New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4904213 | 61 (1.030) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.1% | coding (621/663 nt) | PP_4312 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4904245 | 54 (0.970) | coding (589/663 nt) | PP_4312 | hypothetical protein |
ACCACCGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCGTGTAGATGGT > NC_002947/4904097‑4904392 | accaccGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATc < 8:207774/149‑1 (MQ=255) ccaccGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCg < 6:105764‑M2/149‑2 (MQ=255) ccaccGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCg > 8:328059‑M2/1‑148 (MQ=255) caccGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgc < 6:92035‑M2/149‑3 (MQ=255) ccGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGAGCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgcgc > 3:264360‑M2/1‑145 (MQ=255) aTCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgcgccag > 5:111778‑M2/1‑142 (MQ=255) aCCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTc < 1:79886/149‑1 (MQ=255) ccGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGt > 8:233896/1‑147 (MQ=255) cGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAg > 8:190015/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGt > 3:229437/1‑148 (MQ=255) gctgctTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATa < 1:210567/149‑1 (MQ=255) aTCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGTGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAgg > 5:390273/1‑149 (MQ=255) aTCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAAt < 4:256073/133‑1 (MQ=255) aTCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAAt > 3:256073/1‑133 (MQ=255) aTCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCg > 3:156661/1‑148 (MQ=255) aTCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCg > 2:262611/1‑148 (MQ=255) tCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGaa < 7:190015/149‑1 (MQ=255) tCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGaa < 2:135761/149‑1 (MQ=255) cccTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCTGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAg > 8:97204/1‑149 (MQ=255) cccTGTACCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAg > 2:71593/1‑149 (MQ=255) gcTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCACGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATAc < 4:144874/131‑1 (MQ=255) cTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATc < 6:24126/110‑1 (MQ=255) cTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATc > 5:24126/1‑110 (MQ=255) cTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAAt < 8:214531/129‑1 (MQ=255) cTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAAt > 7:214531/1‑129 (MQ=255) tGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCt > 5:46093/1‑149 (MQ=255) ggCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTcgccg > 2:93351/1‑149 (MQ=255) ggCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTcgccg > 8:334538/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTcc < 4:156661/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTc < 8:227669/147‑1 (MQ=255) ccTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTc < 5:105764/147‑1 (MQ=255) aaaCAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCg < 1:71593/149‑1 (MQ=255) aaCAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCgg < 4:229437/149‑1 (MQ=255) aGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGa < 5:92035/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCAc > 3:131463/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCGTCGGTGATCAcc > 2:275405/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCAcc > 8:37058/1‑149 (MQ=255) gCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCg > 3:119179/1‑149 (MQ=255) gATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTAGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGctc > 8:259507/1‑149 (MQ=255) ggCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAgg < 6:46093/149‑1 (MQ=255) ggCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAgg < 2:84068/149‑1 (MQ=255) gCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAggg > 5:188943/1‑149 (MQ=255) cTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCtt > 1:132308/1‑149 (MQ=255) aTGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTc < 8:215155/109‑1 (MQ=255) aTGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTc > 7:215155/1‑109 (MQ=255) cgcACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCg < 1:262611/148‑1 (MQ=255) cGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGCCTGGCTTTGCCATCCCGCCAGGTCAGGGTCAAAACGTAGAGGGTCTCGAACTCTTCGCCGCTCCACTCATAGGTCATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACg > 1:204718/1‑149 (MQ=255) tCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGgt > 5:144386/1‑149 (MQ=255) aTTCATGACCTGTCGCAAATTGCGTCTCAGCAGGCTTGATTTGACATCGCGCCAGGTCAGTGTCAATACGTAGAGGTTGTAGAAGAATTCTCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTACTACCCCAGGGCAGTGCCGGCCACTgtgt > 2:290896/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGgtgt < 7:334538/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGtt < 7:37058/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgcgccagggcctgaatgacggtgcgcatagctgcccgacctgatccgctggtactgtttggcaaggaagccggaacagggatgagcgatgaagcagcgggtaa < 8:107648‑M2/149‑104 (MQ=255) aGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGAt > 7:336110/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGctcctc > 1:58473/1‑117 (MQ=255) gCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGctcctc < 2:58473/117‑1 (MQ=255) gCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCa < 2:132308/149‑1 (MQ=255) cccTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAg > 5:178636/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgcgccagggcctgaatgacggtgcgcatagctgcccgacctgatccgctggtactgtttggcaaggaagccggaacagggatgagcgatgaagcagcgggtaacggtgat < 3:264639‑M2/149‑111 (MQ=255) gcgcACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTc < 7:233896/147‑1 (MQ=255) caTTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCgcgccagggcctgaatgacggtgcgcatagctgcccgacctgatccgctggtactgtttggcaaggaagccggaacagggatgagcgatgaagcagcgggtaacggtgatcggtggtg > 7:107648‑M2/1‑31 (MQ=255) gCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAg < 7:97204/148‑1 (MQ=255) cGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGcc > 7:64122/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGt < 6:390273/149‑1 (MQ=255) agcagGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGTCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTgg < 4:119179/147‑1 (MQ=255) gcagGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGAc < 7:259507/149‑1 (MQ=255) ggctTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCg > 4:157211/1‑149 (MQ=255) gctTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCgt < 6:144386/149‑1 (MQ=255) tttGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGACTTGCCGGCCACGgtgt > 3:265028/1‑110 (MQ=255) agaTCGCTCCAGTTCAGGTTCAATACGTAGAGGGTCGCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTACTCGGTGATCTCCCTCTCCTCCCACAGGGCCTTGACTGCCACGGTGTTGATCATTTCCGGCAGGTAGCCGTTGGACCAGTCCGTGTAGa < 1:290896/146‑1 (MQ=255) cATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGGCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAg < 8:103543/137‑1 (MQ=255) cATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAg > 7:103543/1‑137 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTcg > 3:96990/1‑46 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTcg < 4:96990/46‑1 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTg < 1:100729/129‑1 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTg > 2:100729/1‑129 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCGTGTAGATgg > 5:86119/1‑149 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCGTGTAGATgg > 6:355281/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCGTGTAGATGGt > 6:72229/1‑149 (MQ=255) | ACCACCGATCACCGTTACCCGCTGCTTCATCGCTCATCCCTGTTCCGGCTTCCTTGCCAAACAGTACCAGCGGATCAGGTCGGGCAGCTATGCGCACCGTCATTCAGGCCCTGGCGCACATTGCGGCTCAGCAGGCTGGCTTTGCCATCGCGCCAGGTCAGGGTCAATACGTAGAGGGTGTCGAAGTCTTCGCCGCTCCAGTCCTCGGTGATCACCCGCTCCTCCCCCAGGGCCTTGCCGGCCACGGTGTTGATCAGTTCCGGCAGGTAGCCGTGGGACCAGGCCGTGTAGATGGT > NC_002947/4904097‑4904392 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |