New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5989280 | 64 (1.080) | 3 (0.060) | 3/228 | NT | 5.7% | noncoding (29/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
? | NC_002947 | = 5989327 | 42 (0.800) | noncoding (76/87 nt) coding (38/399 nt) |
PP_mr64 PP_5247 |
C4 ncRNA hypothetical protein |
GGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCA > NC_002947/5989179‑5989475 | gggAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCAccc > 6:56234/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgca < 6:192073‑M2/149‑7 (MQ=255) gCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgca > 3:97131‑M2/1‑143 (MQ=255) tctctAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactg < 6:155988‑M2/149‑13 (MQ=255) gCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCtt < 8:354238/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTg < 8:77076/148‑1 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt > 8:124008/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt < 7:124008/149‑1 (MQ=255) ggTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtgg > 1:187005/1‑149 (MQ=255) ggTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtgg < 8:170771/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGtt < 5:192073/149‑1 (MQ=255) cGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt > 5:82892/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAgct < 5:155988/149‑3 (MQ=255) gATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGtt < 5:87258/149‑1 (MQ=255) cGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCa < 5:56234/148‑1 (MQ=255) tgtgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGTCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCt < 3:250272/149‑1 (MQ=255) gtgGNAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACAGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 5:209633/1‑149 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTgg < 8:97359/149‑1 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTgg < 4:56564/149‑1 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg < 1:365007/148‑1 (MQ=255) aaaCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGgag > 7:274172/1‑148 (MQ=255) cGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGaa < 2:187005/149‑1 (MQ=255) tgatgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCa < 2:131851/149‑1 (MQ=255) atgaAGGGCTTCCTTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTTCGTGTAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAt < 3:359734/142‑1 (MQ=255) atgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGATGACGTTTGTCCTAAAGGCTTTCCTTCTCACCGGTTTTCAACCCCGAGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAAAGGGTGGATGCAGTTAAATACTGGAGAAGGAAttagatgc > 4:359734/1‑143 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 8:274172/149‑1 (MQ=255) gggCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCAACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaa > 7:7854/1‑146 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGAGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc > 3:111234/1‑149 (MQ=255) gTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACAGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTcc < 6:209633/149‑1 (MQ=255) aTGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTcccc > 6:200511/1‑148 (MQ=255) tGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCg < 8:278746/148‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCg > 7:278746/1‑148 (MQ=255) aGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgaccgcgacctggtcagcctagagag < 8:344655‑M2/149‑92 (MQ=255) gtgCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagctgg < 5:249316‑M2/149‑96 (MQ=255) gtgCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCAcccc > 1:375209/1‑149 (MQ=255) ccGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAAcacca < 6:82892/149‑1 (MQ=255) gCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACg > 5:83722/1‑149 (MQ=255) cTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagctggctttccccggacaatcagacg > 7:344655‑M2/1‑33 (MQ=255) cTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGa < 6:355546/104‑1 (MQ=255) aCCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGctct > 2:209472/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACAGCCGCCTCCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGctct > 1:156597/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGa < 4:84793/117‑1 (MQ=255) ccGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGa > 3:84793/1‑117 (MQ=255) ccTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAAcacca > 6:283994/1‑129 (MQ=255) ccTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAAcacca < 5:283994/129‑1 (MQ=255) cACCGGTTTTCCACCCCGCACACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGATTTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCACCACCCCACAACGCTCATTCAGCCGCTGCGAt > 3:49929/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATg > 3:99547/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGcc > 8:257960/1‑149 (MQ=255) ttttCCACGCCGCTCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGATACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGc < 8:7854/149‑1 (MQ=255) ttCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTCCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGcc < 2:156597/148‑1 (MQ=255) cACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCAccc < 5:128153/99‑1 (MQ=255) cACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCAccc > 6:128153/1‑99 (MQ=255) cACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATcc > 1:223344/1‑149 (MQ=255) aCCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATccc < 2:375209/149‑1 (MQ=255) ccGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCa > 3:44106/1‑149 (MQ=255) ccGCACACAACTGCCGCCTTCAGCGTGGAAACGGGTGGTTGCTTTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCa < 4:49929/149‑1 (MQ=255) | GGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCA > NC_002947/5989179‑5989475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |