New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5783372 | 70 (1.180) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 5.9% | coding (1847/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
? | NC_002947 | = 5783399 | 61 (1.070) | coding (1874/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
GCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGC > NC_002947/5783224‑5783520 | gCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCG > 6:53579‑M1/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTg < 2:342195/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACt < 2:360447/149‑1 (MQ=255) ccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCTCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCTT‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtttg < 3:54430/149‑1 (MQ=255) ccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCTGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 8:49435/149‑1 (MQ=255) ccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg < 5:159373/149‑1 (MQ=255) ccgcACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACtgtg > 6:26338/1‑149 (MQ=255) aCTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGc > 7:197972/1‑149 (MQ=255) ctctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCt > 4:300606/1‑149 (MQ=255) ctctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCt > 1:145998/1‑149 (MQ=255) ctGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTgg > 6:359880/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTgg < 4:24098/149‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCCCCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTc < 3:251306‑M2/149‑2 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTc > 5:26338‑M2/1‑146 (MQ=255) gCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCACCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTcg > 1:24088‑M2/1‑146 (MQ=255) ccAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTgtggt > 6:343240/1‑132 (MQ=255) ccAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTgtggt < 5:343240/132‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCAc > 1:217270/1‑140 (MQ=255) ccAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCAc < 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tgtTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGcc > 7:198000/1‑149 (MQ=255) ttCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa < 7:27326/149‑1 (MQ=255) ttCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGa < 8:197972/149‑1 (MQ=255) tCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAg > 5:181207/1‑149 (MQ=255) tCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAg > 1:253693/1‑149 (MQ=255) cTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAg < 2:145998/148‑1 (MQ=255) tACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGaccagtgccagcaccacagtgcccaggcggc < 7:93769‑M1/129‑32 (MQ=255) tACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGaccagtgccagcaccacagtgcccaggcggc > 8:93769‑M1/1‑98 (MQ=255) acacCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCAc > 1:273375/1‑149 (MQ=255) acacCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCAc > 4:105641/1‑149 (MQ=255) cacCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCAcc < 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< 7:142746/147‑1 (MQ=255) ccGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGa > 1:252089/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGa < 7:273179/148‑1 (MQ=255) acaAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTAt < 6:78057/149‑1 (MQ=255) caAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATg > 5:173680/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAAt < 2:284024/149‑1 (MQ=255) 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tGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccag < 3:364955‑M2/149‑112 (MQ=255) ggTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggc > 4:124235‑M2/1‑36 (MQ=255) ggTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTctg < 2:145593/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTctgctg > 7:161080/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTctgctg > 3:94443/1‑149 (MQ=255) cGCCGaccagtgccagcaccacagtgcccaggcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggcctgg < 4:193746‑M1/149‑145 (MQ=255) gccgccTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgta < 7:93769‑M2/129‑99 (MQ=255) gccgccTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgta > 8:93769‑M2/1‑31 (MQ=255) cgccTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTcag < 6:173680/149‑1 (MQ=255) cGaccagtgccagcaccacagtgcccaggtggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggcctgggc > 1:24088‑M1/1‑2 (MQ=255) gaccagtgccagcaccacagtgcccaggcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggtgcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggcctgggc > 5:26338‑M1/1‑1 (MQ=255) gaccagtgccagcaccacagtgcccaggcggcgaacccagccgcgcaggaactcgacctgcggtttgtgccagcggaagtggacttccgccacgccaccgggggcgaggatacggtaggcggtgtagaacaccagccaggcctgggcca < 3:251306‑M1/149‑149 (MQ=255) | GCCAACCTGGGCGCCGCACTCTGGCAGCTGGCCCAGGCCTGGCTGGTGTTCTACACCGCCTACCGTATCCTCGCACCCGGTGGCGTGGCGGAAGTCCACTTCCGCTGGCACAAACCGCAGGTCGAGTTCCTGCGCGG‑CTGGGTTCGCCGCCTGGGCACTGTGGTGCTGGCACTGGTCGGCGTGGTGGCGGTGGCCGAGCACCAGCCTTCGGCACTGGCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGC > NC_002947/5783224‑5783520 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |