New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5734041 | 58 (0.980) | 5 (0.090) | 5/232 | NT | 8.6% | intergenic (‑67/+90) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
? | NC_002947 | = 5734096 | 54 (1.010) | intergenic (‑122/+35) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
GGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAA > NC_002947/5733894‑5734187 | ggTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCa < 5:154805/149‑1 (MQ=255) aTGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCg > 4:296271/1‑148 (MQ=255) aTGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGc > 7:64300/1‑149 (MQ=255) ggCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTc > 2:90623/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTTTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacag < 3:232326‑M1/149‑17 (MQ=255) gCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 3:325169/149‑1 (MQ=255) aGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGGGa > 5:326903/1‑149 (MQ=255) ggCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCCCACCCACACGGGAT‑g > 2:142164/1‑149 (MQ=255) ggCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑g < 3:296271/149‑1 (MQ=255) ggCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑g < 5:319501/149‑1 (MQ=255) ccATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTTCGCAGCCACTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGAT‑Ggt > 8:212867/1‑149 (MQ=255) ccATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑Ggt < 3:372228/149‑1 (MQ=255) ccATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑Ggt < 6:18438/149‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGtttt < 7:296691/148‑1 (MQ=255) aaCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGtttt < 1:90623/148‑1 (MQ=255) cGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCa < 4:334284/149‑1 (MQ=255) gtgGCGGGCACTTAGCCGGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCATCTa < 1:53217/148‑1 (MQ=255) cGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCt > 4:114509/1‑149 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTc > 3:186858/1‑147 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTc < 4:186858/147‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTGAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 8:279926/149‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTAGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 5:144746/149‑1 (MQ=255) cACTTAGCCCGCGATTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGGGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTgg < 7:212867/149‑1 (MQ=255) taagtgCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTgg > 6:203762/6‑148 (MQ=255) agtgCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTgg < 5:203762/143‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCGGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACCTGGGAT‑GGTGTTTTGCACATACTTCagtgcggcct > 3:236634/1‑143 (MQ=255) cccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtggg > 6:203159‑M1/1‑97 (MQ=255) cccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtggg < 5:203159‑M1/143‑47 (MQ=255) ccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGgc < 2:293739/149‑1 (MQ=255) cTTGAGACCTTGCGCTTGTTGCATGCCACGCCCTTTAATTGTTTTTGTGGGCGTTAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACCGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCgcc > 6:240323‑M2/1‑146 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtggga > 7:346516‑M1/1‑88 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatcccctgtggga < 8:346516‑M1/135‑48 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCT‑GGTGTTTTGGACCAAATTCTGTGGGCGCGGGCCCgccccc < 3:284752‑M2/149‑7 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCtgt > 6:130865/1‑131 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 5:130865/131‑1 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑Ggt < 1:181631/106‑1 (MQ=255) ttGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑Ggt > 2:181631/1‑106 (MQ=255) cTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCt < 6:354509/118‑1 (MQ=255) cTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCt > 5:354509/1‑118 (MQ=255) cATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACATCTGTGGGAGCGGgc < 4:268683/123‑1 (MQ=255) cATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACATCTGTGGGAGCGGgc > 3:268683/1‑123 (MQ=255) aTGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGACCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGGACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGcc > 7:266011/1‑149 (MQ=255) gTCACGTCCTTGATTTGTTTTTGTGGGCGTGAGATTCTGGGGGCGGCGGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGTG‑GGGGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGcc < 6:326903/147‑1 (MQ=255) tCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTTCCCCTACTTATGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGCAGGGCCGCCCCG‑CGGCCCCa > 4:111773/1‑149 (MQ=255) cGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCGCACCCCCAGGGGGT‑GGGGTTTTGCCCCGACTTCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCG‑CGGCCCCCggg > 8:14420/1‑149 (MQ=255) cTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGt > 2:19658/1‑149 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTa < 3:114509/148‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTa > 2:266485/1‑147 (MQ=255) ttGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCAACCACAGGGGAT‑GGTGTTTTTCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGGCCGCCCAG‑CCGCCCCAGGGGCGTTAAAgg > 7:227395/1‑149 (MQ=255) tGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGGCCCCCCCCAACCCCAGGGGGTGGGGGTTTTGC‑CCGACGTGTGTGGGGGCGGGGGCGGCCCCGACGGGCCGCCCCGCCGGCCCCGGGGCCGttcacgc > 8:258619/1‑144 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt > 8:114561/1‑149 (MQ=255) ttttGTGGTCGTGAGATTCTGGGGGCTGCGGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt < 1:142164/148‑1 (MQ=255) tttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg > 8:73782/1‑149 (MQ=255) ttGGGGTCGGGAGATCCAGGGGGGGGCTGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCTGGGGTT‑GGGGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 7:14420/148‑1 (MQ=255) tctgGTCGTCAGATTCCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 1:193318/145‑1 (MQ=255) gTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCCCCACCCACACGGGAT‑TGTGTTTTGGACCGAATTAGGTGGGGGCCGGCCCCCCCCCGCACGGCCCCCCCC‑CCGCCCCCCGGGCGGTACAGGCGTgggcga > 2:193318/1‑143 (MQ=255) ttCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 4:82730/134‑1 (MQ=255) ttCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg > 3:82730/1‑134 (MQ=255) aGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGgca < 7:73782/148‑1 (MQ=255) aGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTCCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGgcag < 3:111773/149‑1 (MQ=255) ggggCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACAAGGGAT‑TGTGTTTTTGACCAAAATATTTGGGAGCGGGCGCCCCCCCGCAGGGCCGCCCCGCCGCCCCCCGGGGGGTTA‑ACGCGTGTCAGTAAACCCCCCcgccgc > 2:142519/1‑148 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGc < 7:209312/149‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACCCCAGCAGCCACACGGGAT‑GGTTTTTTGCACCGAATTCAGTCGCAGCGCGCCCCCCCGCCCAGGGCCCCCCAG‑CCGCCCCACCGGCGGGACAGGCGTGGCCGGACAACCGCCGCGAGCAAAcccg > 6:316709/1‑147 (MQ=255) ctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACGTCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGt > 3:114527/1‑149 (MQ=255) tcgcacccccgTTCGGGGCCAGGCCCTCCCCCCCGGGGTTG‑GGTGTTTGCCACCACCTTCGGGGGCTGCGGCCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTc < 7:131190/142‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCa < 7:114561/149‑1 (MQ=255) gggggcgggcccgcgcccacagaatttggtccaaaacaccagcccctgtgggagcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctcacgaccacaaaaacaattcaaggacgtgacatgcaacaagctcaaggtctc < 3:284752‑M1/147‑144 (MQ=255) ggCgcgcccgctcccacagaagtaggtgcaaaacaccatccccggtgggggcgggcgtgcccgcgaaggggctgcgcagcagccccctgaatctaacgcccacaaaaacaattaaagggcgtggcatgcaacaagcgcaaggtctcaag > 6:240323‑M1/1‑3 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCaa > 4:351093/1‑148 (MQ=255) | GGTGCCGATGGCGGAGCCGAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAT‑GGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAG‑CGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAA > NC_002947/5733894‑5734187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |