New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1458470 | 56 (0.950) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.7% | coding (1128/1458 nt) | algA | mannose‑6‑phosphate isomerase/mannose‑1‑phosphate guanylyltransferase |
? | NC_002947 | = 1458516 | 48 (0.870) | coding (1082/1458 nt) | algA | mannose‑6‑phosphate isomerase/mannose‑1‑phosphate guanylyltransferase |
TCGGCGGTACCGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACCACCACGATGTTCTCCAGGCCGATCACCGA > NC_002947/1458369‑1458661 | tCGGCGGTACCGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACAc < 5:148234‑M2/149‑2 (MQ=255) ggcggTACCGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGACCACCACGGGCGATACActt < 6:204063‑M2/149‑4 (MQ=255) cggTACCGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACActtcc > 5:224274‑M2/1‑144 (MQ=255) gTACCGGATACAACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCAGTCTTGAAGGTGATGTGCTTGACATGGAAGCTGCCGCCCATGTCAACAGAGTCGTAAGAGCCCCACGGGCGATACActtccag < 6:118981‑M2/149‑8 (MQ=255) cGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAggtgg < 1:315048/149‑1 (MQ=255) ccACGATCCAGTGTTCGGCGCTGTGGTTGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGTCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTTCGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTg < 5:118981/148‑1 (MQ=255) ccACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTgg < 8:155746/149‑1 (MQ=255) ccACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTgg < 7:28379/149‑1 (MQ=255) cACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTggg > 5:126816/1‑149 (MQ=255) cACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTggg > 3:343001/1‑149 (MQ=255) cACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACATGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTggg > 5:238035/1‑149 (MQ=255) aGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTg < 6:150936/149‑1 (MQ=255) aGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTg > 5:150936/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCGCGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCt > 8:72826/1‑149 (MQ=255) cgGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTtc < 3:146399/149‑1 (MQ=255) ggtggtggaGCATCTGCAGCGAGATGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACGTGGAAGCTGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACTGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTtcg < 2:52349/149‑1 (MQ=255) gtggtgCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTtcgtc > 4:312231/1‑147 (MQ=255) ggtgCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAgg < 5:116157/149‑1 (MQ=255) gCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAgg < 8:320727/146‑1 (MQ=255) gCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAgg > 7:320727/1‑146 (MQ=255) tGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGAc > 6:35844/1‑149 (MQ=255) gCGTGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAATCGGCCGCCCTTGTCCACCGAGTCGTACGAGCGCCTCGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATc < 6:260444/149‑1 (MQ=255) agagGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGc < 4:343001/149‑1 (MQ=255) gagGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGt > 4:292413/1‑114 (MQ=255) gagGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGt < 3:292413/114‑1 (MQ=255) gagGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTAGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCt < 1:94124/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTg < 3:312231/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGcc < 6:238035/149‑1 (MQ=255) gcCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCt > 1:148859/1‑149 (MQ=255) cccGGCTTGTCGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGATTCGTACGAGCCGCACTGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCTTGCGGCCCTGTTCGTCGAGTGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTg < 5:204063/149‑1 (MQ=255) gACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAcctt < 6:148234/147‑1 (MQ=255) aCGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTc < 8:11598/92‑1 (MQ=255) aCGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTc > 7:11598/1‑92 (MQ=255) gggATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCCCGGAGTCGTACGAGCCCCCCGGGCGATACACTTCCAGGTGGGTCTGGGGTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACGATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtcctt < 8:173044/147‑1 (MQ=255) gTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtcctt > 6:391342/1‑149 (MQ=255) tgCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTggg < 5:35844/148‑1 (MQ=255) tgCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTggg < 2:55472/148‑1 (MQ=255) cTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACActtccaggtcaagcacatcaccgtcaagccgggcgccagcctctcgctgcagatgcaccaccaccgcgccgaacactggatcgtggtatc < 8:54528‑M2/149‑91 (MQ=255) gACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAatc > 6:293844/1‑148 (MQ=255) aCCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACActtccaggtcaagcacatcaccgtcaagccgggcgccagcctctcgctgcagatgcaccaccaccgcgccgaacactggatcgtggtatccgg < 2:78994‑M2/148‑94 (MQ=255) cTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtccttgt < 1:235180/137‑1 (MQ=255) cTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtccttgt > 2:235180/1‑137 (MQ=255) ggAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtcc > 2:283959/1‑131 (MQ=255) ggAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGAccttgtcc < 1:283959/131‑1 (MQ=255) ggAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCAGTGCGGCACTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCAGCTTGACCCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAAacatcaac > 2:365785/1‑147 (MQ=255) ggAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGGCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTCGTCCTTGTGGGCAATCATCATg < 7:57513/149‑1 (MQ=255) gCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCAt > 8:200183/1‑149 (MQ=255) ccACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGac > 7:22901/1‑148 (MQ=255) cACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACActtccaggtcaagcacatcaccgtcaagccgggcgccagcctctcgctgcagatgcaccaccaccgcgccgatcactggatcgtggtatccggtaccgccgaggtgacctgcgacga > 1:78994‑M2/1‑32 (MQ=255) aCCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATg > 8:102912/1‑129 (MQ=255) aCCGAGTCCTACGAGCCACACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCACTGTTAGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCGTCCTTGGTCTCgacgac > 4:36588/1‑149 (MQ=255) cGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGAccacca < 7:72826/149‑1 (MQ=255) cGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGAccacca < 7:200183/149‑1 (MQ=255) gAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGGTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACcaccac < 5:391342/149‑1 (MQ=255) ccACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACCACCACGATGTTCTCCAGGc < 5:293844/149‑1 (MQ=255) gggCGATACACTTCCAGGTTGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACCACCTCGATGTTCTCCAGGCCGAt > 2:213036/1‑149 (MQ=255) acacTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACCACCACGATGTTCTCCAGGCCGATCACCGa > 7:33850/1‑148 (MQ=255) | TCGGCGGTACCGGATACCACGATCCAGTGTTCGGCGCGGTGGTGGTGCATCTGCAGCGAGAGGCTGGCGCCCGGCTTGACGGTGATGTGCTTGACCTGGAAGCGGCCGCCCATGTCCACCGAGTCGTACGAGCCCCACGGGCGATACACTTCCAGGTGGTTCTGGGTTTCCGTGCGGCCCTGTTCGTCGAGGGTCTTGACCATCTGCTTGACGCCCTGGACCTTGTCCTTGTGGGCAATCATCATGGCATCCTTGGTCTCGACCACCACGATGTTCTCCAGGCCGATCACCGA > NC_002947/1458369‑1458661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |