| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 531496 = | 74 (1.250) | 5 (0.090) | 3/246 | NT | 7.0% | coding (461/750 nt) | coaX | type III pantothenate kinase |
| ? | NC_002947 | 531549 = | 61 (1.070) | coding (514/750 nt) | coaX | type III pantothenate kinase | |||||
CCTGGGTACCGCGGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGATGC > NC_002947/531401‑531697 | ccTGGGTACCGCGGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCAt < 5:25850/149‑1 (MQ=255) ctcaagctgggtgtaggcaaagccctggagcatcaatacgcaaccgcgctctaccgcttcgacagtcgagcgacctggtgacaagctgctcaaTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCAt > 3:321935‑M1/94‑147 (MQ=255) ctcaagctgggtgtaggcaaagccctggagcatcaatacgcaaccgcgctctaccgcttcgacagtcgagcgacctggtgacaagctgctcaaTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCAt > 2:265079‑M1/94‑147 (MQ=255) ccGCGGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGagcagc < 2:204896/149‑1 (MQ=255) gcgGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCtt < 6:138672/149‑1 (MQ=255) gcgGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCtt < 7:215609/149‑1 (MQ=255) gcgGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCtt > 7:311267/1‑149 (MQ=255) gcaaagccctggagcatcaatacgcaaccgcgctctaccgcttcgacagtcgagcgacctggtgacaagctgctcaaTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCAt > 1:258430‑M1/78‑131 (MQ=255) gcaaagccctggagcatcaatacgcaaccgcgctctaccgcttcgacagtcgagcgacctggtgacaagctgctcaaTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCAt < 2:258430‑M1/54‑1 (MQ=255) gACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCg < 2:234773/149‑1 (MQ=255) gTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGAc < 3:309202/149‑1 (MQ=255) gTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGAc > 3:161907/1‑149 (MQ=255) tttCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACt > 4:80532/1‑149 (MQ=255) tGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTc > 1:47944/1‑148 (MQ=255) cAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTc < 1:125129/146‑1 (MQ=255) cAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCg > 8:44313/1‑147 (MQ=255) ggCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCgg > 8:235546/1‑148 (MQ=255) gCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGt < 2:47944/148‑1 (MQ=255) gCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAgc < 1:349330/149‑1 (MQ=255) gCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCACGACTGTAGAAGAGGTAGAgc > 2:349330/1‑149 (MQ=255) cTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTc < 4:290962/113‑1 (MQ=255) cTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTc > 3:290962/1‑113 (MQ=255) gggggCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGcgcg < 5:289370/145‑1 (MQ=255) ggggCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGc < 4:188528/149‑1 (MQ=255) aCATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGCCTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTAtt > 6:204400/1‑148 (MQ=255) aCATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACT‑‑CACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGAt > 2:95235/1‑149 (MQ=255) aTCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGAt > 1:366243/1‑149 (MQ=255) cTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGc > 6:192316/1‑149 (MQ=255) aTGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCtt > 6:108026/1‑149 (MQ=255) gCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTAt < 2:362016/131‑1 (MQ=255) gCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTAt > 1:362016/1‑131 (MQ=255) ccATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGc < 7:69792/149‑1 (MQ=255) ccATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGc > 6:179698/1‑149 (MQ=255) cATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCTGCTTGTCACCTGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGcc < 5:264885/149‑1 (MQ=255) cATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGcc < 2:366243/149‑1 (MQ=255) aTTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGcc > 5:128865/1‑148 (MQ=255) aTTGATGAGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCCCGATCCCGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGAAGCTTGACACCAGGTCGCTCGACTGACGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGGTGTGcc > 8:71283/1‑148 (MQ=255) ttGATGGGTAGCCAGCTGCGCACTAACAGCCGTAGGATCCGCTATTACGATGCCTCCGCGGTGCGCGCATTTAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCTGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTa < 7:235546/149‑1 (MQ=255) ttGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCgg < 8:48016/109‑1 (MQ=255) ttGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCgg > 7:48016/1‑109 (MQ=255) tGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTa > 1:170756/1‑148 (MQ=255) gTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAg < 8:288388/149‑1 (MQ=255) gTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAg > 6:362696/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCtgg > 4:318674/1‑147 (MQ=255) cAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGGTTGTCACCAGGTCGCTCGAGTGTCGAAGCGGTAGAGCGAGGATGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTg < 3:163705/148‑1 (MQ=255) cAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGa < 8:311267/149‑1 (MQ=255) aGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAg > 2:6341/1‑149 (MQ=255) aGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAg < 2:170756/149‑1 (MQ=255) atgcgcgctccgcggaggcatcgtcatagcggatccgacgggtgtgagtgcgcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGc > 1:258430‑M2/55‑131 (MQ=255) atgcgcgctccgcggaggcatcgtcatagcggatccgacgggtgtgagtgcgcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGc < 2:258430‑M2/77‑1 (MQ=255) atgcgcgctccgcggaggcatcgtcatagcggatccgacgggtgtgagtgcgcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAg > 2:265079‑M2/55‑147 (MQ=255) atgcgcgctccgcggaggcatcgtcatagcggatccgacgggtgtgagtgcgcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAg > 3:321935‑M2/55‑147 (MQ=255) cgcgctccgcggaggcatcgtcatagcggatccgacgggtgtgagtgcgcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAgg < 1:265079‑M2/97‑1 (MQ=255) CACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTc > 5:179698‑M1/1‑149 (MQ=255) cTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCgt < 5:108026/149‑1 (MQ=255) acacCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGtgtg > 8:277061/1‑149 (MQ=255) acacCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGtgtg > 5:147353/1‑149 (MQ=255) gATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGt > 3:105053/1‑148 (MQ=255) tCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTgag < 7:44313/149‑1 (MQ=255) tCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTgag > 1:340437/1‑149 (MQ=255) cGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTgag > 6:145075/1‑147 (MQ=255) gCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTc < 8:185897/95‑1 (MQ=255) gCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTc > 7:185897/1‑95 (MQ=255) gCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTgaggag > 7:122394/1‑149 (MQ=255) tGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCa < 5:362696/149‑1 (MQ=255) tGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCa < 7:277061/149‑1 (MQ=255) gATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGt > 6:5272/1‑135 (MQ=255) gATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGt < 5:5272/135‑1 (MQ=255) ccTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTc < 5:145075/149‑1 (MQ=255) cTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTc > 3:108325/1‑148 (MQ=255) cTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTc < 4:108325/148‑1 (MQ=255) gcgGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCAAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCAc > 5:17603/1‑149 (MQ=255) cgcgcATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCgg < 1:6341/149‑1 (MQ=255) cgcgcATTGAGCAGCTTGTCACCAGGGCTCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCg < 5:204400/148‑1 (MQ=255) cgcgcATTGAGCAGCTTGTCACCAGGGCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCGTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCgg < 2:91400/149‑1 (MQ=255) gcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGa > 3:217540‑M2/4‑149 (MQ=255) gcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGa < 8:122394‑M2/146‑1 (MQ=255) gcaTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGa > 4:141320‑M2/4‑149 (MQ=255) caTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATAGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGAt < 4:161907‑M2/147‑1 (MQ=255) aTTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGATg > 2:126285‑M2/2‑149 (MQ=255) ttGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGATgc < 4:321935/149‑1 (MQ=255) | CCTGGGTACCGCGGCAAAAGCGGACTTCGTTTCTGCAGATGGCGAGCATCTTGGGGGCTACATCTGCCCAGGTATGCCATTGATGCGTAGCCAGCTGCGCACTCACACCCGTCGGATCCGCTATGACGATGCCTCCGCGGAGCGCGCATTGAGCAGCTTGTCACCAGGTCGCTCGACTGTCGAAGCGGTAGAGCGCGGTTGCGTATTGATGCTCCAGGGCTTTGCCTACACCCAGCTTGAGCAGGCTCGTGTGCTATGGGGTGAGGAGTTCACCGTGTTCCTCACTGGCGGTGATGC > NC_002947/531401‑531697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |