| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5628075 | 91 (1.540) | 5 (0.090) | 4/244 | NT | 5.2% | coding (456/837 nt) | rlmJ | 23S rRNA (adenine(2030)‑N(6))‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 5628112 | 94 (1.670) | coding (419/837 nt) | rlmJ | 23S rRNA (adenine(2030)‑N(6))‑methyltransferase | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCGACGG > NC_002947/5627930‑5628222 | gcTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCGCCgg > 3:66468/1‑148 (MQ=255)gcTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgc < 7:21138/149‑1 (MQ=255) tGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATAGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgcag < 3:161316/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATCGGGTACGAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGTCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgcagca < 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ccTTGATCGGGTACCAGAT‑GCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCtgggtgaagg > 4:370486‑M1/1‑139 (MQ=255) cTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAgg > 3:162551/1‑149 (MQ=255) cTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAgg < 6:323792/149‑1 (MQ=255) cTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAgg > 2:53163/1‑149 (MQ=255) cTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAgg > 5:323792/1‑149 (MQ=255) cTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAg < 6:45632/148‑1 (MQ=255) gATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGc < 5:68653/147‑1 (MQ=255) tCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgc > 7:349604/1‑137 (MQ=255) tCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgc < 8:349604/137‑1 (MQ=255) tCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCcgc > 1:137287/1‑149 (MQ=255) gTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGca 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gCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCgg < 7:10647/149‑1 (MQ=255) gCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCgg > 5:95303/1‑149 (MQ=255) cATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGt < 3:343877/149‑1 (MQ=255) cATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGt > 5:291301/1‑149 (MQ=255) tGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTcc > 6:29378/1‑149 (MQ=255) tCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCctgc < 8:198378/149‑1 (MQ=255) gcgcgcTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGc > 1:170224/1‑105 (MQ=255) gcgcgcTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGc < 2:170224/105‑1 (MQ=255) cgcgcTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTgg < 8:104061/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGgc < 3:332330/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCGTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGATCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCTTTAAGCAGGGCGCGCTCCTTCTGgc > 4:235645/1‑149 (MQ=255) tCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGAGGCACATGCCAGCCTTCACCCAgttgcaggaaaagcgcgagatcatgctgatcgacccgccgttcgagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggcctcatg < 2:18625‑M2/149‑104 (MQ=255) ccTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAgg > 5:197174/1‑149 (MQ=255) cTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAggtgcaggaaaagcgcgcgatcatgctgatcgacccgccgttcgagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggccgcatgcg < 5:127512‑M2/149‑106 (MQ=255) tGCACCtgggtgaaggctggcatgtgccgcgggccttgctgccggtgcaggaaaagcgcgcgatcatgctgatcgacccgccgttcgagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggccgcatgcgc < 6:162193‑M1/149‑144 (MQ=255) tGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCg > 7:150341/1‑149 (MQ=255) gCACCtgggtgaaggctggcatgtgccgcgggccttgctgccggtgcaggaaaagcgcgcgatcatgctgatcgacccgccgttagagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggccgcatgcgc > 1:88045‑M1/1‑5 (MQ=255) gCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAggtgcaggaaaagcgcgcgatcatgctgatcgacccgccgttcgagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggccgcatgcgc < 3:370486‑M2/148‑107 (MQ=255) cACCtgggtgaaggctggcatgtgccgcgggccttgctgccggtgcaggaaaagcgcgcgatcatgctgatcgacccgccgttcgagcaggccgatgagctcaaacgctgcaccacggccatgaaagaggcgatcggccgcatgcgc > 8:103576‑M1/1‑4 (MQ=255) cACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCGAc < 2:287389/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCGACgg < 8:117297/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCGACgg < 7:111074/149‑1 (MQ=255) | GCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGGTCACGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGCTGGCGCATCAGGCGACGG > NC_002947/5627930‑5628222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |