| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5903769 | 48 (0.810) | 10 (0.180) | 9/236 | NT | 14.4% | intergenic (+25/+82) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 5903831 | 75 (1.380) | intergenic (+87/+20) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease | |||||
CCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACC > NC_002947/5903621‑5903916 | ccATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCA < 1:261775‑M1/149‑1 (MQ=255) cATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAc > 2:79540‑M1/1‑148 (MQ=255) tGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAttc > 2:71534/1‑147 (MQ=255) gcTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCg > 2:113394/1‑149 (MQ=255) gCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGc > 3:133964/1‑140 (MQ=255) gCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGc < 4:133964/140‑1 (MQ=255) aGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCAGGTAAATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 2:235615/1‑147 (MQ=255) aaGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAggg < 8:116616/149‑1 (MQ=255) atggtgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGTTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTc < 5:11292/146‑1 (MQ=255) tgtgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacct > 1:336236‑M1/1‑127 (MQ=255) tgtgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcac > 8:182943/1‑149 (MQ=255) gTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAc > 2:162544/1‑149 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGaa < 1:44665/148‑1 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGaa < 7:181256/148‑1 (MQ=255) gCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGc < 7:182943/149‑1 (MQ=255) gTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggt < 1:79540‑M1/149‑43 (MQ=255) ttgttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagcc > 4:242370‑M1/1‑102 (MQ=255) ttgttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTcc > 7:245389/1‑149 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtg > 3:233801/1‑149 (MQ=255) gCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtgtg > 7:59580/1‑149 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACTTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTAGCGGGCAggcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtg < 6:375646‑M1/148‑53 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCTTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgg < 2:336236‑M1/149‑54 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtg < 6:159631‑M1/148‑53 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTgg < 1:162544/149‑1 (MQ=255) ccAAGCCCTTAAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTgg < 3:304939/149‑1 (MQ=255) cAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTgg > 3:152337/1‑148 (MQ=255) aTCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAg > 8:87732/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgg < 3:242370‑M1/149‑60 (MQ=255) gAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGc < 3:312871/147‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCg < 1:87964/148‑1 (MQ=255) cTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgt > 6:216575‑M1/1‑81 (MQ=255) cTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgt < 5:216575‑M1/132‑52 (MQ=255) gATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcga > 1:111465‑M2/1‑140 (MQ=255) gATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgcccgcg < 4:114628‑M2/148‑9 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGTAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa < 8:194650/149‑1 (MQ=255) tATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATTCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAAGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGt > 3:12460/1‑147 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCCCAGGGCTCACCACAAACC‑AGAAGGCTGG‑GAGGTGCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg > 5:2381/1‑149 (MQ=255) tCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAgg < 3:114628/149‑1 (MQ=255) ggACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCAtgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagcc > 6:129497‑M1/1‑59 (MQ=255) ggACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGa > 1:229064/1‑149 (MQ=255) aCTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACg > 7:298302/1‑149 (MQ=255) tCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGc > 3:56994/1‑149 (MQ=255) tCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCCGGCAAGAACGCACCCACATGCCTCACCACAACCA‑TCAAAGCAGA‑GAAGGACCAGTTGGATCGGGCGTTGCCACGCAAGGGCCAGGTCAGGCCGAccaagc > 4:325702/1‑144 (MQ=255) ccACATTGGTATGCGGTTTGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgc > 2:356959‑M2/1‑114 (MQ=255) ccACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGtgc < 1:356959‑M2/117‑4 (MQ=255) actttGGTATGGGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGTGCCTTCGCGGGCATGCCGGCTCCCACTGGGCTCACCACAACCC‑TGATGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCAc < 4:233801/146‑1 (MQ=39) acaTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCAc > 7:328035/1‑149 (MQ=255) acaTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCAc < 7:87732/149‑1 (MQ=255) aTTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCt < 8:245389/149‑1 (MQ=255) ttGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCAGGGCTCACCACAACCCTTCATGGTCGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCt < 1:113394/149‑1 (MQ=38) tGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATTCCCCCAACCACACGGCAACCCACAACCC‑AGAAAGCAGT‑GAGGTACCAGTGGGGGCGGGCGGGCCCCCGAAAGGGCCAGGTAACGCCGCCGCCGCCACCAgc > 4:173885/1‑149 (MQ=255) tGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCgg > 6:100759/1‑149 (MQ=255) cGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCggg < 1:235615/148‑1 (MQ=255) ggCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCtg < 6:150768/72‑1 (MQ=255) ggCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCtg > 5:150768/1‑72 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGAc < 4:56994/149‑1 (MQ=255) gCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGAc < 8:328035/149‑1 (MQ=255) tttGAATGGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGATGGCTGT‑GTGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCt < 6:2381/149‑1 (MQ=255) gAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGTCCTGc < 5:100759/148‑1 (MQ=255) gAATCGGTGCTGCAGCCTGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGc < 1:71534/148‑1 (MQ=255) aaTCGGTGCTGGAGCCTTCGCTGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCgg < 8:265143/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCt < 8:298302/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGc < 2:229064/149‑1 (MQ=255) aGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGCCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGtt < 3:325702/149‑1 (MQ=255) ctttCGCGCGCACGCCCGCTCCCACAGGG‑ACCTCACAGCCT‑TCAGGGTTGTGGTGAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTgg < 5:200971/147‑1 (MQ=14) tCGCGGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatc > 1:111465‑M1/1‑9 (MQ=255) tCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGa > 7:351530/1‑138 (MQ=255) tCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGa < 8:351530/138‑1 (MQ=255) cgcgGGCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatc < 4:114628‑M1/148‑141 (MQ=255) gCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtgg < 1:356959‑M1/117‑115 (MQ=255) gCAcgcccgctcccacagggacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaacgctccagcaccgattcaaagccaaaccgcataccaatgtgg > 2:356959‑M1/1‑3 (MQ=255) aTGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCAcc > 2:181168/1‑148 (MQ=255) | CCATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCC‑TGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACC > NC_002947/5903621‑5903916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |