New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2942041 | 56 (0.950) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 7.1% | coding (159/474 nt) | PP_2575 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2942061 | 51 (0.910) | coding (139/474 nt) | PP_2575 | hypothetical protein |
GTCACCCACCCGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACA > NC_002947/2941915‑2942205 | gTCACCCACCCGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTgg > 7:74451‑M2/1‑147 (MQ=255) tCACCCACCCGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggc < 2:194225‑M2/149‑4 (MQ=255) cccacccGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgac > 2:265491‑M2/1‑143 (MQ=255) cccacccGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgac > 4:109572‑M2/1‑143 (MQ=255) ggTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTg < 7:300980/149‑1 (MQ=255) tCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGc > 7:207148/1‑148 (MQ=255) aCAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCg > 1:326721/1‑149 (MQ=255) cAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGGCATCgg > 3:264084/1‑148 (MQ=255) aaCTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGtt < 8:258377/149‑1 (MQ=255) gTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGatat > 8:118163/1‑149 (MQ=255) tGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAg > 2:332639/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGtt > 5:385707/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCa < 3:59981/149‑1 (MQ=255) gCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATct > 6:386770/1‑149 (MQ=255) cgcgCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTAt < 7:9659/120‑1 (MQ=255) cgcgCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTAt > 8:9659/1‑120 (MQ=255) gcgcACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATctgct > 2:195769/1‑149 (MQ=255) cgcACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATctgctg < 7:118163/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGtt > 5:254751/1‑125 (MQ=255) aCCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGtt < 6:254751/125‑1 (MQ=255) gcCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGc < 2:326721/149‑1 (MQ=255) cTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGccc < 1:332639/149‑1 (MQ=255) cTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGccc < 1:195769/149‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCt < 7:30878/147‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGCCTGCTCTGGCCCtt < 7:99826/148‑1 (MQ=255) cAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGACTGCTCTGGCCCtt > 8:99826/1‑148 (MQ=255) cggcggcggCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggc < 3:194180‑M2/88‑4 (MQ=255) cggcggcggCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggc > 4:194180‑M2/1‑85 (MQ=255) cggcggcggCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGc < 8:207148/149‑1 (MQ=255) ccgcggcACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGcac > 6:369949/3‑148 (MQ=255) gCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTgcgc > 5:229179/1‑149 (MQ=255) gCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTg < 3:374166/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTgg < 5:120876/149‑1 (MQ=255) aCCGCGACCCCGGCCACCGACAGGGGGGGCGCTGGACGTCGCCGGGCCGGTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGCTATCCAGTTGCAGCTGCTGGCTGCTCTGGCCCtt < 5:72743/120‑1 (MQ=255) aCCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCGGGCCCtt > 6:72743/1‑120 (MQ=255) ccGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGggcggc > 2:157769/1‑149 (MQ=255) ccGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGAACCACCGACTGCGCCTGggcggc > 8:169953/1‑149 (MQ=255) cgcgAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGcc < 1:157769/149‑1 (MQ=255) cgAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGAc > 4:210388/1‑132 (MQ=255) cgAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGAc < 3:210388/132‑1 (MQ=255) cgAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGa < 5:386770/149‑1 (MQ=255) gAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAt < 2:45643/149‑1 (MQ=255) aaCCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAtg < 1:194225/149‑1 (MQ=255) cccGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGGATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAtgct < 1:272073/149‑1 (MQ=255) ggCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGACTGGGCGGCCGAtgctgc > 5:164064/1‑148 (MQ=255) cACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCTGTTGCATCTGCTGGCTGAAATAGCCCATGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGTTGCGca > 1:122629/1‑148 (MQ=255) aCCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGca > 5:91168/1‑147 (MQ=255) ccGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCAcag < 5:383863/149‑1 (MQ=255) cGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCa > 7:215986/1‑75 (MQ=255) cGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCa < 8:215986/75‑1 (MQ=255) gACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAtgctgctgtgcg > 2:173143/1‑141 (MQ=255) ggACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgacgtccagcgacccccatgtcggtggccgggttcgcggtgcagctgcgggtgccgccgccggtgctgtaggcgcgcaggtgcgcggcaaccagcatgacgagtt > 7:270319‑M2/1‑30 (MQ=255) ggACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgacgtccagcgacccccatgtcggtggccgggttcgcggtgcagctgcgggtgccgccgccggtgctgtaggcgcgcaggtgcgcggcaaccagcatgacgagtt < 8:270319‑M2/138‑109 (MQ=255) gACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgacgtccagcgacccccatgtcggtggccgggttcgcggtgcagctgcgggtgccgccgccggtgctgtaggcgcgcaggtgcgcg > 1:110558‑M2/1‑29 (MQ=255) gACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTggcgacgtccagcgacccccatgtcggtggccgggttcgcggtgcagctgcgggtgccgccgccggtgctgtaggcgcgcaggtgcgcg < 2:110558‑M2/118‑90 (MQ=255) gACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACt > 6:357547/1‑149 (MQ=255) tCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCAc > 7:288358/1‑149 (MQ=255) tCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCAc < 6:164064/149‑1 (MQ=255) gccgtgccgtTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGt > 6:165212/1‑149 (MQ=255) cGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATg < 5:165212/149‑1 (MQ=255) ggCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAtgctg > 8:106438/1‑104 (MQ=255) ggCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGAtgctg < 7:106438/104‑1 (MQ=255) ggCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATgg < 6:229179/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGcaca < 7:169953/149‑1 (MQ=255) | GTCACCCACCCGGTCATACAACTCGTCATGCTGGTTGCCGCGCACCTGCGCGCCTACAGCACCGGCGGCGGCACCCGCAGCTGCACCGCGAACCCGGCCACCGACATGGGGGTCGCTGGACGTCGCCGTGCCGTTTGCGGCATTGGTGGCGACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACA > NC_002947/2941915‑2942205 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |