New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5213292 = | 68 (1.150) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 5.3% | coding (420/1182 nt) | PP_4594 | cystathionine gamma‑synthase |
? | NC_002947 | 5213361 = | 44 (0.800) | coding (351/1182 nt) | PP_4594 | cystathionine gamma‑synthase |
ACACCGCCTTGATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTCCAAGGCAGCGA > NC_002947/5213213‑5213509 | acacCGCCTTGATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCgg > 2:181370/1‑149 (MQ=255) gagctgctgcccaaggatgcccacgtggtggtgatgaacggcgtgtacggtggcacgttccgcatcatggaagattacCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCgg > 4:235977‑M1/79‑148 (MQ=255) cTTGATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCtt > 5:5593/1‑149 (MQ=255) gATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTcc < 3:150129/148‑1 (MQ=255) gATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCa > 2:261964/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCatgat > 6:146487/1‑149 (MQ=255) gACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCTGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGc > 8:55354/1‑149 (MQ=255) tgTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAAc < 6:5593/148‑1 (MQ=255) gTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACg > 4:356647/1‑149 (MQ=255) gcaACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACCGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGAGGTGGTCAGCCCCGAGCTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCa > 4:43203/1‑149 (MQ=255) ggTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTac < 1:221279/149‑1 (MQ=255) tCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCCGGGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCAACCGTACACGcc > 1:237911/1‑149 (MQ=255) cGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGGGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGt < 4:298337/149‑1 (MQ=255) ggCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGt < 1:261964/148‑1 (MQ=255) gCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtc < 8:5260/149‑1 (MQ=255) gACTCGCTCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtca > 6:34462/1‑148 (MQ=255) gACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtcat < 5:146487/149‑1 (MQ=255) aCTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtcatc < 5:34462/149‑1 (MQ=255) aCTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtcatc < 3:356647/149‑1 (MQ=255) tCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATcac > 3:46575/1‑149 (MQ=255) aTCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATcaccac > 7:362039/1‑149 (MQ=255) cAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATcac > 7:362988/1‑143 (MQ=255) cAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGATACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATcac < 8:362988/143‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTgg < 7:141688/149‑1 (MQ=255) ggTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATc < 4:46575/147‑1 (MQ=255) tttCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtc < 2:236071/125‑1 (MQ=255) tttCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtc > 1:236071/1‑125 (MQ=255) ggCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGgcag > 3:204791/1‑149 (MQ=255) tCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCa > 2:161242/1‑98 (MQ=255) ccgcagccgcacctcggggctgaccaccacctatgtcgatctcaacgacattgaagccgtagcggctgcgGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTc > 4:235977‑M2/71‑148 (MQ=255) cgcagccgcacctcggggctgaccaccacctatgtcgatctcaacgacattgaagccgtagcggctgcgGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCaa > 7:18506‑M2/70‑149 (MQ=255) GCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTGCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACGACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCaa > 2:237911‑M1/1‑148 (MQ=255) gCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTtc > 6:186685/1‑99 (MQ=255) cAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCa > 5:21787/1‑149 (MQ=255) cAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTCGTGGACAGCCACGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGAGGAACGTGCCACAGAACACGACGATCATCACCACCACGTGCGCATCCTTCGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCa > 8:96639/1‑149 (MQ=255) aTGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCAtt > 7:289220/1‑149 (MQ=255) accaccacctatgtcgatctcaacgacattgaagccgtagcggctgcgGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGa < 8:18506‑M2/101‑1 (MQ=255) tCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGa < 8:289220/148‑1 (MQ=255) cGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGAc < 8:362039/148‑1 (MQ=255) gTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGc > 2:231314/1‑127 (MQ=255) gTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGc < 1:231314/127‑1 (MQ=255) ttGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTcc > 8:21477/1‑149 (MQ=255) agaTCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAACTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGa < 3:43203/149‑1 (MQ=255) tCGACATAGGTGGTGGGCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATGCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGgc < 1:280933/149‑1 (MQ=255) cATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAg < 1:181370/149‑1 (MQ=255) tAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATTCGGAACGGGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGc < 7:158549/149‑1 (MQ=255) tAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCCAGCACGGTTGCGGTGGCATTGCCTCCCGAGCCGCCGGc > 4:232588/1‑149 (MQ=255) ggtCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAgcgc > 7:100947/1‑149 (MQ=255) gtCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAg < 8:99805/138‑1 (MQ=255) gtCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAg > 7:99805/1‑138 (MQ=255) gTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCttcttc > 1:133297/1‑149 (MQ=255) cggctgcgGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTcc > 3:178340‑M2/9‑147 (MQ=255) gctgcgGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTCCAAgg > 5:150482‑M2/7‑149 (MQ=255) gGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTCCAAGGCAGc > 1:163436‑M2/2‑148 (MQ=255) gTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTCCAAGGCAGCGa < 4:178340/149‑1 (MQ=255) | ACACCGCCTTGATGTCGACCAGGTGCAGCAACGGGTTGGTCGGCGACTCGATCCAGATCAGCTGGGTTTCC‑GGCTTGATCGCAGCCGCTACGGCTTCAATGTCGTTGAGATCGACATAGGTGGTGGTCAGCCCCGAGGTGCGGCTGCGGTAATCTTCCATGATGCGGAACGTGCCACCGTACACGCCGTTCATCACCACCACGTGGGCATCCTTGGGCAGCAGCTCAAGCACGGTTGCGGTGGCATTGACTCCCGAGGCGCAGGCCACAGCGCCCACGCCTTCTTCCAAGGCAGCGA > NC_002947/5213213‑5213509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |