| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 744921 = | NA (NA) | 21 (0.360) | 17/256 | NT | 33.9% | intergenic (‑586/+45) | PP_0636/PP_0637 | cold shock DNA‑binding domain‑containing protein/transposase |
| ? | NC_002947 | 2217629 = | 41 (0.690) | coding (546/828 nt) | PP_1958 | hypothetical protein | |||||
CCTTCTGGAACAGGCTCTGTGCGACCTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCGCAAAGCAAAGAACAT > NC_002947/2217481‑2217777 | tacgtggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacg < 3:63531‑M2/1‑1 (MQ=255) ggctgcgccacgtcctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGaa < 4:194871‑M2/6‑1 (MQ=255) ggAACAGGCTCTGTGCGACCTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAg > 7:304933/1‑149 (MQ=255) tctGTGCGACCTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaaggga < 5:209941‑M2/149‑9 (MQ=255) tgCGACCTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCg < 4:12665/148‑1 (MQ=255) ctggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCg > 8:272644‑M2/130‑148 (MQ=255) tggagcgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGa > 3:242232‑M2/129‑149 (MQ=255) cgactgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTc > 8:70161‑M2/124‑148 (MQ=255) cTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTc > 2:24117/1‑148 (MQ=255) actgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAg < 5:118711‑M2/28‑1 (MQ=255) actgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAg < 1:56020‑M2/28‑1 (MQ=255) actgccgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAg < 8:233402‑M2/28‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAg < 1:24117/148‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAg < 6:342343/148‑1 (MQ=255) cgcacgcctcatcggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGtctc < 6:130835‑M2/33‑1 (MQ=255) gATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTc < 6:101778/121‑1 (MQ=255) gATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTc > 5:101778/1‑121 (MQ=255) aGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGTAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTg < 3:47949/149‑1 (MQ=255) tGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTggg > 7:197590/1‑149 (MQ=255) ggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTggg < 7:70161‑M2/46‑1 (MQ=255) ggtagcagactacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTggg < 4:242232‑M2/46‑1 (MQ=255) gCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTc < 8:304933/149‑1 (MQ=255) agactacgaagctcttctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCTGATTTCGAGGTCTCTGGTAACAGTGGGCTCATg < 4:76663‑M2/52‑1 (MQ=255) tacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCAt < 6:155460‑M2/51‑1 (MQ=255) tacgaagcgctgctgccatggaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCAt > 5:155460‑M2/94‑144 (MQ=255) ttGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATc > 5:123095/1‑149 (MQ=255) tGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATc > 3:183592/1‑148 (MQ=255) gaagaagaaATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACAt > 8:141796/1‑149 (MQ=255) aagaagaaATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctc < 8:191914‑M2/149‑59 (MQ=255) aagaagaaATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATg > 3:371843/1‑149 (MQ=255) gaagaaATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTCGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGCAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccaacttccaaccgtacacctgattaccgatgctgtgctccc < 5:222026‑M2/149‑61 (MQ=255) tctcCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGgttgtctgc > 8:353156/1‑146 (MQ=255) gaactgttcgccagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAg < 7:272644‑M2/76‑1 (MQ=255) ccGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTgg < 6:292986/107‑1 (MQ=255) ccGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTgg > 5:292986/1‑107 (MQ=255) ccGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATg < 6:202976/123‑1 (MQ=255) ccGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATg > 5:202976/1‑123 (MQ=255) cGTCCTTCTTGATGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttct > 6:209941‑M2/1‑78 (MQ=255) cttcttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctgga > 2:343700‑M2/1‑74 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagc < 5:172550‑M2/149‑77 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTc < 5:76069/114‑1 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTc > 6:76069/1‑114 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCAt > 1:61289/1‑149 (MQ=255) ttGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCg > 2:283240/1‑148 (MQ=255) cagagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcgcttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGAGTTCGAGGTCTCTGGGAACACTGGGCTCATGAAATCCACTACAAGGTCGTCGCAGACAACCATCg > 5:123845‑M2/63‑148 (MQ=255) gagatgccacggtaactttggcttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTTGTCTGCGACgaccatgtagt < 2:303466‑M2/89‑6 (MQ=255) gAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTTGTCTGCGACGACCAtgta < 7:353156/147‑4 (MQ=255) gTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATgg > 5:49432/1‑148 (MQ=255) tCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGaa < 6:49432/149‑1 (MQ=255) cGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAAc < 8:197590/149‑1 (MQ=255) aGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGAGGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgat > 6:172550‑M2/1‑59 (MQ=255) cTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgc < 7:26962‑M2/149‑95 (MQ=255) gtgGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCg < 4:183592/147‑1 (MQ=255) tgGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGa < 2:61289/148‑1 (MQ=255) gTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccga > 7:191914‑M2/1‑49 (MQ=255) gTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcccgccatgatgcgccccga > 8:26962‑M2/1‑49 (MQ=255) ttccaccttgtggtaggtggggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTg > 1:148835‑M2/39‑149 (MQ=255) tGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACGACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGCGCGTTGc > 8:240431/1‑149 (MQ=255) gtttCGATGAGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGTGGGGATGAAGTgtaagggatccatcatccccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctggagccagcgcgccatgatgcgccccgacagcaaa > 6:222026‑M2/1‑43 (MQ=255) gtgtCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCAc > 1:209086/1‑149 (MQ=255) tCGATTCGTCTCTTGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGATGTttaagggatgcatcatacccacattccaaccgtccacctgattcccgatgctgtgctcccgatttctttctgtagccagccgtccatgatgcgccccgacagcaaagt > 2:15629‑M2/1‑40 (MQ=255) tCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGCAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATTGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTc < 7:240431/149‑1 (MQ=255) gATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGt < 1:283240/149‑1 (MQ=255) aTGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTc < 6:123095/149‑1 (MQ=255) gCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCtt > 4:247517/1‑136 (MQ=255) gCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCtt < 3:247517/136‑1 (MQ=255) tCGCTGGAAATACTAGGCTGGGGGGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATtct < 6:265893/149‑1 (MQ=255) gttgggttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCAGGGAACAGTGGGCGCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGGATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCg < 6:123845‑M2/127‑1 (MQ=255) tGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGAt > 7:27027/1‑149 (MQ=255) ggAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCg < 4:163351/116‑1 (MQ=255) ggAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCg > 3:163351/1‑116 (MQ=255) gttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGa < 1:200414‑M2/105‑1 (MQ=255) gttcatggatcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGa > 2:200414‑M2/18‑122 (MQ=255) aCTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCgc > 8:343150/1‑148 (MQ=255) atcggttacGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCgcaaagc > 7:113292‑M2/10‑149 (MQ=255) ggTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCGCAAAGCAAAGaa < 7:343150/149‑1 (MQ=255) gatgaAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCGCAAAGCAAAGAACAt > 4:176525/1‑149 (MQ=255) gatgaAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCGCAAAGCAAAGAACAt > 8:81486/1‑149 (MQ=255) | CCTTCTGGAACAGGCTCTGTGCGACCTTCAGCTCCAGATGGTCAGTGAGCTGCATGTTGGGATCGAAGAAGAAATCTCCGTCCTTCTTGAGGTCCGCAGGGCTTGTGGTCATGGTGTCGATGCGTCGCTGGAAAGACTTGGCTGGGGTGATGAAGTCGTGCTTGGCGGATTTCGAGGTCTCTGGGAACAGTGGGCTCATGAAATCCACTACATGGTCGTCGCAGACAACCATCGCATGGAAACCGGTCTCGGAGCTTTGCACCTCGTCATTCTCGATGCTCGCAAAGCAAAGAACAT > NC_002947/2217481‑2217777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |