| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5875315 | 74 (1.250) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 4.2% | coding (856/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
| ? | NC_002947 | = 5875360 | 64 (1.110) | coding (811/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCGGCAGC > NC_002947/5875217‑5875508 | ggCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcg < 1:164044/148‑1 (MQ=255) gCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtc < 1:168746/149‑1 (MQ=255) cacaTGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtcg > 7:135188/1‑148 (MQ=255) cacaTGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgtcg > 7:129920/1‑148 (MQ=255) cgcAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATc > 5:338108/1‑149 (MQ=255) gcAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATcc > 8:78005/1‑149 (MQ=255) ggCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCtt > 3:345249/1‑148 (MQ=255) gATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGAtt > 1:222622/1‑149 (MQ=255) gCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCAt < 5:78509/148‑1 (MQ=255) aCCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTAtcgt < 2:245122/113‑1 (MQ=255) ggAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTAc > 8:240796/1‑149 (MQ=255) gAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGAt < 2:201792/125‑1 (MQ=255) gAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGAt > 1:201792/1‑125 (MQ=255) gAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACt < 8:344702/149‑1 (MQ=255) gTCGATGGCCACCGAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGa > 7:28588/1‑149 (MQ=255) gATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGa > 1:93263/1‑131 (MQ=255) gATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGa < 2:93263/131‑1 (MQ=255) gATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACa < 4:109247/148‑1 (MQ=255) aTGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACa < 1:324923/147‑1 (MQ=255) tGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCTGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGt > 7:218026/1‑148 (MQ=255) tGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTg < 5:72107/149‑1 (MQ=255) gCCCCCACGGTGTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCCGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTTATTGGTgcg < 8:6823/123‑1 (MQ=255) gCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTgcg > 7:6823/1‑123 (MQ=255) caccaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgacga < 6:338108/149‑1 (MQ=255) accaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgacgac < 8:335174/149‑1 (MQ=255) ccaAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACt < 6:49307/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTcc < 1:186991/149‑1 (MQ=255) cGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTggcgg < 2:222622/149‑1 (MQ=255) gCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgacga < 1:162380/128‑1 (MQ=255) gCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTgacga > 2:162380/1‑128 (MQ=255) gCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTCATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACATCGTCAACATCGTggcgg > 3:212957/1‑148 (MQ=255) ccGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCa < 5:150501/149‑1 (MQ=255) cGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAg < 8:28588/149‑1 (MQ=255) tataGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGat < 6:130043/149‑1 (MQ=255) taGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGatat < 4:376942/149‑1 (MQ=255) gACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAg < 1:244647/148‑1 (MQ=255) gACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTAATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAgg < 3:151054/149‑1 (MQ=255) aCGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACACGGTGGCGGCAGATATCGAAGgt < 7:240796/149‑1 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCcac > 1:152430/1‑119 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCcac < 2:152430/119‑1 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTggcggc < 1:202177/130‑1 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTggcggc > 2:202177/1‑130 (MQ=255) ttcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTg < 8:135188/149‑1 (MQ=255) tcttGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgtgg < 7:286562‑M2/149‑98 (MQ=255) cttGATGCCCGCCACTCCCAGCGCGCCAGCAGGCGCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTg < 8:129920/147‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCt > 5:181351/1‑64 (MQ=255) aTGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCt < 6:181351/64‑1 (MQ=255) gCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgtggccgaacg < 7:189629‑M2/149‑105 (MQ=255) ccccccACACCCCGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCt < 8:138648/148‑1 (MQ=255) cccGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTGGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTg > 1:214554/1‑149 (MQ=255) ccGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTgc > 6:16124/1‑149 (MQ=255) cGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTatcaagaagtacgtcgagctatacggcgtcagcggccagaccttggtggccatcgactccggtgccaacgtcaatttcgatcgcctgcgccatgtggccgaacgtgc > 8:286562‑M2/1‑42 (MQ=255) cAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGc < 4:341256/131‑1 (MQ=255) cAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGc > 3:341256/1‑131 (MQ=255) aGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGcgccaccgccac > 1:171332/1‑149 (MQ=255) gcagGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGc < 7:78005/149‑1 (MQ=255) ccgCTCGATCACCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCg > 4:201768/3‑148 (MQ=255) agGCGCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATCTCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGc < 4:231010/147‑1 (MQ=255) ggtCGGTGATCGAGCGGGTATCGTGGTAGATTTCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATGGGTACTGATAGTGTCGACTTCGTCCACATGGTGGCGGGAGTTATCGAAGTTGTGCTGTCCAATCTGCGCGACCGGCATGGCATCGGCGAAc < 4:212957/147‑1 (MQ=255) gCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACcgccacgc < 1:141205/138‑1 (MQ=255) gCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACcgccacgc > 2:141205/1‑138 (MQ=255) cTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACa < 5:16124/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAg > 7:8464/1‑149 (MQ=255) tCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAg > 4:285769/1‑149 (MQ=255) tGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCg < 3:285769/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGAc < 1:5165/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGAc > 2:5165/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCt > 4:53334/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAg < 5:165630/87‑1 (MQ=255) gAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAg > 6:165630/1‑87 (MQ=255) gAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTg > 4:329933/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGc < 8:218026/149‑1 (MQ=255) cGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCgg < 2:214554/149‑1 (MQ=255) ggTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCgg > 1:109234/1‑147 (MQ=255) gTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGcc < 3:118633/101‑1 (MQ=255) gTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGcc > 4:118633/1‑101 (MQ=255) gTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCGgcag > 8:278643/1‑149 (MQ=255) tATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCGgcagc < 2:109234/149‑1 (MQ=255) | GGCCACATGGCGCAGGCGATCGAAATTGACGTTGGCACCGGAGTCGATGGCCACCAAGGTCTGGCCGCTGACGCCGTATAGCTCGACGTACTTCTTGATGCCCGCCACACCCAGCGCGCCAGCAGGCTCGGTGATCGAGCGGGTATCGTCGTAGATATCCTTGATTGCTGCGCAGATTTCATCGGTACTGACAGTGACGACTTCGTCCACATGGTGGCGGCAGATATCGAAGGTGTGCTGGCCAATCTGCGCCACCGCCACGCCATCGGCGAACAGCCCGACCTGCGGCAGC > NC_002947/5875217‑5875508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |