (MQ=255) ccTTGAAGCGTTGCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGG‑CTGCCTTGCCAGGCGCGCGGCATGCGCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCt < 7:112212/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGcgcg > 6:250883/1‑109 (MQ=255) cTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGcgcg < 5:250883/109‑1 (MQ=255) cTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGcgcg > 4:115465/1‑109 (MQ=255) cTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGcgcg < 3:115465/109‑1 (MQ=255) aaGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCaa < 1:336295/148‑1 (MQ=255) tCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCa < 3:227793/148‑1 (MQ=255) gCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTGCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGc > 1:51624/1‑107 (MQ=255) gCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGc < 2:51624/106‑1 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGt > 6:172207/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTTCAGCACTTACTGGGT‑CTGCCTTGCGAGTCGCTCTGCATGCTCGGACGAGCTTCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGG‑‑CAAGGCCGCACCTTCAAGTGGCATCGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTgg < 4:229812/149‑1 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc > 4:303538/1‑140 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc < 3:303538/140‑1 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTg > 3:332058/1‑146 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTg < 4:332058/146‑1 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc > 6:276251/1‑148 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc > 7:13113/1‑148 (MQ=255) aGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGACTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcag < 7:188883/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcagca < 8:13113/149‑1 (MQ=255) aGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGaa < 3:138146/148‑1 (MQ=255) gCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATg > 3:40501/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGAt < 5:307114/117‑1 (MQ=255) ttCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGAt > 6:307114/1‑117 (MQ=255) ttCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGt < 5:21966/125‑1 (MQ=255) ttCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGt > 6:21966/1‑125 (MQ=255) aGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGAc < 5:276251/149‑1 (MQ=255) aGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGAc < 5:172207/149‑1 (MQ=255) t‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgggcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatgggctggagaagcgcttcaaggg < 6:164908‑M2/148‑82 (MQ=255) t‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGATCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAgc > 1:308982/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCt > 3:220989/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAgcgc < 6:140707/147‑1 (MQ=255) cTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTc > 5:174750/1‑149 (MQ=255) cTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTc > 4:349351/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTAc > 6:332473/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACGTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGGCGAATGTCTTCGACGAGCGCtgagacc > 8:289832/1‑143 (MQ=255) aGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTTCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCg > 5:96204/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGc < 3:349351/149‑1 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCa > 4:12880/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatggacctgagccaagcgg < 3:12542‑M2/149‑105 (MQ=255) cTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCAGCTGggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagcggt < 1:287726‑M2/149‑106 (MQ=255) cTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACgg > 4:92717/1‑148 (MQ=255) tCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTAccc < 4:71346/133‑1 (MQ=255) tCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTAccc > 3:71346/1‑133 (MQ=255) gCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagcggtggcact < 5:169451‑M2/149‑112 (MQ=255) gCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcag < 6:174750/149‑1 (MQ=255) | CACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGT‑CTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAG > NC_002947/5164298‑5164588 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |